More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0076 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0076  chromosome segregation ATPase  100 
 
 
256 aa  525  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  87.75 
 
 
254 aa  471  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.808609 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0051  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  86.21 
 
 
261 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0497583  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0054  chromosome segregation ATPase  86.72 
 
 
256 aa  461  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  86.72 
 
 
256 aa  460  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.627572  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0029  chromosome segregation ATPase  86.33 
 
 
256 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.158889 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  84.5 
 
 
304 aa  454  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  84.77 
 
 
256 aa  452  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  83.2 
 
 
259 aa  446  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.293601  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3782  chromosome segregation ATPase  83.2 
 
 
257 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000230675 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4199  cobyrinic acid ac-diamide synthase  81.82 
 
 
256 aa  433  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000176763 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  76.95 
 
 
263 aa  418  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  76.56 
 
 
256 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  76.56 
 
 
256 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  76.56 
 
 
256 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3903  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  76.56 
 
 
263 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  76.56 
 
 
256 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  76.56 
 
 
256 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  76.56 
 
 
256 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  76.56 
 
 
256 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0112  cobyrinic acid ac-diamide synthase  75.39 
 
 
259 aa  410  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  75.59 
 
 
268 aa  410  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3318  sporulation initiation inhibitor protein Soj  76.17 
 
 
256 aa  411  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  76.95 
 
 
256 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2960  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  75.39 
 
 
259 aa  410  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  75.39 
 
 
259 aa  410  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3277  chromosome segregation ATPase  74.61 
 
 
259 aa  408  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161475  normal  0.418275 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0095  cobyrinic acid ac-diamide synthase  75 
 
 
259 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.740552  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3504  chromosome segregation ATPase  75.98 
 
 
257 aa  408  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.25082 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0096  cobyrinic acid ac-diamide synthase  75.39 
 
 
259 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.560799  normal  0.715658 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0086  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  75.39 
 
 
259 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.368871  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3196  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  74.22 
 
 
261 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3521  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  74.22 
 
 
261 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000641788 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  73.44 
 
 
261 aa  401  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0017  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  74.61 
 
 
256 aa  394  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.405459  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  73.62 
 
 
256 aa  392  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0014  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  73.83 
 
 
256 aa  386  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386166  hitchhiker  0.000800579 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  65.08 
 
 
270 aa  344  7e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.32 
 
 
263 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  60.71 
 
 
261 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  60.32 
 
 
265 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  59.52 
 
 
263 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.52 
 
 
263 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  59.92 
 
 
262 aa  323  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.52 
 
 
263 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.71 
 
 
263 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  60.32 
 
 
263 aa  319  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  59.13 
 
 
262 aa  317  9e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6365  chromosome partitioning protein Soj  59.13 
 
 
262 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  59.52 
 
 
262 aa  316  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  58.43 
 
 
264 aa  311  3.9999999999999997e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.33 
 
 
264 aa  311  6.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  56.97 
 
 
253 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  58.8 
 
 
262 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.33 
 
 
264 aa  302  4.0000000000000003e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0305586  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.95 
 
 
262 aa  295  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.95 
 
 
264 aa  295  4e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.75 
 
 
277 aa  294  8e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2596  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.33 
 
 
251 aa  294  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.16 
 
 
262 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.76 
 
 
262 aa  291  5e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.76 
 
 
262 aa  291  5e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  55.56 
 
 
262 aa  291  5e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.76 
 
 
262 aa  291  5e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.35 
 
 
259 aa  291  6e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.56 
 
 
262 aa  291  7e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002021  ParA family protein  55.16 
 
 
257 aa  291  8e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000141399  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  55.16 
 
 
268 aa  290  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  55.16 
 
 
262 aa  290  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  56.13 
 
 
257 aa  290  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.37 
 
 
262 aa  290  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  55.16 
 
 
262 aa  290  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  55.16 
 
 
262 aa  290  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.76 
 
 
262 aa  290  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.16 
 
 
263 aa  290  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  54.76 
 
 
264 aa  289  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  54.76 
 
 
262 aa  290  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  53.97 
 
 
266 aa  289  3e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.37 
 
 
261 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2519  ParA family protein  54.37 
 
 
257 aa  288  5.0000000000000004e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  55.78 
 
 
262 aa  287  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4471  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.37 
 
 
255 aa  287  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0387085  hitchhiker  0.00000000187699 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  55.91 
 
 
273 aa  286  2e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.91 
 
 
273 aa  286  2e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.15 
 
 
278 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3854  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.95 
 
 
262 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.460282  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  55.56 
 
 
265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  52.4 
 
 
258 aa  282  4.0000000000000003e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2950  hypothetical protein  54.37 
 
 
256 aa  282  5.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3068  chromosome partitioning protein, sporulation initiation inhibitor protein Soj  51.59 
 
 
265 aa  281  5.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2804  hypothetical protein  54.37 
 
 
256 aa  281  8.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  52.99 
 
 
253 aa  276  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.19 
 
 
253 aa  276  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.2 
 
 
268 aa  276  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  50.4 
 
 
249 aa  276  3e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  52.19 
 
 
253 aa  276  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  52.19 
 
 
253 aa  275  4e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  52.19 
 
 
253 aa  275  4e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  52.19 
 
 
253 aa  275  4e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  52.19 
 
 
253 aa  275  4e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>