More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4216 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4216  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 322 aa  648    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0446  cobyrinic acid ac-diamide synthase  85.49 
 
 		 316 aa  533  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0576  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.31 
 
 		 314 aa  362  6e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4840  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.92 
 
 		 337 aa  332  4e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1450  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.92 
 
 		 305 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000235787  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4669  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.42 
 
 		 280 aa  168  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197131  normal  0.373093 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.64 
 
 		 257 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  40.8 
 
 		 262 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.94 
 
 		 273 aa  159  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0051  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.19 
 
 		 261 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0497583  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  40.5 
 
 		 268 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.16 
 
 		 270 aa  156  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.88 
 
 		 304 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0076  chromosome segregation ATPase  38.55 
 
 		 256 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.02 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  38.8 
 
 		 265 aa  155  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.11 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  38.25 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.68 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  37.55 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.13 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  36.57 
 
 		 268 aa  153  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.04 
 
 		 277 aa  153  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  39.13 
 
 		 253 aa  153  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  39.13 
 
 		 253 aa  153  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  39.13 
 
 		 253 aa  153  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  39.13 
 
 		 253 aa  153  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  39.13 
 
 		 253 aa  153  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  39.13 
 
 		 253 aa  153  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  39.13 
 
 		 253 aa  153  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  39.13 
 
 		 253 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  36.14 
 
 		 260 aa  152  5e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  39.13 
 
 		 253 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.98 
 
 		 298 aa  152  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5105  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.85 
 
 		 437 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000298727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  37.85 
 
 		 262 aa  152  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  38.78 
 
 		 263 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4587  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.85 
 
 		 433 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127465  hitchhiker  0.000606651 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  41.11 
 
 		 314 aa  151  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2950  hypothetical protein  38.25 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2804  hypothetical protein  38.25 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  36.74 
 
 		 265 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.53 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.85 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.55 
 
 		 257 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.65 
 
 		 263 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.34 
 
 		 253 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  37.96 
 
 		 330 aa  149  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  34.39 
 
 		 257 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  34.39 
 
 		 257 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.94 
 
 		 256 aa  150  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0054  chromosome segregation ATPase  38.21 
 
 		 256 aa  150  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.95 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  36.95 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.51 
 
 		 298 aa  149  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  37.65 
 
 		 318 aa  149  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.8 
 
 		 303 aa  149  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3504  chromosome segregation ATPase  40.5 
 
 		 257 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.25082 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.4 
 
 		 252 aa  149  7e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.15 
 
 		 257 aa  149  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  38.55 
 
 		 253 aa  149  7e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  37.85 
 
 		 266 aa  149  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4199  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.02 
 
 		 256 aa  149  7e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000176763 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.55 
 
 		 254 aa  149  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.808609 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.69 
 
 		 259 aa  149  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.293601  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  39.76 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  39.76 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  39.76 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6365  chromosome partitioning protein Soj  38.25 
 
 		 262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  39.76 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  39.76 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  34.94 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  38.19 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.89 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.04 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.627572  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.86 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.93 
 
 		 264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  39.76 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0029  chromosome segregation ATPase  38.04 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.158889 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  39.76 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  36.61 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.25 
 
 		 263 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3068  chromosome partitioning protein, sporulation initiation inhibitor protein Soj  35.86 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.61 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.8 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.45 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  38.25 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.61 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  39.02 
 
 		 264 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  36.25 
 
 		 263 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  37.05 
 
 		 264 aa  147  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3903  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.02 
 
 		 263 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.2 
 
 		 268 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7333  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.86 
 
 		 470 aa  146  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946911  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.15 
 
 		 309 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.14 
 
 		 295 aa  146  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.75 
 
 		 253 aa  145  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.26 
 
 		 255 aa  146  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0112  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.53 
 
 		 259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2960  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.53 
 
 		 259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>