More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1833 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1833  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  504  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.214744 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5529  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.75 
 
 
258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.151881 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4522  chromosome partitioning ATPase  42.26 
 
 
303 aa  195  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02865  putative ParA family protein  34.5 
 
 
254 aa  99.4  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.827974  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3388  hypothetical protein  32.23 
 
 
329 aa  99.4  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.853943  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.84 
 
 
263 aa  99  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.329595  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3045  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.84 
 
 
263 aa  99  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.84 
 
 
263 aa  99  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2913  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.84 
 
 
263 aa  99  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.54 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.93 
 
 
284 aa  97.1  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.23 
 
 
263 aa  96.3  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.23 
 
 
263 aa  95.5  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.03 
 
 
268 aa  95.1  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.53 
 
 
255 aa  94.7  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  30.14 
 
 
258 aa  95.1  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  33.94 
 
 
258 aa  94.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.67 
 
 
263 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1372  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.67 
 
 
263 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.167062 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.15 
 
 
253 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.67 
 
 
263 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.018865 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2274  ParA family protein  36.09 
 
 
263 aa  93.6  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3204  ParA family protein  35.09 
 
 
263 aa  92.8  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.97 
 
 
253 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.97 
 
 
253 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.97 
 
 
253 aa  91.7  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  32.97 
 
 
253 aa  91.7  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.97 
 
 
253 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.97 
 
 
253 aa  91.7  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.97 
 
 
253 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.97 
 
 
253 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.26 
 
 
255 aa  91.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  32.97 
 
 
253 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13239  hypothetical protein  32.4 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.614127  normal  0.5818 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.43 
 
 
253 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.68 
 
 
270 aa  91.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  33.12 
 
 
249 aa  90.9  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2365  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.72 
 
 
256 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.909103  normal  0.144806 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.5 
 
 
284 aa  90.5  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1526  parA family protein  31.18 
 
 
262 aa  90.1  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429591  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  34.32 
 
 
255 aa  90.5  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1345  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.71 
 
 
262 aa  90.1  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  30.81 
 
 
257 aa  90.1  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  33.15 
 
 
268 aa  89.7  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
263 aa  89.7  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1789  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.7 
 
 
264 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247276  normal  0.400701 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1407  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.97 
 
 
267 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1467  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.49 
 
 
274 aa  89.4  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.162034  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0277  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.73 
 
 
254 aa  88.6  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.287869  normal  0.696383 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  30.34 
 
 
264 aa  88.6  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.18 
 
 
264 aa  89  8e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0019  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.44 
 
 
250 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.56 
 
 
254 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.787744  normal  0.0588103 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0990  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.27 
 
 
265 aa  87.8  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37153  normal  0.791697 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  26.94 
 
 
259 aa  87.4  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.12 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.76 
 
 
259 aa  87.4  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1423  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.6 
 
 
328 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854251  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4678  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.75 
 
 
267 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993482  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.34 
 
 
278 aa  87.8  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.89 
 
 
253 aa  87.8  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.73 
 
 
253 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  26.94 
 
 
259 aa  86.7  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1532  SpoOJ regulator protein  31.87 
 
 
260 aa  86.7  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0022  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.35 
 
 
257 aa  86.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.695943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3043  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.75 
 
 
263 aa  86.3  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.025517 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B12  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  32.65 
 
 
253 aa  86.3  4e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.042281  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.35 
 
 
254 aa  86.7  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0113  chromosome segregation ATPase  32.93 
 
 
256 aa  86.3  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3421  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.96 
 
 
257 aa  86.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.786634  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  33.53 
 
 
262 aa  86.3  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.9 
 
 
262 aa  85.5  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.86 
 
 
263 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1028  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.74 
 
 
250 aa  85.5  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  30.86 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.67 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  31.71 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.14 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2157  putative plasmid partitioning protein  35.96 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.77 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.91 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3666  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.8 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1968  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.14 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  31.93 
 
 
263 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1384  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.49 
 
 
263 aa  84  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.33 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0188  chromosome partitioning protein ParA  27.8 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.93 
 
 
263 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1856  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.29 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.204496  normal  0.925256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6365  chromosome partitioning protein Soj  29.88 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.33 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2477  conjugal plasmid transfer ATPase  34.62 
 
 
256 aa  84  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.826967  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0359  sporulation initiation inhibitor protein soj  32.42 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00437391  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.33 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.33 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.75 
 
 
317 aa  84  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.9 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  29.88 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.78 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.02 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>