More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1345 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1345  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
262 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.83 
 
 
284 aa  318  7.999999999999999e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.53 
 
 
265 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0990  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.24 
 
 
265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37153  normal  0.791697 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1182  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.65 
 
 
268 aa  299  3e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.14884 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1968  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.2 
 
 
265 aa  288  5.0000000000000004e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02865  putative ParA family protein  51.97 
 
 
254 aa  283  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.827974  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3421  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.72 
 
 
257 aa  280  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.786634  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  50.99 
 
 
255 aa  275  5e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2157  putative plasmid partitioning protein  53.58 
 
 
266 aa  273  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  51.38 
 
 
259 aa  270  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  50.99 
 
 
259 aa  269  2.9999999999999997e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  52.16 
 
 
258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2798  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.17 
 
 
262 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.519748  normal  0.161878 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45520  putative plasmid partitioning protein  50.38 
 
 
262 aa  265  7e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.922179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3864  putative plasmid partitioning protein  50.38 
 
 
262 aa  265  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1570  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.15 
 
 
262 aa  262  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601038  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1526  parA family protein  47.49 
 
 
262 aa  260  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429591  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.66 
 
 
263 aa  258  8e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.85 
 
 
263 aa  257  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2274  ParA family protein  49.25 
 
 
263 aa  255  5e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.59 
 
 
262 aa  255  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1384  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.04 
 
 
263 aa  255  6e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3045  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.19 
 
 
263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.19 
 
 
263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.329595  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2913  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.19 
 
 
263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.19 
 
 
263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4334  ParA family protein  50.4 
 
 
262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.873064  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1533  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.4 
 
 
262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.344504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3660  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.18 
 
 
263 aa  251  6e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.65 
 
 
263 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1372  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.65 
 
 
263 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.167062 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3043  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.74 
 
 
263 aa  249  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.025517 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3204  ParA family protein  48.46 
 
 
263 aa  249  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3430  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.24 
 
 
262 aa  248  6e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.28 
 
 
263 aa  248  6e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.018865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1986  ParA family protein  49.24 
 
 
262 aa  248  7e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.92 
 
 
263 aa  248  9e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1205  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.94 
 
 
264 aa  241  6e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1641  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.64 
 
 
263 aa  239  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3025  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.97 
 
 
259 aa  230  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00028  chromosome partioning protein  45.63 
 
 
260 aa  221  8e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.287581  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1856  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.25 
 
 
260 aa  211  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.204496  normal  0.925256 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0777  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.77 
 
 
257 aa  188  7e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.02 
 
 
284 aa  175  5e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.16 
 
 
258 aa  175  8e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.71944  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1153  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.06 
 
 
258 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.488153  normal  0.157692 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  34.54 
 
 
257 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  34.54 
 
 
257 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  34.29 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.95 
 
 
255 aa  166  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.81 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.97 
 
 
255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.94 
 
 
253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  36.51 
 
 
253 aa  163  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.52 
 
 
253 aa  163  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.51 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.43 
 
 
253 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.76 
 
 
254 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  29.84 
 
 
255 aa  159  3e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  28.96 
 
 
256 aa  160  3e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  34.02 
 
 
258 aa  159  4e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.88 
 
 
257 aa  159  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.37 
 
 
269 aa  159  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1574  ParA family protein  37.75 
 
 
258 aa  159  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0302854  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  35.74 
 
 
259 aa  157  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.46 
 
 
284 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  36.25 
 
 
257 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  36.05 
 
 
259 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.08 
 
 
270 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.85 
 
 
262 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  36.08 
 
 
257 aa  156  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  35.74 
 
 
264 aa  156  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  35.06 
 
 
254 aa  156  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.47 
 
 
253 aa  156  4e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.25 
 
 
309 aa  155  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.33 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  38.06 
 
 
259 aa  155  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  35.52 
 
 
268 aa  154  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  31.47 
 
 
256 aa  154  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.77 
 
 
253 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0277  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.19 
 
 
254 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.287869  normal  0.696383 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.09 
 
 
262 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  32.06 
 
 
260 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.83 
 
 
270 aa  154  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  34.96 
 
 
253 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  34.96 
 
 
253 aa  153  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  34.96 
 
 
253 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  34.96 
 
 
253 aa  153  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  34.96 
 
 
253 aa  153  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  34.96 
 
 
253 aa  153  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  34.96 
 
 
253 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  34.96 
 
 
253 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  34.96 
 
 
253 aa  153  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.72 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.75 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.72 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3177  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.55 
 
 
257 aa  152  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  31.45 
 
 
249 aa  152  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>