More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0607 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0607  ParA family ATPase  100 
 
 
251 aa  513  1e-144  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  58.37 
 
 
249 aa  301  7.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.16 
 
 
255 aa  296  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.73 
 
 
253 aa  294  8e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.13 
 
 
253 aa  294  9e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  56 
 
 
258 aa  294  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  55.73 
 
 
253 aa  292  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.34 
 
 
253 aa  292  3e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  55.34 
 
 
253 aa  291  8e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  55.34 
 
 
253 aa  291  8e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  55.34 
 
 
253 aa  291  8e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  55.34 
 
 
253 aa  291  8e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  55.34 
 
 
253 aa  291  8e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  55.34 
 
 
253 aa  291  8e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  55.34 
 
 
253 aa  291  8e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  55.34 
 
 
253 aa  291  8e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.55 
 
 
253 aa  289  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.94 
 
 
254 aa  288  8e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.94 
 
 
255 aa  286  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  53.6 
 
 
253 aa  285  4e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.4 
 
 
253 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  53.17 
 
 
256 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  52.99 
 
 
257 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  52.99 
 
 
257 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  52.38 
 
 
255 aa  281  7.000000000000001e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  51.38 
 
 
254 aa  280  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.2 
 
 
257 aa  280  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  54.15 
 
 
260 aa  278  8e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.37 
 
 
254 aa  278  8e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.74 
 
 
282 aa  278  8e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15195 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  52.96 
 
 
253 aa  276  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.37 
 
 
253 aa  276  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.99 
 
 
266 aa  276  2e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.97 
 
 
254 aa  276  3e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.8 
 
 
253 aa  276  3e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.19 
 
 
294 aa  275  4e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.19 
 
 
284 aa  275  5e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  53.6 
 
 
258 aa  273  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  51.57 
 
 
256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  49.6 
 
 
276 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.2 
 
 
262 aa  271  6e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.59 
 
 
257 aa  270  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.98 
 
 
257 aa  270  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  51.39 
 
 
294 aa  269  2e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.59 
 
 
257 aa  270  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.2 
 
 
265 aa  270  2e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  49.6 
 
 
258 aa  270  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  50.4 
 
 
257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  50.79 
 
 
257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.4 
 
 
295 aa  267  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1803  ParaA family ATPase  49.41 
 
 
265 aa  267  1e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.833868  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.6 
 
 
270 aa  267  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  50.79 
 
 
253 aa  267  1e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.6 
 
 
279 aa  266  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.457165  normal  0.438059 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1585  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.02 
 
 
286 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0495676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1864  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.02 
 
 
286 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  normal  0.0904624 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  49.41 
 
 
265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.8 
 
 
253 aa  265  4e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1654  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.02 
 
 
286 aa  265  5e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0980496  normal  0.386611 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  49.4 
 
 
264 aa  265  7e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.03 
 
 
282 aa  265  7e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  49.8 
 
 
265 aa  264  8e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  49.8 
 
 
265 aa  264  8e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  49.01 
 
 
265 aa  265  8e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.2 
 
 
264 aa  264  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.41 
 
 
265 aa  263  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  47.04 
 
 
261 aa  263  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.98 
 
 
255 aa  263  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.44 
 
 
284 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.8 
 
 
265 aa  263  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.83 
 
 
284 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  51.6 
 
 
257 aa  261  4.999999999999999e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0167  chromosome segregation ATPase  48.44 
 
 
283 aa  261  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.41 
 
 
267 aa  261  6e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.19 
 
 
256 aa  261  8e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.05 
 
 
286 aa  260  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.97 
 
 
264 aa  260  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.21 
 
 
262 aa  260  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.05 
 
 
289 aa  260  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.44 
 
 
271 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2752  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.56 
 
 
262 aa  259  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2439  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.22 
 
 
265 aa  259  3e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.6 
 
 
264 aa  259  3e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0305586  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1631  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.4 
 
 
263 aa  258  6e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423414  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1276  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.82 
 
 
317 aa  258  6e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  47.6 
 
 
262 aa  257  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.05 
 
 
284 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  49.81 
 
 
285 aa  257  1e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  50.79 
 
 
273 aa  256  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.2 
 
 
257 aa  256  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  49.4 
 
 
348 aa  256  2e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2605  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.44 
 
 
256 aa  256  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50 
 
 
264 aa  255  4e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5943  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.21 
 
 
252 aa  255  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.41 
 
 
270 aa  255  4e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.81 
 
 
262 aa  255  5e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  47.62 
 
 
264 aa  254  8e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.79 
 
 
256 aa  254  9e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3782  chromosome segregation ATPase  48.41 
 
 
257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000230675 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>