More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4541 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  100 
 
 		 330 aa  657    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7333  cobyrinic acid ac-diamide synthase  82.79 
 
 		 470 aa  503  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946911  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  66.32 
 
 		 333 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  66.32 
 
 		 335 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  66.32 
 
 		 335 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7093  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.58 
 
 		 339 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9384  chromosome partitioning protein; transcriptional regulator  70.38 
 
 		 308 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.09 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4237  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  66.9 
 
 		 304 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4858  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.95 
 
 		 315 aa  375  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6481  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  65.49 
 
 		 314 aa  375  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4978  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  65.14 
 
 		 303 aa  373  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6072  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  64.75 
 
 		 318 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235979 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39740  chromosome segregation ATPase  65.96 
 
 		 341 aa  369  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.485566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4587  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.32 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127465  hitchhiker  0.000606651 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13953  chromosome partitioning protein parA  62.9 
 
 		 347 aa  365  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5105  cobyrinic acid ac-diamide synthase  65.23 
 
 		 437 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000298727 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4507  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  65.2 
 
 		 462 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.013089 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4862  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.67 
 
 		 317 aa  364  1e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229675  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  65.02 
 
 		 301 aa  364  1e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.31 
 
 		 392 aa  363  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0426351  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3589  cobyrinic acid ac-diamide synthase  67.18 
 
 		 346 aa  363  2e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2552  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.59 
 
 		 312 aa  359  3e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000741999  normal  0.352702 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2155  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  67.15 
 
 		 312 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.426789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5090  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.29 
 
 		 358 aa  355  6.999999999999999e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4166  chromosome segregation ATPase  58.05 
 
 		 333 aa  353  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3720  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  66.67 
 
 		 416 aa  352  7e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000821515  hitchhiker  0.000233932 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3111  chromosome segregation ATPase  63.21 
 
 		 345 aa  350  1e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0702646  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4218  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.79 
 
 		 452 aa  350  1e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4694  chromosome segregation ATPase  63.95 
 
 		 361 aa  348  5e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0801275  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31920  chromosome segregation ATPase  66.54 
 
 		 293 aa  348  7e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3373  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.29 
 
 		 410 aa  348  1e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.97 
 
 		 355 aa  346  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146572 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38000  chromosome segregation ATPase  59.2 
 
 		 305 aa  342  5.999999999999999e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23420  chromosome segregation ATPase  60.89 
 
 		 315 aa  333  2e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  64.59 
 
 		 370 aa  333  2e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.35 
 
 		 253 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  56.85 
 
 		 253 aa  295  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1442  chromosome partitioning ATPase  53 
 
 		 323 aa  293  2e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.526471  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0052  sporulation initiation inhibitor protein Soj family protein  54.92 
 
 		 323 aa  291  9e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.4 
 
 		 257 aa  290  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.56 
 
 		 253 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.16 
 
 		 253 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.35 
 
 		 255 aa  285  8e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.94 
 
 		 294 aa  285  9e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  51.18 
 
 		 258 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.16 
 
 		 254 aa  281  1e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  53.54 
 
 		 256 aa  279  5e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  54.76 
 
 		 294 aa  279  6e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  53.57 
 
 		 348 aa  278  6e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.44 
 
 		 253 aa  278  8e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.56 
 
 		 253 aa  278  9e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  53.97 
 
 		 253 aa  277  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.8 
 
 		 253 aa  276  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.2 
 
 		 256 aa  275  7e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  54.76 
 
 		 253 aa  273  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  54.76 
 
 		 253 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  54.76 
 
 		 253 aa  273  3e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  54.76 
 
 		 253 aa  273  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  54.76 
 
 		 253 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  54.76 
 
 		 253 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  54.76 
 
 		 253 aa  273  3e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  54.76 
 
 		 253 aa  273  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  54.76 
 
 		 253 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.84 
 
 		 254 aa  272  5.000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 		 266 aa  271  1e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.99 
 
 		 257 aa  271  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  50.81 
 
 		 249 aa  270  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  53.52 
 
 		 262 aa  270  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  53.75 
 
 		 260 aa  270  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  51.79 
 
 		 257 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.37 
 
 		 253 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  52.02 
 
 		 257 aa  270  2.9999999999999997e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.82 
 
 		 253 aa  269  4e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  50.2 
 
 		 253 aa  269  5e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.17 
 
 		 274 aa  269  5e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.55 
 
 		 262 aa  268  7e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1276  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.64 
 
 		 317 aa  267  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  46.64 
 
 		 256 aa  267  2e-70  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.19 
 
 		 257 aa  267  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  49.8 
 
 		 257 aa  267  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  49.8 
 
 		 257 aa  267  2e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.62 
 
 		 254 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.99 
 
 		 295 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  50.56 
 
 		 273 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.56 
 
 		 273 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.19 
 
 		 257 aa  266  5e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4355  chromosome segregation ATPase  54.98 
 
 		 275 aa  265  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.901478  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.8 
 
 		 255 aa  265  7e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  51.59 
 
 		 254 aa  265  8.999999999999999e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  52.19 
 
 		 257 aa  264  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.79 
 
 		 262 aa  265  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.65 
 
 		 271 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.98 
 
 		 259 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.65 
 
 		 284 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4491  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.98 
 
 		 259 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.38 
 
 		 263 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  45.06 
 
 		 255 aa  264  2e-69  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  51.35 
 
 		 262 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.27 
 
 		 284 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>