More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1182 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1182  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
268 aa  547  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.14884 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1345  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.65 
 
 
262 aa  323  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0990  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.69 
 
 
265 aa  322  3e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37153  normal  0.791697 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.11 
 
 
265 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.09 
 
 
284 aa  294  9e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  55.82 
 
 
259 aa  292  4e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  55.42 
 
 
259 aa  291  6e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3421  cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.3 
 
 
257 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.786634  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  51.59 
 
 
255 aa  286  2.9999999999999996e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1526  parA family protein  51.7 
 
 
262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429591  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2798  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.97 
 
 
262 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.519748  normal  0.161878 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  54.62 
 
 
258 aa  280  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1968  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.07 
 
 
265 aa  277  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02865  putative ParA family protein  52.78 
 
 
254 aa  272  5.000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.827974  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.38 
 
 
263 aa  271  9e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45520  putative plasmid partitioning protein  51.89 
 
 
262 aa  271  9e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.922179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3864  putative plasmid partitioning protein  51.89 
 
 
262 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1384  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54 
 
 
263 aa  270  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3043  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.12 
 
 
263 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.025517 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.76 
 
 
262 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3660  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.54 
 
 
263 aa  265  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4334  ParA family protein  53.15 
 
 
262 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.873064  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1533  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.15 
 
 
262 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.344504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1570  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.16 
 
 
262 aa  264  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601038  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1986  ParA family protein  52.78 
 
 
262 aa  262  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3430  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.78 
 
 
262 aa  262  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2274  ParA family protein  51.78 
 
 
263 aa  259  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.6 
 
 
263 aa  259  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1372  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.6 
 
 
263 aa  259  3e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.167062 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3204  ParA family protein  51.6 
 
 
263 aa  259  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.6 
 
 
263 aa  259  4e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.018865 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2157  putative plasmid partitioning protein  51.54 
 
 
266 aa  258  8e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.03 
 
 
263 aa  255  6e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.2 
 
 
263 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.329595  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.2 
 
 
263 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2913  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.2 
 
 
263 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3045  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.2 
 
 
263 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.8 
 
 
263 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1641  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.62 
 
 
263 aa  251  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1205  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50 
 
 
264 aa  241  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3025  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.15 
 
 
259 aa  237  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00028  chromosome partioning protein  49.01 
 
 
260 aa  228  8e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.287581  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1856  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.09 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.204496  normal  0.925256 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0777  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.6 
 
 
257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1153  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.25 
 
 
258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.488153  normal  0.157692 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.74 
 
 
258 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.71944  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.04 
 
 
257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.32 
 
 
256 aa  178  8e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1574  ParA family protein  39.45 
 
 
258 aa  177  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0302854  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.18 
 
 
255 aa  176  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.13 
 
 
255 aa  175  7e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  36.51 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  36.51 
 
 
253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  36.51 
 
 
253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  36.51 
 
 
253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  36.51 
 
 
253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  36.51 
 
 
253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  36.51 
 
 
253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  36.51 
 
 
253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  36.51 
 
 
253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.68 
 
 
257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.11 
 
 
253 aa  172  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  33.86 
 
 
256 aa  172  5e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.08 
 
 
257 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  34.92 
 
 
258 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.99 
 
 
266 aa  171  9e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.22 
 
 
269 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2752  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.5 
 
 
262 aa  171  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  37.5 
 
 
257 aa  170  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.68 
 
 
267 aa  169  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.86 
 
 
253 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  34.25 
 
 
257 aa  169  5e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.52 
 
 
253 aa  168  7e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  35.48 
 
 
260 aa  168  8e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  36.14 
 
 
253 aa  167  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.43 
 
 
253 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.52 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  37.1 
 
 
257 aa  166  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  34.27 
 
 
254 aa  166  5e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  34.52 
 
 
255 aa  166  5e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0241  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
300 aa  165  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.811562  normal  0.0256625 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.83 
 
 
254 aa  165  5.9999999999999996e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.99 
 
 
255 aa  165  9e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.32 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  32.94 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3177  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.5 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.59 
 
 
262 aa  163  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000361786  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0307  hypothetical protein  32.54 
 
 
262 aa  163  3e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.285877 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.31 
 
 
287 aa  163  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  32.27 
 
 
257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  32.27 
 
 
257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.23 
 
 
264 aa  162  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7333  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.93 
 
 
470 aa  162  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946911  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.73 
 
 
253 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.05 
 
 
254 aa  161  9e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.47 
 
 
253 aa  161  9e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  37.55 
 
 
262 aa  160  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.68 
 
 
277 aa  161  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.85 
 
 
262 aa  161  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.25 
 
 
306 aa  161  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>