More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3413 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  100 
 
 
257 aa  523  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  85.6 
 
 
257 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  77.82 
 
 
257 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  74.71 
 
 
257 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  73.54 
 
 
257 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3177  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  71.94 
 
 
257 aa  364  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  66.54 
 
 
257 aa  350  1e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  61.6 
 
 
254 aa  328  4e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.9 
 
 
253 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.7 
 
 
253 aa  326  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.15 
 
 
255 aa  323  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.2 
 
 
253 aa  322  4e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  61.66 
 
 
253 aa  319  1.9999999999999998e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.54 
 
 
267 aa  319  3e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  56.75 
 
 
258 aa  317  1e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  58.57 
 
 
258 aa  316  3e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.27 
 
 
257 aa  315  6e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  59.44 
 
 
249 aa  313  9.999999999999999e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  59.2 
 
 
253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  59.2 
 
 
253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  59.2 
 
 
253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  59.2 
 
 
253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  59.2 
 
 
253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  59.2 
 
 
253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  59.2 
 
 
253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  59.2 
 
 
253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  59.2 
 
 
253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58 
 
 
253 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0307  hypothetical protein  54.33 
 
 
262 aa  310  1e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.285877 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.8 
 
 
253 aa  310  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  59.2 
 
 
253 aa  309  2.9999999999999997e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4491  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.37 
 
 
259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.37 
 
 
259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4355  chromosome segregation ATPase  57.98 
 
 
275 aa  308  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.901478  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4502  cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.98 
 
 
314 aa  308  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.57 
 
 
295 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  54.15 
 
 
255 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  52.73 
 
 
256 aa  304  7e-82  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  55.64 
 
 
256 aa  305  7e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.6 
 
 
253 aa  304  9.000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.16 
 
 
262 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  58 
 
 
294 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.8 
 
 
294 aa  301  9e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.69 
 
 
254 aa  301  9e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.52 
 
 
262 aa  297  1e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  54.62 
 
 
262 aa  296  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  56.35 
 
 
260 aa  296  2e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.42 
 
 
264 aa  296  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0241  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.2 
 
 
300 aa  295  5e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.811562  normal  0.0256625 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  55.34 
 
 
253 aa  295  6e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.56 
 
 
256 aa  295  7e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.37 
 
 
255 aa  293  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.56 
 
 
256 aa  293  1e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  56.25 
 
 
259 aa  293  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.52 
 
 
265 aa  293  2e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.58 
 
 
254 aa  292  3e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.73 
 
 
265 aa  292  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.54 
 
 
253 aa  292  4e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  54.55 
 
 
262 aa  292  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  53.52 
 
 
265 aa  292  4e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.91 
 
 
255 aa  291  6e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.75 
 
 
264 aa  291  6e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.59 
 
 
273 aa  291  6e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  52.53 
 
 
258 aa  290  2e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.47 
 
 
262 aa  290  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  52.61 
 
 
276 aa  290  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  52.73 
 
 
265 aa  290  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0017  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.37 
 
 
256 aa  288  5.0000000000000004e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.405459  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.69 
 
 
262 aa  287  9e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.72 
 
 
270 aa  287  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.6 
 
 
266 aa  287  1e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2439  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.73 
 
 
265 aa  286  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  53.17 
 
 
263 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  53.75 
 
 
263 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  55.12 
 
 
254 aa  286  2.9999999999999996e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3318  sporulation initiation inhibitor protein Soj  53.57 
 
 
256 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.75 
 
 
263 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.78 
 
 
256 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0014  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.57 
 
 
256 aa  285  5e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386166  hitchhiker  0.000800579 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3782  chromosome segregation ATPase  54.33 
 
 
257 aa  285  5e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000230675 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.62 
 
 
253 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.36 
 
 
263 aa  285  7e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0095  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.59 
 
 
259 aa  284  9e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.740552  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  53.57 
 
 
268 aa  284  9e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.96 
 
 
263 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6365  chromosome partitioning protein Soj  52.92 
 
 
262 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2960  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.38 
 
 
259 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1631  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.15 
 
 
263 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  52.92 
 
 
262 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.38 
 
 
259 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  54.98 
 
 
348 aa  284  1.0000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  54.18 
 
 
262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  52.57 
 
 
262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1803  ParaA family ATPase  51.56 
 
 
265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.833868  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  54.69 
 
 
265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  53.17 
 
 
256 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  53.17 
 
 
256 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  53.17 
 
 
256 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  53.17 
 
 
256 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  53.17 
 
 
256 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>