More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5026 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
270 aa  545  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1276  cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.16 
 
 
317 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1864  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  69.88 
 
 
286 aa  363  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  normal  0.0904624 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  68.6 
 
 
284 aa  363  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1585  cobyrinic acid ac-diamide synthase  69.88 
 
 
286 aa  363  1e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0495676 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  66.67 
 
 
286 aa  361  5.0000000000000005e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  65.53 
 
 
289 aa  359  2e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1654  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  69.11 
 
 
286 aa  359  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0980496  normal  0.386611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0167  chromosome segregation ATPase  66.28 
 
 
283 aa  358  6e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  67.44 
 
 
284 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  67.05 
 
 
271 aa  354  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  66.67 
 
 
284 aa  353  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  64.15 
 
 
285 aa  348  4e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1026  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  67.53 
 
 
282 aa  348  5e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  67.98 
 
 
282 aa  346  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  62.65 
 
 
264 aa  345  4e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.63 
 
 
264 aa  343  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1408  cobyrinic acid ac-diamide synthase  66.18 
 
 
279 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.391626 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.24 
 
 
264 aa  341  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.31 
 
 
282 aa  341  9e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15195 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  62.02 
 
 
264 aa  339  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.63 
 
 
264 aa  339  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.31 
 
 
262 aa  337  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  63.92 
 
 
265 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  63.92 
 
 
265 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  64.82 
 
 
276 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4093  cobyrinic acid ac-diamide synthase  67.69 
 
 
285 aa  334  9e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.164046  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  62.84 
 
 
265 aa  333  2e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  55.91 
 
 
255 aa  321  6e-87  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  55.91 
 
 
256 aa  320  9.999999999999999e-87  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  59.45 
 
 
258 aa  308  8e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  60.23 
 
 
259 aa  305  4.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.59 
 
 
263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.4 
 
 
260 aa  299  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_002978  WD1217  ParA family protein  53.93 
 
 
280 aa  297  1e-79  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  54.72 
 
 
262 aa  293  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  58.82 
 
 
268 aa  292  3e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  56.81 
 
 
259 aa  291  9e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  52.96 
 
 
253 aa  288  4e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  56.54 
 
 
270 aa  288  7e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.16 
 
 
255 aa  287  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  50.99 
 
 
253 aa  287  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  52.4 
 
 
258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  52.36 
 
 
264 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  50.96 
 
 
273 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  52.73 
 
 
262 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  52.73 
 
 
262 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.09 
 
 
265 aa  282  5.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  52.53 
 
 
262 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.4 
 
 
257 aa  280  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.96 
 
 
264 aa  280  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  52.94 
 
 
262 aa  281  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  52.34 
 
 
262 aa  280  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  50.39 
 
 
257 aa  280  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.09 
 
 
295 aa  280  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  50.79 
 
 
256 aa  280  3e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.34 
 
 
254 aa  279  3e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  53.17 
 
 
262 aa  279  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.39 
 
 
262 aa  279  4e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  52.73 
 
 
262 aa  279  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6365  chromosome partitioning protein Soj  52.73 
 
 
262 aa  278  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.95 
 
 
262 aa  278  5e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.97 
 
 
278 aa  278  6e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.08 
 
 
262 aa  278  6e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  51.56 
 
 
257 aa  278  7e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.69 
 
 
273 aa  278  8e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  50.2 
 
 
249 aa  277  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.59 
 
 
257 aa  276  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  53.97 
 
 
294 aa  276  2e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.96 
 
 
261 aa  276  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.78 
 
 
253 aa  276  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.59 
 
 
253 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.78 
 
 
294 aa  276  3e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  51.57 
 
 
262 aa  276  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.17 
 
 
262 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.17 
 
 
262 aa  275  4e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  52.17 
 
 
268 aa  275  4e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.17 
 
 
262 aa  275  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.76 
 
 
260 aa  275  4e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.17 
 
 
262 aa  275  4e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  52.76 
 
 
260 aa  275  4e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.61 
 
 
257 aa  275  5e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.2 
 
 
253 aa  275  5e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.6 
 
 
253 aa  275  6e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  52.8 
 
 
253 aa  275  7e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.38 
 
 
255 aa  275  8e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  50.96 
 
 
264 aa  274  9e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.78 
 
 
262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.61 
 
 
257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.38 
 
 
253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.19 
 
 
273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  50.19 
 
 
273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.38 
 
 
253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.58 
 
 
284 aa  273  3e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.38 
 
 
270 aa  272  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4355  chromosome segregation ATPase  52.38 
 
 
275 aa  272  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.901478  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.19 
 
 
263 aa  272  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  52.8 
 
 
253 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  52.8 
 
 
253 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.57 
 
 
263 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>