More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0777 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0777  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
257 aa  522  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1153  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  77.56 
 
 
258 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.488153  normal  0.157692 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  65.23 
 
 
258 aa  361  5.0000000000000005e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.71944  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1574  ParA family protein  70.87 
 
 
258 aa  357  7e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0302854  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3421  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.34 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.786634  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3043  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.29 
 
 
263 aa  192  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.025517 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  42.35 
 
 
319 aa  191  8e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  38.28 
 
 
256 aa  191  8e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1968  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.13 
 
 
265 aa  191  9e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.08 
 
 
262 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.57 
 
 
265 aa  191  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1526  parA family protein  38.49 
 
 
262 aa  190  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429591  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4334  ParA family protein  39.68 
 
 
262 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.873064  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  39.02 
 
 
259 aa  189  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1533  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.68 
 
 
262 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.344504 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1345  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.77 
 
 
262 aa  188  7e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  38.98 
 
 
253 aa  188  8e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  38.98 
 
 
253 aa  187  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  38.98 
 
 
253 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1986  ParA family protein  39.68 
 
 
262 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  38.98 
 
 
253 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  38.98 
 
 
253 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3430  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.68 
 
 
262 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  38.98 
 
 
253 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.4 
 
 
253 aa  187  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  38.98 
 
 
253 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  38.98 
 
 
253 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  38.98 
 
 
253 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3660  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.68 
 
 
263 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3864  putative plasmid partitioning protein  38.49 
 
 
262 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.78 
 
 
253 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  38.21 
 
 
259 aa  186  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1570  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.49 
 
 
262 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601038  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45520  putative plasmid partitioning protein  38.49 
 
 
262 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.922179 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.19 
 
 
253 aa  185  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1925  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.98 
 
 
307 aa  185  6e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  39.43 
 
 
258 aa  185  6e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2798  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.1 
 
 
262 aa  185  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.519748  normal  0.161878 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.49 
 
 
263 aa  184  8e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.018865 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.49 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1372  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.49 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.167062 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0990  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.05 
 
 
265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37153  normal  0.791697 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1916  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.19 
 
 
307 aa  182  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374804  hitchhiker  0.00135404 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  36.47 
 
 
257 aa  183  3e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.31 
 
 
255 aa  183  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40 
 
 
254 aa  181  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3204  ParA family protein  37.7 
 
 
263 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40 
 
 
302 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1384  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.51 
 
 
263 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.82 
 
 
253 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.43 
 
 
273 aa  180  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.7 
 
 
263 aa  180  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.47 
 
 
255 aa  180  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2274  ParA family protein  39.84 
 
 
263 aa  179  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  39.77 
 
 
332 aa  178  7e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.16 
 
 
302 aa  178  9e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.61 
 
 
317 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.16 
 
 
287 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.74 
 
 
262 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.3 
 
 
263 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.08 
 
 
257 aa  176  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1205  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.9 
 
 
264 aa  176  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.82 
 
 
253 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.94 
 
 
339 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02865  putative ParA family protein  38.46 
 
 
254 aa  176  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.827974  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.04 
 
 
294 aa  176  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1641  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.9 
 
 
263 aa  176  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.61 
 
 
253 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.9 
 
 
263 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.329595  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3045  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.9 
 
 
263 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2913  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.9 
 
 
263 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  36.59 
 
 
255 aa  176  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.9 
 
 
263 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.17 
 
 
284 aa  175  6e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  38.37 
 
 
268 aa  175  6e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  35.69 
 
 
258 aa  175  8e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.51 
 
 
263 aa  174  9e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.98 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  38.19 
 
 
330 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.58 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.04 
 
 
253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1182  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.6 
 
 
268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.14884 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.71 
 
 
253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.58 
 
 
255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.11 
 
 
254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  38.19 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2519  ParA family protein  38.19 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.33 
 
 
255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  39.92 
 
 
259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.97 
 
 
266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.98 
 
 
261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0896384  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  39.92 
 
 
370 aa  172  5.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002021  ParA family protein  37.8 
 
 
257 aa  171  7.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000141399  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  37.4 
 
 
294 aa  171  1e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.4 
 
 
274 aa  171  1e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  37.25 
 
 
253 aa  171  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2175  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.37 
 
 
255 aa  170  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000290082  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.8 
 
 
322 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  38.43 
 
 
265 aa  170  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7333  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.34 
 
 
470 aa  170  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946911  normal  0.45285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>