More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4256 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
257 aa  522  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  80.93 
 
 
257 aa  429  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  80.16 
 
 
257 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  77.82 
 
 
257 aa  413  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  75.1 
 
 
257 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3177  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  73.62 
 
 
257 aa  371  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  70.43 
 
 
257 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  64 
 
 
254 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.51 
 
 
253 aa  328  5.0000000000000004e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  61.2 
 
 
253 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  61.2 
 
 
253 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  61.2 
 
 
253 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  61.2 
 
 
253 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  61.2 
 
 
253 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  61.2 
 
 
253 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  61.2 
 
 
253 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  61.2 
 
 
253 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  61.2 
 
 
253 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.8 
 
 
253 aa  324  9e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.16 
 
 
255 aa  323  1e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.52 
 
 
253 aa  322  3e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.29 
 
 
253 aa  318  5e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4355  chromosome segregation ATPase  59.13 
 
 
275 aa  317  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.901478  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.13 
 
 
259 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4502  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.52 
 
 
314 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4491  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.13 
 
 
259 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  59.04 
 
 
249 aa  315  4e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.2 
 
 
253 aa  315  4e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  57.2 
 
 
258 aa  315  6e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.6 
 
 
257 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  59.68 
 
 
253 aa  313  1.9999999999999998e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.56 
 
 
267 aa  310  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  54.94 
 
 
256 aa  308  5e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  54.94 
 
 
255 aa  308  6.999999999999999e-83  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  54.37 
 
 
258 aa  308  6.999999999999999e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0307  hypothetical protein  54.55 
 
 
262 aa  306  2.0000000000000002e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.285877 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  57.14 
 
 
260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.92 
 
 
253 aa  305  7e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.25 
 
 
264 aa  304  8.000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.2 
 
 
295 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  56.4 
 
 
253 aa  302  3.0000000000000004e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.69 
 
 
262 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  55.56 
 
 
262 aa  301  5.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.56 
 
 
254 aa  301  5.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  55.38 
 
 
276 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  55.25 
 
 
256 aa  300  2e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.72 
 
 
265 aa  298  4e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  54.72 
 
 
265 aa  297  1e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.38 
 
 
262 aa  296  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.76 
 
 
255 aa  296  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  56 
 
 
253 aa  295  7e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  53.97 
 
 
261 aa  294  9e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.59 
 
 
273 aa  293  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.94 
 
 
253 aa  294  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  54.18 
 
 
262 aa  293  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.94 
 
 
265 aa  293  2e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2519  ParA family protein  52.17 
 
 
257 aa  293  2e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.94 
 
 
265 aa  293  2e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.94 
 
 
262 aa  293  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  56.25 
 
 
265 aa  293  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.16 
 
 
256 aa  293  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  56.35 
 
 
259 aa  292  3e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.91 
 
 
254 aa  292  3e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2439  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.94 
 
 
265 aa  292  4e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.14 
 
 
256 aa  292  4e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  55.6 
 
 
294 aa  292  4e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.34 
 
 
262 aa  291  5e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.57 
 
 
262 aa  291  6e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.57 
 
 
261 aa  291  8e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  53.94 
 
 
265 aa  291  8e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  53.97 
 
 
264 aa  290  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.95 
 
 
263 aa  290  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.09 
 
 
264 aa  290  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1631  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.1 
 
 
263 aa  290  2e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423414  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.31 
 
 
284 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.95 
 
 
262 aa  289  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.17 
 
 
259 aa  289  3e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3318  sporulation initiation inhibitor protein Soj  54.37 
 
 
256 aa  289  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.76 
 
 
262 aa  289  3e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  51.98 
 
 
262 aa  289  3e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  52.92 
 
 
258 aa  288  4e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.95 
 
 
262 aa  289  4e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.95 
 
 
262 aa  289  4e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.37 
 
 
264 aa  289  4e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0305586  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.78 
 
 
262 aa  288  4e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.95 
 
 
262 aa  289  4e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  51.78 
 
 
257 aa  288  6e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1803  ParaA family ATPase  52.76 
 
 
265 aa  288  6e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.833868  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2752  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.54 
 
 
262 aa  288  7e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.6 
 
 
294 aa  287  1e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.57 
 
 
270 aa  287  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.97 
 
 
254 aa  287  1e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.17 
 
 
262 aa  287  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000361786  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0241  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52 
 
 
300 aa  287  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.811562  normal  0.0256625 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2960  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.97 
 
 
259 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.86 
 
 
277 aa  287  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.97 
 
 
259 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002021  ParA family protein  51.38 
 
 
257 aa  287  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000141399  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.57 
 
 
264 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.17 
 
 
264 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>