More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0142 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  100 
 
 
258 aa  523  1e-148  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.64 
 
 
267 aa  352  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0307  hypothetical protein  63.64 
 
 
262 aa  345  4e-94  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.285877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0241  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.24 
 
 
300 aa  332  3e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.811562  normal  0.0256625 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  62.85 
 
 
258 aa  332  5e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.87 
 
 
262 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.84 
 
 
256 aa  326  2.0000000000000001e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  62.06 
 
 
254 aa  325  4.0000000000000003e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.87 
 
 
273 aa  325  5e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.39 
 
 
255 aa  324  7e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.43 
 
 
295 aa  323  2e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.71 
 
 
265 aa  318  5e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2439  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.92 
 
 
265 aa  311  5.999999999999999e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.92 
 
 
265 aa  311  5.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.52 
 
 
265 aa  310  2e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1803  ParaA family ATPase  56.52 
 
 
265 aa  309  2.9999999999999997e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.833868  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  55.34 
 
 
265 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  53.7 
 
 
257 aa  301  7.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.26 
 
 
264 aa  300  1e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0305586  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  54.55 
 
 
265 aa  300  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.94 
 
 
254 aa  297  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  54.12 
 
 
260 aa  295  6e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.2 
 
 
255 aa  291  8e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  52.53 
 
 
257 aa  290  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.57 
 
 
253 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  54.4 
 
 
254 aa  288  4e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.37 
 
 
262 aa  288  6e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.2 
 
 
253 aa  288  6e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  50.59 
 
 
255 aa  287  1e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.97 
 
 
253 aa  286  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  55.2 
 
 
253 aa  285  4e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  55.2 
 
 
253 aa  285  4e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  55.2 
 
 
253 aa  285  4e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  55.2 
 
 
253 aa  285  4e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  55.2 
 
 
253 aa  285  4e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  55.2 
 
 
253 aa  285  4e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  55.2 
 
 
253 aa  285  4e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  55.2 
 
 
253 aa  285  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.2 
 
 
253 aa  285  5e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  50.98 
 
 
256 aa  285  5.999999999999999e-76  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  54.8 
 
 
253 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.2 
 
 
253 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.97 
 
 
257 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.58 
 
 
257 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.92 
 
 
257 aa  281  5.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  51.17 
 
 
256 aa  281  1e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.2 
 
 
253 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1631  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.54 
 
 
263 aa  277  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423414  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  52.4 
 
 
253 aa  277  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.17 
 
 
255 aa  277  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.38 
 
 
270 aa  276  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  54.4 
 
 
253 aa  276  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  51 
 
 
262 aa  275  4e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  50 
 
 
262 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6365  chromosome partitioning protein Soj  49.42 
 
 
262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.63 
 
 
257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  49.42 
 
 
262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3318  sporulation initiation inhibitor protein Soj  51.38 
 
 
256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 
263 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  50.59 
 
 
263 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.59 
 
 
254 aa  271  8.000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.98 
 
 
263 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  50.2 
 
 
265 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.19 
 
 
277 aa  271  8.000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.59 
 
 
263 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  49.41 
 
 
262 aa  270  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 
263 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.17 
 
 
262 aa  270  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.17 
 
 
262 aa  271  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  50.59 
 
 
263 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2960  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.99 
 
 
259 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.99 
 
 
259 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  51.17 
 
 
262 aa  270  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  50.99 
 
 
256 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  49.21 
 
 
262 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  50.99 
 
 
256 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  50.99 
 
 
256 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  50.99 
 
 
256 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  50.99 
 
 
256 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  50.99 
 
 
256 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  50.99 
 
 
256 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  51.94 
 
 
262 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.59 
 
 
253 aa  268  5e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0112  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.59 
 
 
259 aa  268  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  47.27 
 
 
258 aa  268  5e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  50.78 
 
 
262 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  50.78 
 
 
262 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  50.2 
 
 
263 aa  268  7e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0096  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.2 
 
 
259 aa  268  8e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.560799  normal  0.715658 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  49.39 
 
 
249 aa  268  8e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0095  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.2 
 
 
259 aa  268  8e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.740552  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.17 
 
 
262 aa  268  8e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0086  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.2 
 
 
259 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.368871  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.6 
 
 
294 aa  267  1e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.8 
 
 
256 aa  267  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4502  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.61 
 
 
314 aa  267  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.61 
 
 
259 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4491  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.61 
 
 
259 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.81 
 
 
284 aa  266  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  50.78 
 
 
259 aa  267  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>