More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1153 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1153  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 258 aa  521  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.488153  normal  0.157692 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0777  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  77.56 
 
 		 257 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1574  ParA family protein  73.26 
 
 		 258 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0302854  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  67.83 
 
 		 258 aa  356  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.71944  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3043  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.43 
 
 		 263 aa  196  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.025517 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1526  parA family protein  40.32 
 
 		 262 aa  188  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429591  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.49 
 
 		 265 aa  188  5.999999999999999e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  38.21 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.24 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.16 
 
 		 263 aa  186  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1372  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.16 
 
 		 263 aa  186  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.167062 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.76 
 
 		 263 aa  185  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.018865 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3204  ParA family protein  40.16 
 
 		 263 aa  185  8e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.7 
 
 		 302 aa  185  8e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3421  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.6 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.786634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  37.4 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2274  ParA family protein  39.68 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  38.52 
 
 		 256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1384  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.55 
 
 		 263 aa  182  6e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.76 
 
 		 263 aa  181  7e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.329595  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3045  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.76 
 
 		 263 aa  181  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2913  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.76 
 
 		 263 aa  181  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.76 
 
 		 263 aa  181  7e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  40.7 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1641  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.74 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.15 
 
 		 263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1205  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.8 
 
 		 264 aa  179  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  38.06 
 
 		 258 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  37.65 
 
 		 253 aa  178  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  37.65 
 
 		 253 aa  178  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  37.65 
 
 		 253 aa  178  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  37.65 
 
 		 253 aa  178  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  37.65 
 
 		 253 aa  178  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  37.65 
 
 		 253 aa  178  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  37.65 
 
 		 253 aa  178  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  37.65 
 
 		 253 aa  178  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  37.65 
 
 		 253 aa  178  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1925  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.22 
 
 		 307 aa  177  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.86 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1916  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.82 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374804  hitchhiker  0.00135404 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.55 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.25 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0990  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.25 
 
 		 265 aa  175  6e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37153  normal  0.791697 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  40 
 
 		 332 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1968  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.86 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.63 
 
 		 284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.13 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  35.48 
 
 		 255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1345  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.06 
 
 		 262 aa  172  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.15 
 
 		 317 aa  172  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.41 
 
 		 302 aa  172  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.18 
 
 		 287 aa  171  7.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.35 
 
 		 306 aa  171  9e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.32 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.92 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0896384  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.39 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.32 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  38.52 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.52 
 
 		 298 aa  170  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.32 
 
 		 339 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2798  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.22 
 
 		 262 aa  169  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.519748  normal  0.161878 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  36.9 
 
 		 257 aa  169  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  36.9 
 
 		 257 aa  169  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  38.19 
 
 		 294 aa  169  5e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.06 
 
 		 255 aa  169  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  37.8 
 
 		 260 aa  169  6e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1986  ParA family protein  35.57 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.71 
 
 		 290 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3430  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.57 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.71 
 
 		 279 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.71 
 
 		 290 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4334  ParA family protein  36.44 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.873064  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.94 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.11 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1533  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.44 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.344504 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.36 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02865  putative ParA family protein  36.84 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.827974  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  37.25 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.03 
 
 		 262 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45520  putative plasmid partitioning protein  33.99 
 
 		 262 aa  165  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.922179 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.76 
 
 		 284 aa  165  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3864  putative plasmid partitioning protein  33.99 
 
 		 262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.43 
 
 		 322 aa  165  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.59 
 
 		 253 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.69 
 
 		 293 aa  165  8e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.32 
 
 		 298 aa  165  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.78 
 
 		 337 aa  164  9e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.76 
 
 		 255 aa  165  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.19 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  41.41 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.13 
 
 		 329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2993  chromosome partitioning ATPase  38.37 
 
 		 315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  35.57 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.69 
 
 		 329 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  38.67 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.86 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002021  ParA family protein  36.51 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000141399  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.08 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3660  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.63 
 
 		 263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  33.73 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>