More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0446 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0446  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
316 aa  637    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4216  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  84.95 
 
 
322 aa  530  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0576  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.18 
 
 
314 aa  359  4e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4840  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.94 
 
 
337 aa  332  5e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4669  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.62 
 
 
280 aa  170  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197131  normal  0.373093 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1450  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.09 
 
 
305 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000235787  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  40.8 
 
 
262 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.36 
 
 
257 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  38.43 
 
 
268 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0051  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.76 
 
 
261 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0497583  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.87 
 
 
253 aa  160  3e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  40.5 
 
 
268 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.51 
 
 
274 aa  157  2e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0076  chromosome segregation ATPase  39.76 
 
 
256 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  38.31 
 
 
265 aa  156  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.04 
 
 
277 aa  155  6e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.84 
 
 
253 aa  155  8e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.55 
 
 
269 aa  155  9e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  37.15 
 
 
253 aa  155  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  39.84 
 
 
253 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  39.84 
 
 
253 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  39.84 
 
 
253 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  39.84 
 
 
253 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  39.84 
 
 
253 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.37 
 
 
304 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  39.84 
 
 
253 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  39.84 
 
 
253 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.76 
 
 
270 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  39.84 
 
 
253 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  39.84 
 
 
253 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2950  hypothetical protein  37.85 
 
 
256 aa  153  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2804  hypothetical protein  37.85 
 
 
256 aa  153  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3504  chromosome segregation ATPase  41.32 
 
 
257 aa  153  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.25082 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.77 
 
 
273 aa  152  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.92 
 
 
298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  37.85 
 
 
262 aa  152  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  39.76 
 
 
253 aa  152  8e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4199  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.26 
 
 
256 aa  152  8.999999999999999e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000176763 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  34.54 
 
 
258 aa  151  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.55 
 
 
253 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  35.97 
 
 
260 aa  151  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.04 
 
 
253 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0054  chromosome segregation ATPase  39.43 
 
 
256 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.2 
 
 
254 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3068  chromosome partitioning protein, sporulation initiation inhibitor protein Soj  37.05 
 
 
265 aa  150  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  37.45 
 
 
262 aa  151  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.75 
 
 
273 aa  150  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  38.31 
 
 
263 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  37.75 
 
 
273 aa  150  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.15 
 
 
254 aa  150  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.808609 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.65 
 
 
263 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.1 
 
 
259 aa  150  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.293601  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  39.29 
 
 
256 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  39.29 
 
 
256 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  37.45 
 
 
264 aa  149  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  36.59 
 
 
266 aa  149  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  39.29 
 
 
256 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  39.29 
 
 
256 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  39.29 
 
 
256 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  39.29 
 
 
256 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.89 
 
 
256 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  39.29 
 
 
256 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  33.2 
 
 
257 aa  149  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  33.2 
 
 
257 aa  149  6e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.76 
 
 
264 aa  149  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2960  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.15 
 
 
259 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.15 
 
 
259 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0112  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.15 
 
 
259 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.14 
 
 
257 aa  148  9e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6365  chromosome partitioning protein Soj  37.05 
 
 
262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0086  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.31 
 
 
259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.368871  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0096  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.31 
 
 
259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.560799  normal  0.715658 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.45 
 
 
262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.61 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  36.61 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3277  chromosome segregation ATPase  39.15 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161475  normal  0.418275 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  37.14 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  37.05 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.2 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.04 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.627572  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0029  chromosome segregation ATPase  38.04 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.158889 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3782  chromosome segregation ATPase  37.25 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000230675 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  38.46 
 
 
261 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  36.65 
 
 
263 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  37.45 
 
 
265 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.65 
 
 
257 aa  147  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.61 
 
 
263 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0095  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.06 
 
 
259 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.740552  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.65 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2596  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.2 
 
 
251 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3318  sporulation initiation inhibitor protein Soj  38.89 
 
 
256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.75 
 
 
309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.6 
 
 
254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.19 
 
 
298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.73 
 
 
256 aa  146  5e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  37.25 
 
 
318 aa  146  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  39.6 
 
 
319 aa  146  6e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.89 
 
 
252 aa  145  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  36.33 
 
 
258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5105  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.22 
 
 
437 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000298727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>