More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_39740 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_39740  chromosome segregation ATPase  100 
 
 
341 aa  689    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.485566  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7093  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  74.45 
 
 
339 aa  456  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4858  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  72.92 
 
 
315 aa  418  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13953  chromosome partitioning protein parA  69.83 
 
 
347 aa  411  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  66.14 
 
 
335 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  66.14 
 
 
335 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  71.02 
 
 
301 aa  401  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4237  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  73.43 
 
 
304 aa  402  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  66.14 
 
 
333 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.7 
 
 
336 aa  395  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6072  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  66.99 
 
 
318 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.235979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6481  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  68.9 
 
 
314 aa  381  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3589  cobyrinic acid ac-diamide synthase  68.05 
 
 
346 aa  368  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4587  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  66.31 
 
 
433 aa  365  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127465  hitchhiker  0.000606651 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  69.47 
 
 
330 aa  365  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5090  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  65.28 
 
 
358 aa  365  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7333  cobyrinic acid ac-diamide synthase  70.61 
 
 
470 aa  364  1e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946911  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3111  chromosome segregation ATPase  57.85 
 
 
345 aa  362  4e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0702646  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5105  cobyrinic acid ac-diamide synthase  65.96 
 
 
437 aa  362  6e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000298727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9384  chromosome partitioning protein; transcriptional regulator  66.79 
 
 
308 aa  359  5e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4862  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.41 
 
 
317 aa  359  5e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229675  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4978  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  66.29 
 
 
303 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4218  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  66.06 
 
 
452 aa  350  2e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3373  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.02 
 
 
410 aa  343  2e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4507  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.67 
 
 
462 aa  342  5e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.013089 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2155  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  66.79 
 
 
312 aa  339  4e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.426789  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.53 
 
 
392 aa  339  5e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0426351  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4694  chromosome segregation ATPase  65.56 
 
 
361 aa  339  5e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0801275  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.91 
 
 
355 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146572 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38000  chromosome segregation ATPase  63.77 
 
 
305 aa  333  3e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3720  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.22 
 
 
416 aa  332  6e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000821515  hitchhiker  0.000233932 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4166  chromosome segregation ATPase  56.55 
 
 
333 aa  332  8e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23420  chromosome segregation ATPase  61.57 
 
 
315 aa  330  2e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  63.57 
 
 
370 aa  327  2.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2552  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.88 
 
 
312 aa  327  2.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000741999  normal  0.352702 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31920  chromosome segregation ATPase  60.62 
 
 
293 aa  307  1.0000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0052  sporulation initiation inhibitor protein Soj family protein  55.88 
 
 
323 aa  296  2e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1442  chromosome partitioning ATPase  55.48 
 
 
323 aa  293  2e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.526471  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.29 
 
 
253 aa  276  5e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.31 
 
 
253 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.18 
 
 
254 aa  271  1e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  50.2 
 
 
258 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  52.99 
 
 
253 aa  269  7e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.15 
 
 
256 aa  267  2e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.94 
 
 
253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.19 
 
 
257 aa  265  7e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.37 
 
 
254 aa  264  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.55 
 
 
255 aa  264  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.74 
 
 
273 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.35 
 
 
294 aa  263  4.999999999999999e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  52.49 
 
 
257 aa  262  6e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.15 
 
 
257 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  51.74 
 
 
253 aa  260  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  50.95 
 
 
257 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.59 
 
 
253 aa  258  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  50.97 
 
 
294 aa  257  2e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  51.75 
 
 
254 aa  257  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  53.26 
 
 
262 aa  257  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  48.43 
 
 
253 aa  256  4e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.99 
 
 
295 aa  256  4e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  50.58 
 
 
253 aa  256  5e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  50.58 
 
 
253 aa  256  5e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  50.58 
 
 
253 aa  256  5e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  50.58 
 
 
253 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  50.58 
 
 
253 aa  256  5e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  50.58 
 
 
253 aa  256  5e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  50.58 
 
 
253 aa  256  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  50.58 
 
 
253 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  50.19 
 
 
253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.58 
 
 
253 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  50.19 
 
 
264 aa  252  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0307  hypothetical protein  46.85 
 
 
262 aa  252  5.000000000000001e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.285877 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.11 
 
 
264 aa  252  5.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.45 
 
 
267 aa  252  7e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  49.24 
 
 
260 aa  252  8.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  49 
 
 
249 aa  251  9.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  47.41 
 
 
257 aa  251  1e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  50.39 
 
 
268 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  50.99 
 
 
261 aa  250  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.57 
 
 
268 aa  250  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  49.41 
 
 
256 aa  250  3e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  45.28 
 
 
255 aa  249  4e-65  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.69 
 
 
264 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.61 
 
 
259 aa  249  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.293601  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.28 
 
 
264 aa  249  5e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.61 
 
 
253 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  49.03 
 
 
268 aa  248  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.69 
 
 
264 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  51.57 
 
 
253 aa  248  1e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.79 
 
 
257 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.39 
 
 
257 aa  247  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  51 
 
 
270 aa  247  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.48 
 
 
273 aa  247  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3196  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.59 
 
 
261 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3521  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.59 
 
 
261 aa  247  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000641788 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  46.85 
 
 
257 aa  246  3e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  46.85 
 
 
257 aa  246  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  48.63 
 
 
348 aa  246  3e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  45.67 
 
 
256 aa  246  4e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  47.19 
 
 
273 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>