More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_45520 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_45520  putative plasmid partitioning protein  100 
 
 
262 aa  531  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.922179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3864  putative plasmid partitioning protein  99.62 
 
 
262 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2798  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  87.4 
 
 
262 aa  470  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.519748  normal  0.161878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1570  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  85.5 
 
 
262 aa  463  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601038  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1986  ParA family protein  80.92 
 
 
262 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3430  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  80.92 
 
 
262 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1533  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  80.92 
 
 
262 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.344504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3660  cobyrinic acid ac-diamide synthase  81.3 
 
 
263 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4334  ParA family protein  80.92 
 
 
262 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.873064  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  80.53 
 
 
262 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1968  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  67.06 
 
 
265 aa  356  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3421  cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.85 
 
 
257 aa  340  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.786634  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.76 
 
 
265 aa  284  8e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0990  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.92 
 
 
265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37153  normal  0.791697 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2157  putative plasmid partitioning protein  56.87 
 
 
266 aa  276  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.73 
 
 
263 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1372  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.73 
 
 
263 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.167062 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.77 
 
 
284 aa  268  8.999999999999999e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.56 
 
 
263 aa  266  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3204  ParA family protein  51.56 
 
 
263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3043  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.78 
 
 
263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.025517 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.34 
 
 
263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.018865 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  51.19 
 
 
259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  51.19 
 
 
259 aa  265  5.999999999999999e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  52.96 
 
 
258 aa  265  7e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1345  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.38 
 
 
262 aa  265  7e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.78 
 
 
263 aa  264  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2913  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.39 
 
 
263 aa  261  6e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.39 
 
 
263 aa  261  6e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.329595  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.39 
 
 
263 aa  261  6e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3045  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.39 
 
 
263 aa  261  6e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1384  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.63 
 
 
263 aa  254  8e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2274  ParA family protein  49.61 
 
 
263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1641  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.39 
 
 
263 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.61 
 
 
263 aa  251  7e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  48.81 
 
 
255 aa  251  8.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02865  putative ParA family protein  46.83 
 
 
254 aa  249  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.827974  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3025  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.98 
 
 
259 aa  248  6e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1182  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.89 
 
 
268 aa  248  9e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.14884 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1526  parA family protein  45.88 
 
 
262 aa  246  3e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429591  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1205  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.03 
 
 
264 aa  240  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00028  chromosome partioning protein  44.09 
 
 
260 aa  205  5e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.287581  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1856  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.53 
 
 
260 aa  204  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.204496  normal  0.925256 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0777  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.49 
 
 
257 aa  186  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.3 
 
 
258 aa  180  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.71944  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1574  ParA family protein  35.86 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0302854  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1153  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.99 
 
 
258 aa  165  5e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.488153  normal  0.157692 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.88 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  35.38 
 
 
259 aa  163  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  33.98 
 
 
253 aa  162  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  32.68 
 
 
257 aa  162  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  32.68 
 
 
257 aa  162  6e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
284 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35 
 
 
262 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.32 
 
 
257 aa  159  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.14 
 
 
255 aa  156  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  33.2 
 
 
256 aa  156  4e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.75 
 
 
266 aa  155  8e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.81 
 
 
257 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.89 
 
 
253 aa  153  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  31.62 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.5 
 
 
253 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.5 
 
 
253 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.5 
 
 
253 aa  152  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.5 
 
 
253 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  31.5 
 
 
253 aa  152  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.5 
 
 
253 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.5 
 
 
253 aa  152  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.5 
 
 
253 aa  152  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  34.78 
 
 
254 aa  152  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.76 
 
 
255 aa  152  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.5 
 
 
253 aa  152  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  31.1 
 
 
253 aa  150  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  34.38 
 
 
257 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.87 
 
 
253 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.92 
 
 
262 aa  149  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000361786  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.6 
 
 
255 aa  149  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.9 
 
 
253 aa  147  3e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  34.5 
 
 
262 aa  146  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6365  chromosome partitioning protein Soj  34.88 
 
 
262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  30.86 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  34.88 
 
 
262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.16 
 
 
253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.6 
 
 
264 aa  145  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.28 
 
 
253 aa  145  9e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.62 
 
 
274 aa  144  1e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.98 
 
 
270 aa  143  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.55 
 
 
253 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
269 aa  143  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  34.77 
 
 
262 aa  143  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.91 
 
 
254 aa  143  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
298 aa  142  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  32.14 
 
 
262 aa  143  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  31.64 
 
 
253 aa  142  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  32.94 
 
 
253 aa  142  5e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.13 
 
 
259 aa  142  6e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0188  chromosome partitioning protein ParA  30.42 
 
 
260 aa  142  6e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  32.81 
 
 
257 aa  142  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.46 
 
 
254 aa  142  6e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.47 
 
 
262 aa  141  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>