More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0432 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 284 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  95.07 
 
 		 284 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  98.89 
 
 		 271 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  91.2 
 
 		 284 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  89.16 
 
 		 286 aa  509  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0167  chromosome segregation ATPase  89.32 
 
 		 283 aa  506  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  87.37 
 
 		 289 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  76.81 
 
 		 282 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1864  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  72.96 
 
 		 286 aa  397  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  normal  0.0904624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1585  cobyrinic acid ac-diamide synthase  72.96 
 
 		 286 aa  397  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1026  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  75.64 
 
 		 282 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1654  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  74.52 
 
 		 286 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0980496  normal  0.386611 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  70.04 
 
 		 282 aa  395  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1408  cobyrinic acid ac-diamide synthase  75 
 
 		 279 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.391626 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  72.03 
 
 		 262 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  71.65 
 
 		 265 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  71.65 
 
 		 265 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1276  cobyrinic acid ac-diamide synthase  68.61 
 
 		 317 aa  373  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4093  cobyrinic acid ac-diamide synthase  76.25 
 
 		 285 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.164046  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  68.58 
 
 		 264 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  69.2 
 
 		 264 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  68.2 
 
 		 264 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  67.82 
 
 		 264 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  67.43 
 
 		 264 aa  364  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  66.8 
 
 		 265 aa  357  9e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  66.67 
 
 		 270 aa  353  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  63.95 
 
 		 276 aa  341  7e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  63.6 
 
 		 285 aa  332  6e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  61.02 
 
 		 259 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  52.12 
 
 		 255 aa  306  3e-82  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.69 
 
 		 260 aa  306  3e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  51.35 
 
 		 256 aa  301  7.000000000000001e-81  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  60.31 
 
 		 259 aa  301  7.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  58.87 
 
 		 268 aa  298  8e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.58 
 
 		 263 aa  296  2e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  58.69 
 
 		 258 aa  291  9e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  53.67 
 
 		 258 aa  289  3e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  55.89 
 
 		 270 aa  287  1e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.15 
 
 		 257 aa  285  4e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.34 
 
 		 273 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.42 
 
 		 258 aa  282  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.14 
 
 		 265 aa  281  7.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.94 
 
 		 253 aa  280  2e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  51.55 
 
 		 253 aa  279  4e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  52.57 
 
 		 256 aa  278  6e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.56 
 
 		 255 aa  278  1e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  50.39 
 
 		 273 aa  277  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.19 
 
 		 253 aa  277  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.78 
 
 		 253 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.75 
 
 		 257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_002978  WD1217  ParA family protein  53.16 
 
 		 280 aa  274  2.0000000000000002e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.53 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1227  chromosome segregation ATPase  55.3 
 
 		 274 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  52.51 
 
 		 294 aa  273  3e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.33 
 
 		 279 aa  272  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.457165  normal  0.438059 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.61 
 
 		 255 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.58 
 
 		 253 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.97 
 
 		 257 aa  271  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  52.55 
 
 		 254 aa  270  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.53 
 
 		 257 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2888  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.92 
 
 		 274 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3177  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.7 
 
 		 257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  48.45 
 
 		 264 aa  269  4e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  48.83 
 
 		 249 aa  269  4e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  50.58 
 
 		 262 aa  268  8e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.65 
 
 		 294 aa  268  8.999999999999999e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.39 
 
 		 253 aa  267  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.12 
 
 		 270 aa  267  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  50.78 
 
 		 253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  50.58 
 
 		 348 aa  266  4e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.55 
 
 		 260 aa  266  4e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  51.55 
 
 		 260 aa  266  4e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  50.19 
 
 		 257 aa  265  8e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.45 
 
 		 257 aa  265  8e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  49.41 
 
 		 257 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.16 
 
 		 278 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  49.61 
 
 		 253 aa  264  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  49.61 
 
 		 253 aa  264  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.19 
 
 		 254 aa  264  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  49.61 
 
 		 253 aa  264  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  49.61 
 
 		 253 aa  264  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  49.61 
 
 		 253 aa  264  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  49.61 
 
 		 253 aa  264  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  49.61 
 
 		 253 aa  264  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  49.61 
 
 		 253 aa  264  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.61 
 
 		 253 aa  264  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.58 
 
 		 262 aa  264  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  49.61 
 
 		 253 aa  264  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  52.65 
 
 		 330 aa  263  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.88 
 
 		 262 aa  263  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  49.23 
 
 		 260 aa  263  3e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.23 
 
 		 295 aa  263  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  49.03 
 
 		 262 aa  262  4e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  49.03 
 
 		 262 aa  262  4e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  49.03 
 
 		 262 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.59 
 
 		 256 aa  261  8.999999999999999e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  48.44 
 
 		 261 aa  261  1e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.81 
 
 		 264 aa  261  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4355  chromosome segregation ATPase  49.64 
 
 		 275 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.901478  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  48.65 
 
 		 262 aa  260  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>