More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1267 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
293 aa  586  1e-166  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  83.96 
 
 
293 aa  493  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  81.82 
 
 
287 aa  474  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  79.27 
 
 
303 aa  443  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  77.14 
 
 
362 aa  437  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  77.42 
 
 
337 aa  434  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  69.8 
 
 
299 aa  402  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  69.52 
 
 
303 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  67.62 
 
 
332 aa  392  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  67.27 
 
 
367 aa  392  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  71.33 
 
 
290 aa  392  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  67.11 
 
 
314 aa  389  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  66.44 
 
 
327 aa  384  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  72.31 
 
 
339 aa  381  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  67.27 
 
 
302 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  69.92 
 
 
309 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  66.91 
 
 
306 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  65.59 
 
 
322 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  69.88 
 
 
319 aa  371  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  69.71 
 
 
329 aa  369  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  67.17 
 
 
317 aa  366  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  68.75 
 
 
329 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  68.53 
 
 
297 aa  366  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  64.96 
 
 
279 aa  363  1e-99  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  64 
 
 
302 aa  363  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.8 
 
 
303 aa  362  3e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  62.77 
 
 
298 aa  362  6e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4057  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.64 
 
 
352 aa  358  4e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.773684 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.7 
 
 
290 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.7 
 
 
290 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.7 
 
 
279 aa  356  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  66.91 
 
 
312 aa  355  5e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1925  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  66.92 
 
 
307 aa  355  5.999999999999999e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1916  cobyrinic acid ac-diamide synthase  66.54 
 
 
307 aa  354  8.999999999999999e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374804  hitchhiker  0.00135404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2993  chromosome partitioning ATPase  65.33 
 
 
315 aa  352  4e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  63.57 
 
 
318 aa  349  4e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.82 
 
 
298 aa  348  4e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0237  chromosome partitioning ATPase  60.58 
 
 
279 aa  329  3e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  49.19 
 
 
249 aa  260  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.02 
 
 
294 aa  258  1e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.41 
 
 
268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  49.02 
 
 
348 aa  246  2e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  49.02 
 
 
294 aa  244  9.999999999999999e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  51.39 
 
 
255 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.22 
 
 
253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  48.62 
 
 
253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  48.62 
 
 
253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  48.62 
 
 
253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  48.62 
 
 
253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  48.62 
 
 
253 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  48.62 
 
 
253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  48.62 
 
 
253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  48.62 
 
 
253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  48.62 
 
 
253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.99 
 
 
253 aa  242  5e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.74 
 
 
266 aa  242  5e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50 
 
 
264 aa  242  5e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  48.82 
 
 
260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  44.49 
 
 
258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  47.2 
 
 
253 aa  239  4e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  49.4 
 
 
258 aa  239  5e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.43 
 
 
253 aa  239  5e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.04 
 
 
255 aa  239  5.999999999999999e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.41 
 
 
254 aa  238  8e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.42 
 
 
253 aa  237  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  47.04 
 
 
253 aa  237  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.61 
 
 
259 aa  236  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.62 
 
 
253 aa  235  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  44.05 
 
 
255 aa  235  8e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  46.4 
 
 
256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0607  ParA family ATPase  46.25 
 
 
251 aa  234  2.0000000000000002e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5105  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.55 
 
 
437 aa  233  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000298727 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4978  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.45 
 
 
303 aa  232  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  44.44 
 
 
256 aa  232  6e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.51 
 
 
270 aa  232  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.45 
 
 
253 aa  232  6e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.44 
 
 
284 aa  232  6e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1276  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.72 
 
 
317 aa  232  7.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.48 
 
 
254 aa  231  8.000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.83 
 
 
253 aa  231  9e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.61 
 
 
273 aa  231  9e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  47.15 
 
 
370 aa  231  1e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  48.21 
 
 
276 aa  230  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  49.24 
 
 
270 aa  230  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  46.85 
 
 
265 aa  230  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.84 
 
 
274 aa  229  3e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.06 
 
 
253 aa  230  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  46.18 
 
 
257 aa  229  3e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.22 
 
 
263 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.4 
 
 
256 aa  229  4e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  43.7 
 
 
264 aa  229  4e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  47.62 
 
 
263 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.62 
 
 
263 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.01 
 
 
273 aa  229  5e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  49.01 
 
 
273 aa  229  5e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  45.82 
 
 
262 aa  229  6e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  45.7 
 
 
262 aa  228  7e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  45.63 
 
 
254 aa  228  8e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.65 
 
 
256 aa  228  8e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.22 
 
 
263 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>