More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4199 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4199  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 		 256 aa  521  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000176763 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0076  chromosome segregation ATPase  81.82 
 
 		 256 aa  433  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3782  chromosome segregation ATPase  80.86 
 
 		 257 aa  427  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000230675 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  80.63 
 
 		 254 aa  427  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.808609 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0051  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  77.78 
 
 		 261 aa  427  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0497583  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  81.42 
 
 		 256 aa  426  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.627572  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0029  chromosome segregation ATPase  81.03 
 
 		 256 aa  424  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.158889 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0054  chromosome segregation ATPase  80.63 
 
 		 256 aa  425  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  75.77 
 
 		 304 aa  417  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  77.34 
 
 		 256 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  77.87 
 
 		 259 aa  413  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.293601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  75.78 
 
 		 268 aa  408  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  76.28 
 
 		 261 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3504  chromosome segregation ATPase  76.56 
 
 		 257 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.25082 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3196  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  76.28 
 
 		 261 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3521  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  76.28 
 
 		 261 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000641788 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  74.61 
 
 		 256 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  74.61 
 
 		 256 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  74.61 
 
 		 256 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  74.61 
 
 		 256 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  74.61 
 
 		 256 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  74.61 
 
 		 256 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  74.61 
 
 		 256 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  73.44 
 
 		 256 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3318  sporulation initiation inhibitor protein Soj  74.22 
 
 		 256 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2960  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  73.12 
 
 		 259 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  73.12 
 
 		 259 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0112  cobyrinic acid ac-diamide synthase  73.12 
 
 		 259 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  73.05 
 
 		 263 aa  390  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0017  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  74.7 
 
 		 256 aa  388  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.405459  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3277  chromosome segregation ATPase  72.33 
 
 		 259 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161475  normal  0.418275 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3903  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  73.05 
 
 		 263 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0095  cobyrinic acid ac-diamide synthase  72.73 
 
 		 259 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.740552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0086  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  72.73 
 
 		 259 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.368871  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0096  cobyrinic acid ac-diamide synthase  72.73 
 
 		 259 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.560799  normal  0.715658 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0014  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  75.1 
 
 		 256 aa  385  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386166  hitchhiker  0.000800579 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  71.43 
 
 		 256 aa  380  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.96 
 
 		 270 aa  329  3e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  59.92 
 
 		 262 aa  326  3e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  61.9 
 
 		 261 aa  322  3e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.33 
 
 		 263 aa  319  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  58.73 
 
 		 265 aa  319  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  57.94 
 
 		 263 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.13 
 
 		 263 aa  316  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.94 
 
 		 263 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6365  chromosome partitioning protein Soj  58.33 
 
 		 262 aa  316  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.94 
 
 		 263 aa  316  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  58.33 
 
 		 262 aa  316  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  58.73 
 
 		 263 aa  315  5e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  58.73 
 
 		 262 aa  312  3.9999999999999997e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  59.2 
 
 		 262 aa  311  4.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  57.54 
 
 		 264 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.14 
 
 		 264 aa  298  6e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  54.98 
 
 		 253 aa  297  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  54.33 
 
 		 266 aa  295  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.75 
 
 		 277 aa  294  8e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2596  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.54 
 
 		 251 aa  291  9e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  56.75 
 
 		 265 aa  285  4e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  56.75 
 
 		 273 aa  283  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.75 
 
 		 273 aa  283  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  55.78 
 
 		 262 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.33 
 
 		 259 aa  282  3.0000000000000004e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4471  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.78 
 
 		 255 aa  282  4.0000000000000003e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0387085  hitchhiker  0.00000000187699 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  53.17 
 
 		 257 aa  281  8.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.57 
 
 		 264 aa  281  9e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002021  ParA family protein  52.78 
 
 		 257 aa  280  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000141399  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.55 
 
 		 262 aa  279  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.37 
 
 		 264 aa  278  5e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0305586  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  51.97 
 
 		 268 aa  278  6e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.19 
 
 		 262 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.19 
 
 		 262 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.18 
 
 		 262 aa  276  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.19 
 
 		 262 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.97 
 
 		 263 aa  276  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50 
 
 		 262 aa  275  4e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.79 
 
 		 262 aa  275  5e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  51.59 
 
 		 257 aa  275  6e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  51.2 
 
 		 258 aa  275  6e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2519  ParA family protein  52.38 
 
 		 257 aa  275  6e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.19 
 
 		 262 aa  275  7e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  51.19 
 
 		 262 aa  274  8e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52 
 
 		 257 aa  273  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3966  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.29 
 
 		 265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50 
 
 		 261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  50.79 
 
 		 262 aa  272  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  50.79 
 
 		 262 aa  273  3e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  50.79 
 
 		 262 aa  273  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3854  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.57 
 
 		 262 aa  272  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.460282  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  50.79 
 
 		 257 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  50.39 
 
 		 264 aa  272  4.0000000000000004e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3068  chromosome partitioning protein, sporulation initiation inhibitor protein Soj  50.79 
 
 		 265 aa  271  5.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  50 
 
 		 262 aa  270  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3739  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.83 
 
 		 257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.512562  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.38 
 
 		 257 aa  268  4e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50 
 
 		 278 aa  269  4e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.79 
 
 		 253 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.99 
 
 		 268 aa  268  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2752  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.54 
 
 		 262 aa  268  7e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  52.59 
 
 		 253 aa  268  7e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  52.19 
 
 		 253 aa  267  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>