More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_4010 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  100 
 
 		 266 aa  546  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  68.73 
 
 		 262 aa  371  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  66.92 
 
 		 264 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  69.17 
 
 		 262 aa  364  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6365  chromosome partitioning protein Soj  69.17 
 
 		 262 aa  364  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  66.67 
 
 		 263 aa  363  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  66.67 
 
 		 263 aa  363  1e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  65.9 
 
 		 263 aa  362  4e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  67.59 
 
 		 265 aa  361  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  66.28 
 
 		 263 aa  361  9e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  64.26 
 
 		 264 aa  360  1e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  67.59 
 
 		 263 aa  359  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  67.59 
 
 		 263 aa  359  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  68.77 
 
 		 262 aa  352  2.9999999999999997e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.45 
 
 		 262 aa  349  3e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.45 
 
 		 262 aa  348  3e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.45 
 
 		 262 aa  348  3e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  64.29 
 
 		 261 aa  349  3e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.45 
 
 		 262 aa  348  3e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  63.04 
 
 		 262 aa  348  7e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  63.04 
 
 		 262 aa  348  7e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4471  cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.82 
 
 		 255 aa  347  9e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0387085  hitchhiker  0.00000000187699 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.49 
 
 		 262 aa  347  1e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  63.04 
 
 		 262 aa  347  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  63.39 
 
 		 262 aa  346  3e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.21 
 
 		 262 aa  345  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  62.6 
 
 		 262 aa  345  6e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.39 
 
 		 262 aa  345  6e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  60.15 
 
 		 268 aa  343  2e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  61.63 
 
 		 264 aa  343  2e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  62.65 
 
 		 262 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.1 
 
 		 263 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3854  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  64.29 
 
 		 262 aa  342  5e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.460282  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2519  ParA family protein  60.16 
 
 		 257 aa  340  2e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002021  ParA family protein  61.33 
 
 		 257 aa  340  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000141399  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  60.94 
 
 		 257 aa  338  5.9999999999999996e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  62.8 
 
 		 262 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.49 
 
 		 264 aa  333  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2596  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.3 
 
 		 251 aa  332  3e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.87 
 
 		 278 aa  329  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3739  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.24 
 
 		 257 aa  329  2e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.512562  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  58.11 
 
 		 268 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3068  chromosome partitioning protein, sporulation initiation inhibitor protein Soj  59.45 
 
 		 265 aa  324  1e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3521  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.08 
 
 		 261 aa  323  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000641788 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.4 
 
 		 277 aa  324  1e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  59.13 
 
 		 261 aa  323  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3196  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.13 
 
 		 261 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59 
 
 		 270 aa  322  3e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3504  chromosome segregation ATPase  58.73 
 
 		 257 aa  320  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.25082 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.39 
 
 		 264 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0305586  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  61.6 
 
 		 253 aa  317  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  57.94 
 
 		 261 aa  315  7e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.13 
 
 		 256 aa  311  4.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  58.66 
 
 		 265 aa  311  7.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3966  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.99 
 
 		 265 aa  310  2e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.29 
 
 		 273 aa  309  2.9999999999999997e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  59.29 
 
 		 273 aa  309  2.9999999999999997e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  58.98 
 
 		 262 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0014  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.95 
 
 		 256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386166  hitchhiker  0.000800579 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  57.94 
 
 		 255 aa  305  6e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0017  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.95 
 
 		 256 aa  305  7e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.405459  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0112  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.95 
 
 		 259 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2960  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.95 
 
 		 259 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.95 
 
 		 259 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3277  chromosome segregation ATPase  56.52 
 
 		 259 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161475  normal  0.418275 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3782  chromosome segregation ATPase  54.76 
 
 		 257 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000230675 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  54.37 
 
 		 263 aa  300  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0096  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.56 
 
 		 259 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.560799  normal  0.715658 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0086  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.56 
 
 		 259 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.368871  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0054  chromosome segregation ATPase  55.95 
 
 		 256 aa  299  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0095  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.76 
 
 		 259 aa  298  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.740552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.85 
 
 		 259 aa  298  5e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.293601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3318  sporulation initiation inhibitor protein Soj  55.16 
 
 		 256 aa  298  6e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3903  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.61 
 
 		 263 aa  298  8e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.76 
 
 		 256 aa  298  9e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  55.16 
 
 		 256 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.16 
 
 		 256 aa  297  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.627572  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  55.16 
 
 		 256 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  55.16 
 
 		 256 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2950  hypothetical protein  58.89 
 
 		 256 aa  297  1e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2804  hypothetical protein  58.89 
 
 		 256 aa  297  1e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  55.16 
 
 		 256 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  55.16 
 
 		 256 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  55.16 
 
 		 256 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  55.16 
 
 		 256 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.37 
 
 		 256 aa  296  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.95 
 
 		 254 aa  296  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.808609 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0029  chromosome segregation ATPase  55.16 
 
 		 256 aa  296  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.158889 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4199  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.33 
 
 		 256 aa  295  4e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000176763 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2175  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.14 
 
 		 255 aa  294  1e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000290082  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0196  chromosome partitioning protein  60.78 
 
 		 256 aa  293  1e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0051  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55 
 
 		 261 aa  293  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0497583  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2127  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  60.39 
 
 		 256 aa  293  3e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.86 
 
 		 304 aa  292  5e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  54.58 
 
 		 254 aa  291  9e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0076  chromosome segregation ATPase  53.97 
 
 		 256 aa  289  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.76 
 
 		 257 aa  286  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1397  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.83 
 
 		 257 aa  284  9e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000218596  hitchhiker  0.000285063 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  52.17 
 
 		 257 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.2 
 
 		 266 aa  280  1e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>