More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2981 on replicon NC_009939
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009939  Dgeo_2981  PHD family antitoxin/ParA family chromosome partitioning ATPase  100 
 
 
341 aa  684    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2477  conjugal plasmid transfer ATPase  32.59 
 
 
256 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.826967  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.85 
 
 
258 aa  129  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3388  hypothetical protein  31.44 
 
 
329 aa  112  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.853943  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5560  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.3 
 
 
256 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3666  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.08 
 
 
313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.94 
 
 
337 aa  105  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.45 
 
 
254 aa  102  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.39 
 
 
367 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5494  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.2 
 
 
250 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188231 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0915  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.58 
 
 
275 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412343  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  34.35 
 
 
319 aa  97.4  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4057  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.23 
 
 
352 aa  95.1  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.773684 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0022  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.06 
 
 
257 aa  93.6  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.695943  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.14 
 
 
302 aa  93.2  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  30.68 
 
 
253 aa  92  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.39 
 
 
293 aa  92  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.92 
 
 
249 aa  92.4  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28 
 
 
303 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.18 
 
 
254 aa  91.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5825  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.06 
 
 
252 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5601  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.21 
 
 
268 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00245173  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28 
 
 
298 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  30.88 
 
 
260 aa  90.1  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.88 
 
 
260 aa  90.1  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.38 
 
 
253 aa  90.1  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  28.57 
 
 
318 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.84 
 
 
279 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.84 
 
 
290 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.01 
 
 
268 aa  90.1  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.84 
 
 
290 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3810  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.12 
 
 
326 aa  89.4  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00797726  normal  0.771866 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  33.65 
 
 
262 aa  89.4  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1397  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.52 
 
 
257 aa  89.4  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000218596  hitchhiker  0.000285063 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 
255 aa  89  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0079  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.52 
 
 
256 aa  88.6  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  26.89 
 
 
257 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  28.52 
 
 
253 aa  89  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1467  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.42 
 
 
274 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.162034  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.67 
 
 
317 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  29.23 
 
 
314 aa  88.2  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.92 
 
 
306 aa  87.8  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3749  hypothetical protein  27.99 
 
 
256 aa  87.8  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.26 
 
 
279 aa  87.4  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.86 
 
 
270 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.78 
 
 
298 aa  87  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.31 
 
 
303 aa  87  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.21 
 
 
329 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.37 
 
 
302 aa  87  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0196  chromosome partitioning protein  31.19 
 
 
256 aa  86.3  6e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.03 
 
 
322 aa  86.7  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4216  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.37 
 
 
322 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.57 
 
 
329 aa  86.3  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5529  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.62 
 
 
258 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.151881 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.25 
 
 
312 aa  85.9  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  36.46 
 
 
259 aa  85.9  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.21 
 
 
299 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2127  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  31.19 
 
 
256 aa  85.9  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.19 
 
 
339 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  36.46 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  35.2 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.39 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1423  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854251  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  28.42 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13239  hypothetical protein  33.04 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.614127  normal  0.5818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4678  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.9 
 
 
267 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993482  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.11 
 
 
294 aa  83.6  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  27.86 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1407  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  28.68 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.44 
 
 
268 aa  83.2  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.83 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.89 
 
 
284 aa  82  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  27.54 
 
 
327 aa  82  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.99 
 
 
255 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4669  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.68 
 
 
280 aa  82  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197131  normal  0.373093 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3569  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.03 
 
 
252 aa  82  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.00440484 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3948  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.85 
 
 
316 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.056511 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.15 
 
 
261 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  29.39 
 
 
258 aa  82  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3786  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.48 
 
 
255 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116138  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3976  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.85 
 
 
316 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0294413  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0121  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.97 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.82 
 
 
257 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.46 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  25.65 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1833  hypothetical protein  36.26 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.214744 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.91 
 
 
362 aa  80.9  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.4 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1789  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.83 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247276  normal  0.400701 
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  26.72 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.92 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0446  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.18 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0237  chromosome partitioning ATPase  31.22 
 
 
279 aa  80.5  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  31.38 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.86 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  26.87 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.37 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>