More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0006 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 258 aa  516  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  64.96 
 
 		 270 aa  334  1e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  65.35 
 
 		 273 aa  330  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  63.78 
 
 		 268 aa  323  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  63.75 
 
 		 259 aa  318  3.9999999999999996e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2888  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  65.61 
 
 		 274 aa  315  6e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1227  chromosome segregation ATPase  65.61 
 
 		 274 aa  314  7e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.73 
 
 		 264 aa  295  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.33 
 
 		 264 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.69 
 
 		 264 aa  287  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  56.57 
 
 		 276 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.34 
 
 		 263 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  55.95 
 
 		 264 aa  285  5e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.81 
 
 		 284 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  57.65 
 
 		 265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0167  chromosome segregation ATPase  56.03 
 
 		 283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  57.65 
 
 		 265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.42 
 
 		 286 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.42 
 
 		 284 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.42 
 
 		 271 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.03 
 
 		 289 aa  281  5.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  56.98 
 
 		 285 aa  281  7.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  57.49 
 
 		 258 aa  281  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.03 
 
 		 284 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1654  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.25 
 
 		 286 aa  281  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0980496  normal  0.386611 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.08 
 
 		 262 aa  280  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1276  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.33 
 
 		 317 aa  280  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  57.09 
 
 		 264 aa  280  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.62 
 
 		 282 aa  278  5e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15195 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  55.81 
 
 		 265 aa  278  5e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  52.8 
 
 		 256 aa  278  8e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.73 
 
 		 282 aa  278  9e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.4 
 
 		 279 aa  277  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.457165  normal  0.438059 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  52.38 
 
 		 256 aa  276  2e-73  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  51.59 
 
 		 255 aa  275  4e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.84 
 
 		 253 aa  275  4e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1585  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.47 
 
 		 286 aa  275  8e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1864  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.47 
 
 		 286 aa  275  8e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  normal  0.0904624 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.38 
 
 		 284 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1408  cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.98 
 
 		 279 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.391626 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.61 
 
 		 253 aa  271  6e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1026  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.14 
 
 		 282 aa  270  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.18 
 
 		 255 aa  270  2e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  57.66 
 
 		 259 aa  270  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.4 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  51 
 
 		 258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  54.44 
 
 		 254 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.21 
 
 		 257 aa  268  8.999999999999999e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.22 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.76 
 
 		 277 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  51.81 
 
 		 249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.06 
 
 		 253 aa  266  4e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.75 
 
 		 270 aa  265  7e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  52.21 
 
 		 253 aa  265  8e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  51.19 
 
 		 257 aa  264  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  52.21 
 
 		 253 aa  264  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  52.21 
 
 		 253 aa  264  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  52.21 
 
 		 253 aa  264  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  52.21 
 
 		 253 aa  264  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  52.21 
 
 		 253 aa  264  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  52.21 
 
 		 253 aa  264  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  52.21 
 
 		 253 aa  264  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  52.21 
 
 		 253 aa  264  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.21 
 
 		 253 aa  263  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  50 
 
 		 262 aa  262  3e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.4 
 
 		 253 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.59 
 
 		 257 aa  261  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4093  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.86 
 
 		 285 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.164046  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.8 
 
 		 254 aa  259  3e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.4 
 
 		 253 aa  259  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  50.99 
 
 		 253 aa  259  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.79 
 
 		 257 aa  259  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.4 
 
 		 274 aa  258  5.0000000000000005e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.38 
 
 		 257 aa  258  7e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  52.92 
 
 		 253 aa  257  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  49.8 
 
 		 348 aa  257  1e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  50.4 
 
 		 257 aa  258  1e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  51.79 
 
 		 261 aa  256  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.79 
 
 		 264 aa  255  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.94 
 
 		 265 aa  255  5e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.58 
 
 		 266 aa  255  6e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1631  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.59 
 
 		 263 aa  254  7e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3177  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.34 
 
 		 257 aa  254  7e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  48.41 
 
 		 257 aa  254  9e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  48.41 
 
 		 257 aa  254  9e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4471  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.41 
 
 		 255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0387085  hitchhiker  0.00000000187699 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  50.4 
 
 		 260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  50.2 
 
 		 262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  49.4 
 
 		 257 aa  253  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  49.4 
 
 		 253 aa  253  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  51.2 
 
 		 253 aa  253  3e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.17 
 
 		 257 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.19 
 
 		 256 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.19 
 
 		 260 aa  251  6e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  52.19 
 
 		 260 aa  251  6e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  50.59 
 
 		 264 aa  251  6e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4355  chromosome segregation ATPase  49.6 
 
 		 275 aa  251  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.901478  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.2 
 
 		 255 aa  250  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  49.8 
 
 		 273 aa  250  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.8 
 
 		 259 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>