More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1276 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1276  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 		 317 aa  640    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  70.44 
 
 		 284 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  70.44 
 
 		 286 aa  386  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  69.71 
 
 		 289 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0167  chromosome segregation ATPase  68.2 
 
 		 283 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1864  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  65.07 
 
 		 286 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  normal  0.0904624 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1654  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  68.28 
 
 		 286 aa  375  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0980496  normal  0.386611 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1585  cobyrinic acid ac-diamide synthase  65.07 
 
 		 286 aa  375  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495676 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  68.98 
 
 		 271 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.16 
 
 		 270 aa  372  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  68.61 
 
 		 284 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  68.61 
 
 		 284 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.57 
 
 		 282 aa  370  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15195 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  64.71 
 
 		 265 aa  365  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  64.71 
 
 		 265 aa  365  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  65.07 
 
 		 262 aa  365  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  64.71 
 
 		 264 aa  362  3e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  64.16 
 
 		 264 aa  361  7.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4093  cobyrinic acid ac-diamide synthase  68.98 
 
 		 285 aa  359  4e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.164046  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.34 
 
 		 264 aa  358  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.71 
 
 		 264 aa  358  8e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.67 
 
 		 264 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1408  cobyrinic acid ac-diamide synthase  67.9 
 
 		 279 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.391626 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.72 
 
 		 282 aa  355  5.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  62.87 
 
 		 265 aa  354  1e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1026  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  67.75 
 
 		 282 aa  353  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  61.87 
 
 		 285 aa  344  1e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  60.66 
 
 		 276 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  63.88 
 
 		 258 aa  328  6e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  60 
 
 		 259 aa  323  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  53.16 
 
 		 255 aa  317  1e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.34 
 
 		 260 aa  316  3e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.24 
 
 		 263 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  52.04 
 
 		 256 aa  312  5.999999999999999e-84  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.68 
 
 		 270 aa  294  1e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  54.04 
 
 		 268 aa  293  3e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1217  ParA family protein  53.19 
 
 		 280 aa  291  1e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  55.22 
 
 		 259 aa  290  3e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  51.12 
 
 		 257 aa  286  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  55.26 
 
 		 270 aa  287  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.88 
 
 		 295 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.94 
 
 		 255 aa  285  8e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 		 257 aa  284  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.75 
 
 		 265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  51.88 
 
 		 258 aa  281  8.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.03 
 
 		 273 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.33 
 
 		 258 aa  280  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  48.91 
 
 		 262 aa  278  6e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  46.74 
 
 		 273 aa  278  6e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.19 
 
 		 294 aa  278  7e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  50.38 
 
 		 256 aa  278  1e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  47.19 
 
 		 253 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.55 
 
 		 264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  48.5 
 
 		 249 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  49.25 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.06 
 
 		 255 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5105  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 		 437 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000298727 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.76 
 
 		 253 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  48.69 
 
 		 262 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  48.69 
 
 		 262 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.75 
 
 		 260 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  50.75 
 
 		 260 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.12 
 
 		 257 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  48.69 
 
 		 262 aa  272  6e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  46.84 
 
 		 253 aa  271  9e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.31 
 
 		 253 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  50.94 
 
 		 348 aa  271  1e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.25 
 
 		 254 aa  271  1e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.88 
 
 		 253 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.06 
 
 		 270 aa  271  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.57 
 
 		 262 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.75 
 
 		 257 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.57 
 
 		 262 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.57 
 
 		 262 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  48.31 
 
 		 262 aa  271  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.57 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.75 
 
 		 254 aa  270  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.57 
 
 		 262 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2888  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.92 
 
 		 274 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.44 
 
 		 279 aa  270  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.457165  normal  0.438059 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.94 
 
 		 262 aa  270  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.75 
 
 		 257 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  50.38 
 
 		 254 aa  269  4e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  50.19 
 
 		 294 aa  269  4e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  50.19 
 
 		 253 aa  269  5e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  50.19 
 
 		 253 aa  269  5e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  50.19 
 
 		 253 aa  269  5e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  50.19 
 
 		 253 aa  269  5e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4587  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.27 
 
 		 433 aa  269  5e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127465  hitchhiker  0.000606651 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  50.19 
 
 		 253 aa  269  5e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  50.19 
 
 		 253 aa  269  5e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  50.19 
 
 		 253 aa  269  5e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  50.19 
 
 		 253 aa  269  5e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  50.19 
 
 		 253 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1227  chromosome segregation ATPase  52.94 
 
 		 274 aa  268  7e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.43 
 
 		 253 aa  268  8e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.19 
 
 		 261 aa  268  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2519  ParA family protein  47.39 
 
 		 257 aa  268  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.31 
 
 		 253 aa  267  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  46.47 
 
 		 264 aa  267  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>