More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1856 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1856  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 		 260 aa  518  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.204496  normal  0.925256 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00028  chromosome partioning protein  77.31 
 
 		 260 aa  418  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.287581  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1526  parA family protein  45.31 
 
 		 262 aa  223  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429591  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0990  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.49 
 
 		 265 aa  219  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37153  normal  0.791697 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3421  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.24 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.786634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  43.43 
 
 		 258 aa  217  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02865  putative ParA family protein  46.61 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.827974  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1384  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.92 
 
 		 263 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1986  ParA family protein  46.72 
 
 		 262 aa  215  7e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3430  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.72 
 
 		 262 aa  214  8e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.41 
 
 		 265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1345  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.25 
 
 		 262 aa  211  9e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1570  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.31 
 
 		 262 aa  209  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601038  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.64 
 
 		 262 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4334  ParA family protein  46.64 
 
 		 262 aa  208  9e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.873064  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1533  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.64 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.344504 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.5 
 
 		 263 aa  205  5e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.71 
 
 		 263 aa  205  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1372  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.71 
 
 		 263 aa  205  5e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.167062 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  40.24 
 
 		 259 aa  205  7e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.92 
 
 		 263 aa  204  8e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.018865 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3864  putative plasmid partitioning protein  43.53 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  40.24 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.41 
 
 		 263 aa  203  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.32 
 
 		 284 aa  203  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45520  putative plasmid partitioning protein  43.53 
 
 		 262 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.922179 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  39.44 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3043  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.32 
 
 		 263 aa  203  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.025517 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3204  ParA family protein  40.32 
 
 		 263 aa  202  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2798  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.53 
 
 		 262 aa  201  8e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.519748  normal  0.161878 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3660  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.66 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1968  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.06 
 
 		 265 aa  199  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2274  ParA family protein  39.76 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.34 
 
 		 263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.34 
 
 		 263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.329595  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3045  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.34 
 
 		 263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2913  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.34 
 
 		 263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1205  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.25 
 
 		 264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.53 
 
 		 263 aa  198  9e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2157  putative plasmid partitioning protein  44.09 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1182  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.09 
 
 		 268 aa  188  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.14884 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1641  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.53 
 
 		 263 aa  188  9e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3025  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.22 
 
 		 259 aa  169  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1153  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.43 
 
 		 258 aa  155  7e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.488153  normal  0.157692 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.54 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.07 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.71944  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0777  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.3 
 
 		 257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.66 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  34.57 
 
 		 258 aa  145  6e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.92 
 
 		 270 aa  143  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  34.25 
 
 		 256 aa  142  6e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.2 
 
 		 255 aa  142  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  35.27 
 
 		 253 aa  142  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  35.27 
 
 		 253 aa  142  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  35.27 
 
 		 253 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  35.27 
 
 		 253 aa  142  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  35.27 
 
 		 253 aa  142  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  35.27 
 
 		 253 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  35.27 
 
 		 253 aa  142  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  35.27 
 
 		 253 aa  142  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  35.27 
 
 		 253 aa  141  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.85 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0052  sporulation initiation inhibitor protein Soj family protein  36.65 
 
 		 323 aa  139  3e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  30.77 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  31.56 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  31.56 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.85 
 
 		 253 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  34.27 
 
 		 254 aa  138  8.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.85 
 
 		 253 aa  137  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4199  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.1 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000176763 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.45 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.39 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  31.54 
 
 		 256 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.75 
 
 		 262 aa  136  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  38.43 
 
 		 330 aa  136  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  32.31 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0307  hypothetical protein  31.37 
 
 		 262 aa  135  7.000000000000001e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.285877 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.2 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  30.71 
 
 		 258 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  32.78 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.2 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.14 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2519  ParA family protein  34.02 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  34.96 
 
 		 270 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.16 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1276  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.61 
 
 		 317 aa  133  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  33.07 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  34.84 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.48 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6481  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.5 
 
 		 314 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.7 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0167  chromosome segregation ATPase  34.14 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  34.39 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1574  ParA family protein  38.11 
 
 		 258 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0302854  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.26 
 
 		 254 aa  132  5e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1217  ParA family protein  31.6 
 
 		 280 aa  132  5e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.02 
 
 		 265 aa  132  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.68 
 
 		 303 aa  132  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  34.63 
 
 		 264 aa  132  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>