More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2848 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  100 
 
 
259 aa  525  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  73.85 
 
 
260 aa  393  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  69.11 
 
 
258 aa  374  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  63.82 
 
 
276 aa  325  5e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1276  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60 
 
 
317 aa  323  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0167  chromosome segregation ATPase  61.42 
 
 
283 aa  316  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  57.26 
 
 
255 aa  315  6e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  56.85 
 
 
256 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.63 
 
 
286 aa  311  4.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  60.96 
 
 
265 aa  310  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.63 
 
 
284 aa  309  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  60.96 
 
 
265 aa  310  2e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.16 
 
 
262 aa  308  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.02 
 
 
284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.81 
 
 
284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.63 
 
 
271 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.23 
 
 
270 aa  305  4.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1654  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.89 
 
 
286 aa  305  6e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0980496  normal  0.386611 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4093  cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.26 
 
 
285 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.164046  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.24 
 
 
289 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1585  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.5 
 
 
286 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0495676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1864  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.5 
 
 
286 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  normal  0.0904624 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  60.24 
 
 
264 aa  301  5.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1026  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  60 
 
 
282 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1408  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60 
 
 
279 aa  299  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.391626 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.57 
 
 
282 aa  297  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  62.4 
 
 
270 aa  297  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  57.14 
 
 
265 aa  295  4e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.23 
 
 
264 aa  295  6e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.63 
 
 
264 aa  294  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  58.4 
 
 
264 aa  294  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.23 
 
 
264 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  58.89 
 
 
285 aa  291  8e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.64 
 
 
282 aa  290  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15195 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.63 
 
 
265 aa  287  9e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.2 
 
 
263 aa  286  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  56.25 
 
 
259 aa  286  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_002978  WD1217  ParA family protein  55.77 
 
 
280 aa  285  4e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  54.44 
 
 
257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.86 
 
 
279 aa  283  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.457165  normal  0.438059 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.75 
 
 
273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  55.24 
 
 
294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.57 
 
 
270 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.04 
 
 
253 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.91 
 
 
295 aa  279  4e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.65 
 
 
262 aa  279  4e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  56.5 
 
 
254 aa  278  8e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  53.01 
 
 
257 aa  278  8e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.03 
 
 
262 aa  277  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  52.23 
 
 
256 aa  276  2e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  55.24 
 
 
259 aa  276  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.42 
 
 
294 aa  275  5e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.33 
 
 
262 aa  272  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  55.78 
 
 
268 aa  272  4.0000000000000004e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.33 
 
 
262 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2888  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.96 
 
 
274 aa  271  9e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.16 
 
 
262 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1227  chromosome segregation ATPase  58.96 
 
 
274 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.16 
 
 
262 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  51.97 
 
 
273 aa  271  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  52.94 
 
 
262 aa  270  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.16 
 
 
262 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.76 
 
 
262 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.36 
 
 
262 aa  270  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.66 
 
 
258 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  54.25 
 
 
253 aa  269  4e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  52.55 
 
 
262 aa  269  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  52.55 
 
 
262 aa  269  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.42 
 
 
261 aa  268  5e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 
262 aa  268  5.9999999999999995e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  50.81 
 
 
258 aa  268  8e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.21 
 
 
264 aa  267  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.61 
 
 
255 aa  267  1e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.4 
 
 
267 aa  266  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  48.82 
 
 
258 aa  266  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  52.02 
 
 
348 aa  266  2.9999999999999995e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  51.17 
 
 
262 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.81 
 
 
257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  51.43 
 
 
249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.57 
 
 
256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  51.78 
 
 
262 aa  266  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  52.82 
 
 
260 aa  265  5e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.57 
 
 
266 aa  265  5.999999999999999e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  52.82 
 
 
262 aa  265  7e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  51.17 
 
 
262 aa  265  7e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.18 
 
 
262 aa  265  8e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  49.6 
 
 
253 aa  265  8e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6365  chromosome partitioning protein Soj  51.17 
 
 
262 aa  265  8e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.79 
 
 
262 aa  264  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000361786  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.23 
 
 
257 aa  264  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.42 
 
 
278 aa  264  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4491  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.22 
 
 
259 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.22 
 
 
259 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.81 
 
 
270 aa  263  2e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4355  chromosome segregation ATPase  54.22 
 
 
275 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.901478  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  49.22 
 
 
262 aa  262  3e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.81 
 
 
255 aa  262  4e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2519  ParA family protein  52.02 
 
 
257 aa  262  4e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  52.42 
 
 
262 aa  262  4e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.98 
 
 
264 aa  262  4e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>