More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4858 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4858  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
315 aa  635    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4237  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  78.04 
 
 
304 aa  446  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  70.72 
 
 
336 aa  434  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6072  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  72.79 
 
 
318 aa  436  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.235979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  73.33 
 
 
333 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7093  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  68.11 
 
 
339 aa  428  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  73.33 
 
 
335 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  73.33 
 
 
335 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13953  chromosome partitioning protein parA  70.81 
 
 
347 aa  426  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39740  chromosome segregation ATPase  72.92 
 
 
341 aa  418  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.485566  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9384  chromosome partitioning protein; transcriptional regulator  65.08 
 
 
308 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6481  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  66.67 
 
 
314 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3589  cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.53 
 
 
346 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4978  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.33 
 
 
303 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3111  chromosome segregation ATPase  64.45 
 
 
345 aa  369  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0702646  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  67.04 
 
 
330 aa  368  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4862  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.96 
 
 
317 aa  365  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229675  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.58 
 
 
301 aa  365  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5105  cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.38 
 
 
437 aa  364  1e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000298727 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4587  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.39 
 
 
433 aa  362  6e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127465  hitchhiker  0.000606651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7333  cobyrinic acid ac-diamide synthase  67.42 
 
 
470 aa  360  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946911  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2155  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  67.82 
 
 
312 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.426789  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5090  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.12 
 
 
358 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.54 
 
 
392 aa  352  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0426351  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.06 
 
 
355 aa  349  3e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146572 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3373  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  66.04 
 
 
410 aa  348  6e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4218  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.36 
 
 
452 aa  348  9e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4507  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.92 
 
 
462 aa  347  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.013089 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3720  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.42 
 
 
416 aa  346  3e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000821515  hitchhiker  0.000233932 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4694  chromosome segregation ATPase  62.8 
 
 
361 aa  345  7e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0801275  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4166  chromosome segregation ATPase  63.81 
 
 
333 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38000  chromosome segregation ATPase  64.31 
 
 
305 aa  342  5e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23420  chromosome segregation ATPase  62.31 
 
 
315 aa  335  3.9999999999999995e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2552  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  60 
 
 
312 aa  332  6e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000741999  normal  0.352702 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31920  chromosome segregation ATPase  62.69 
 
 
293 aa  328  9e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  62.74 
 
 
370 aa  322  4e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0052  sporulation initiation inhibitor protein Soj family protein  53.33 
 
 
323 aa  290  3e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.86 
 
 
294 aa  279  4e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.52 
 
 
253 aa  278  7e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.71 
 
 
256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  53.17 
 
 
253 aa  273  3e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  50.4 
 
 
258 aa  272  5.000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.19 
 
 
257 aa  271  1e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  52.51 
 
 
294 aa  271  1e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  54.76 
 
 
253 aa  270  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.45 
 
 
273 aa  269  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1442  chromosome partitioning ATPase  53.01 
 
 
323 aa  269  5e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.526471  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.16 
 
 
254 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.05 
 
 
257 aa  267  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.57 
 
 
253 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.52 
 
 
255 aa  265  7e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  52.57 
 
 
254 aa  264  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.78 
 
 
253 aa  264  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  51.74 
 
 
262 aa  263  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.12 
 
 
253 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.95 
 
 
254 aa  262  4.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.79 
 
 
253 aa  262  6e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  52.92 
 
 
264 aa  261  8.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.72 
 
 
268 aa  261  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  51.19 
 
 
256 aa  261  1e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.73 
 
 
253 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  51.17 
 
 
348 aa  260  2e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  52.55 
 
 
253 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  52.55 
 
 
253 aa  260  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  52.55 
 
 
253 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  52.55 
 
 
253 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  52.55 
 
 
253 aa  260  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  52.55 
 
 
253 aa  260  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  52.55 
 
 
253 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  52.55 
 
 
253 aa  260  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.11 
 
 
282 aa  259  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1276  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.84 
 
 
317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  52.16 
 
 
253 aa  258  7e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.55 
 
 
253 aa  258  8e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.84 
 
 
266 aa  258  1e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  52.94 
 
 
257 aa  256  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.33 
 
 
266 aa  256  4e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.92 
 
 
270 aa  256  5e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.91 
 
 
264 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.36 
 
 
264 aa  255  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  50.6 
 
 
249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.15 
 
 
260 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4355  chromosome segregation ATPase  54.9 
 
 
275 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.901478  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.33 
 
 
264 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  51.15 
 
 
260 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4491  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.9 
 
 
259 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.9 
 
 
259 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0307  hypothetical protein  46.33 
 
 
262 aa  253  3e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.285877 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  49.8 
 
 
257 aa  253  3e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  49.43 
 
 
265 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.98 
 
 
257 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  48.05 
 
 
257 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  48.05 
 
 
257 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  51.16 
 
 
257 aa  252  6e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  51.97 
 
 
270 aa  251  8.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1864  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.57 
 
 
286 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  normal  0.0904624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1585  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.57 
 
 
286 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0495676 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.19 
 
 
284 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.59 
 
 
257 aa  251  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.61 
 
 
269 aa  251  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>