More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5090 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_5090  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
358 aa  710    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4587  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  67.24 
 
 
433 aa  386  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127465  hitchhiker  0.000606651 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5105  cobyrinic acid ac-diamide synthase  67.93 
 
 
437 aa  385  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000298727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6481  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  65.44 
 
 
314 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7093  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  67.83 
 
 
339 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39740  chromosome segregation ATPase  65.28 
 
 
341 aa  365  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.485566  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  64.24 
 
 
333 aa  364  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3111  chromosome segregation ATPase  62.05 
 
 
345 aa  364  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0702646  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  64.24 
 
 
335 aa  364  1e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  64.24 
 
 
335 aa  364  1e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.26 
 
 
336 aa  362  4e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6072  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.27 
 
 
318 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.235979 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.76 
 
 
301 aa  358  6e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4237  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.63 
 
 
304 aa  358  6e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4858  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.12 
 
 
315 aa  357  1.9999999999999998e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13953  chromosome partitioning protein parA  61.99 
 
 
347 aa  355  5e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4507  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.67 
 
 
462 aa  350  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.013089 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3589  cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.73 
 
 
346 aa  350  3e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  65.67 
 
 
330 aa  348  7e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4862  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.32 
 
 
317 aa  348  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229675  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9384  chromosome partitioning protein; transcriptional regulator  64.18 
 
 
308 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7333  cobyrinic acid ac-diamide synthase  66.31 
 
 
470 aa  345  6e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946911  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4978  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  65.28 
 
 
303 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4694  chromosome segregation ATPase  66.54 
 
 
361 aa  335  5e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0801275  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2155  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  64.62 
 
 
312 aa  335  5.999999999999999e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.426789  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3373  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.78 
 
 
410 aa  333  3e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.56 
 
 
355 aa  332  7.000000000000001e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146572 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38000  chromosome segregation ATPase  59.66 
 
 
305 aa  329  3e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.76 
 
 
392 aa  328  6e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0426351  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4218  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.45 
 
 
452 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2552  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.03 
 
 
312 aa  325  8.000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000741999  normal  0.352702 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4166  chromosome segregation ATPase  57.88 
 
 
333 aa  325  8.000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23420  chromosome segregation ATPase  61.36 
 
 
315 aa  325  8.000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31920  chromosome segregation ATPase  58.28 
 
 
293 aa  321  9.999999999999999e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3720  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.83 
 
 
416 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000821515  hitchhiker  0.000233932 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  61.3 
 
 
370 aa  317  3e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0052  sporulation initiation inhibitor protein Soj family protein  50.18 
 
 
323 aa  286  4e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1442  chromosome partitioning ATPase  52.98 
 
 
323 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.526471  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  53.31 
 
 
257 aa  281  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.26 
 
 
255 aa  279  5e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.47 
 
 
256 aa  278  1e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.91 
 
 
254 aa  277  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.76 
 
 
253 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.65 
 
 
253 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.71 
 
 
253 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.33 
 
 
253 aa  272  6e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  53.49 
 
 
253 aa  272  8.000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.43 
 
 
294 aa  271  1e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  52.76 
 
 
253 aa  270  2.9999999999999997e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  52.14 
 
 
264 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.16 
 
 
253 aa  269  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  50 
 
 
258 aa  269  5e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.39 
 
 
257 aa  268  8e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  52.51 
 
 
257 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  51.55 
 
 
253 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  51.55 
 
 
253 aa  268  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  51.55 
 
 
253 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  51.55 
 
 
253 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  51.55 
 
 
253 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  51.55 
 
 
253 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  51.55 
 
 
253 aa  268  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  51.55 
 
 
253 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  51.55 
 
 
253 aa  268  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  51.55 
 
 
254 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.19 
 
 
254 aa  266  4e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.38 
 
 
282 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15195 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.16 
 
 
253 aa  265  7e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  49.21 
 
 
249 aa  265  8e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  48.41 
 
 
276 aa  264  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0167  chromosome segregation ATPase  48.53 
 
 
283 aa  264  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1276  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.64 
 
 
317 aa  263  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  51.55 
 
 
285 aa  262  8.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  51.16 
 
 
256 aa  261  1e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.57 
 
 
271 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.19 
 
 
284 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.75 
 
 
295 aa  261  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  52.14 
 
 
253 aa  261  2e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.97 
 
 
257 aa  260  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.46 
 
 
257 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.39 
 
 
254 aa  259  6e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.72 
 
 
267 aa  259  7e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50 
 
 
286 aa  258  8e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 
253 aa  258  8e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.94 
 
 
270 aa  258  9e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.19 
 
 
284 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  51.76 
 
 
258 aa  258  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.19 
 
 
289 aa  257  2e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.19 
 
 
284 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.25 
 
 
257 aa  257  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  50.76 
 
 
268 aa  256  3e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  49.04 
 
 
294 aa  256  3e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  46.3 
 
 
255 aa  256  5e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.31 
 
 
259 aa  256  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4491  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.31 
 
 
259 aa  256  6e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0307  hypothetical protein  44.75 
 
 
262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.285877 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.22 
 
 
264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.63 
 
 
282 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4355  chromosome segregation ATPase  52.49 
 
 
275 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.901478  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.19 
 
 
257 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.47 
 
 
255 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>