More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2495 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
258 aa  512  1e-144  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2477  conjugal plasmid transfer ATPase  68.11 
 
 
256 aa  340  1e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.826967  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5560  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.08 
 
 
256 aa  148  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0022  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.62 
 
 
257 aa  145  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.695943  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3388  hypothetical protein  41.6 
 
 
329 aa  143  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.853943  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5825  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.37 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3666  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.08 
 
 
313 aa  138  8.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5494  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.85 
 
 
250 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188231 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.74 
 
 
306 aa  125  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0121  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.23 
 
 
264 aa  122  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.04 
 
 
293 aa  122  5e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.81 
 
 
312 aa  122  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  33.73 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4057  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.05 
 
 
352 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.773684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.04 
 
 
298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.4 
 
 
268 aa  119  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  30.47 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.6 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.62 
 
 
303 aa  118  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.62 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.62 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.62 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.36 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.07 
 
 
255 aa  116  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.93 
 
 
329 aa  117  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.33 
 
 
337 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2981  PHD family antitoxin/ParA family chromosome partitioning ATPase  31.85 
 
 
341 aa  115  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0019  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.89 
 
 
250 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  32.05 
 
 
293 aa  115  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.93 
 
 
329 aa  115  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  31.88 
 
 
332 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.62 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.19 
 
 
367 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.74 
 
 
317 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  34.04 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.19 
 
 
339 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.06 
 
 
302 aa  113  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.17 
 
 
255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  30.12 
 
 
258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.6 
 
 
255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.91 
 
 
294 aa  112  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.08 
 
 
298 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  34.73 
 
 
319 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.22 
 
 
284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  34.39 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  31.49 
 
 
318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  33.73 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2993  chromosome partitioning ATPase  31.49 
 
 
315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  31.9 
 
 
327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  31.35 
 
 
258 aa  109  5e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.05 
 
 
287 aa  109  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3373  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.06 
 
 
410 aa  109  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.71 
 
 
362 aa  108  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
299 aa  108  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.34 
 
 
257 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  28.21 
 
 
348 aa  107  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3948  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.87 
 
 
316 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.056511 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1028  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.55 
 
 
250 aa  106  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.06 
 
 
322 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.36 
 
 
302 aa  106  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.76 
 
 
303 aa  106  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  34.24 
 
 
256 aa  105  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  29.91 
 
 
256 aa  105  5e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  25.58 
 
 
257 aa  105  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  25.58 
 
 
257 aa  105  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0438  putative CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  24.9 
 
 
250 aa  105  6e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.132493  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.77 
 
 
253 aa  105  6e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  32.24 
 
 
259 aa  105  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.02 
 
 
270 aa  105  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.14 
 
 
265 aa  105  8e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1803  ParaA family ATPase  27.56 
 
 
265 aa  104  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.833868  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0277  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.5 
 
 
254 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.287869  normal  0.696383 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  32.2 
 
 
259 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.17 
 
 
253 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.17 
 
 
253 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  31.17 
 
 
253 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  31.17 
 
 
253 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.04 
 
 
257 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.17 
 
 
253 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.17 
 
 
253 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13239  hypothetical protein  33.33 
 
 
266 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.614127  normal  0.5818 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.17 
 
 
253 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.17 
 
 
253 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.86 
 
 
297 aa  103  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.17 
 
 
253 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2365  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.78 
 
 
256 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.909103  normal  0.144806 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0607  ParA family ATPase  28.76 
 
 
251 aa  103  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  26.29 
 
 
249 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.87 
 
 
256 aa  103  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.77 
 
 
253 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  34.31 
 
 
370 aa  102  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.36 
 
 
253 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  28.63 
 
 
255 aa  102  5e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4507  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.7 
 
 
462 aa  102  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.013089 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  32.05 
 
 
259 aa  102  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3976  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.68 
 
 
316 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0294413  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1407  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
267 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1532  SpoOJ regulator protein  28.57 
 
 
260 aa  102  7e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6481  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32 
 
 
314 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.24 
 
 
254 aa  102  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.787744  normal  0.0588103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>