More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1925 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1925  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
307 aa  626  1e-178  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1916  cobyrinic acid ac-diamide synthase  98.37 
 
 
307 aa  617  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374804  hitchhiker  0.00135404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  79.72 
 
 
309 aa  479  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  68.86 
 
 
302 aa  391  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.91 
 
 
317 aa  385  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  73.52 
 
 
339 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2993  chromosome partitioning ATPase  70.43 
 
 
315 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  70.04 
 
 
319 aa  375  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.76 
 
 
362 aa  376  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  68.82 
 
 
293 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  65.02 
 
 
332 aa  373  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  69.32 
 
 
287 aa  374  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  67.54 
 
 
367 aa  374  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  68.06 
 
 
322 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  68.82 
 
 
303 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  73.23 
 
 
297 aa  368  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  67.28 
 
 
337 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.88 
 
 
298 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  66.92 
 
 
306 aa  365  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.6 
 
 
303 aa  365  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.18 
 
 
302 aa  363  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  65.66 
 
 
299 aa  362  3e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  64.89 
 
 
327 aa  361  7.0000000000000005e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  65.47 
 
 
329 aa  359  3e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  67.18 
 
 
303 aa  356  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  66.29 
 
 
279 aa  355  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  63.03 
 
 
290 aa  355  5e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  66.29 
 
 
290 aa  355  5e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  66.29 
 
 
290 aa  355  5e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  66.92 
 
 
293 aa  355  5.999999999999999e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  67.32 
 
 
329 aa  354  8.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  64.86 
 
 
298 aa  353  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.48 
 
 
312 aa  348  5e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  64.31 
 
 
318 aa  348  5e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4057  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.51 
 
 
352 aa  346  3e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.773684 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  56.54 
 
 
314 aa  331  1e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  57.25 
 
 
279 aa  314  9.999999999999999e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0237  chromosome partitioning ATPase  53.99 
 
 
279 aa  292  4e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  50 
 
 
249 aa  268  5.9999999999999995e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.01 
 
 
268 aa  253  3e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.6 
 
 
294 aa  251  1e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.21 
 
 
255 aa  248  8e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  44.92 
 
 
258 aa  248  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  49.21 
 
 
256 aa  247  1e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.4 
 
 
253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.66 
 
 
264 aa  246  4.9999999999999997e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  47.37 
 
 
294 aa  245  9e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48 
 
 
253 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  48.8 
 
 
253 aa  242  5e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  49.6 
 
 
260 aa  242  5e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.62 
 
 
253 aa  242  7e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  48.02 
 
 
253 aa  240  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  48.02 
 
 
253 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  48.02 
 
 
253 aa  240  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  48.02 
 
 
253 aa  240  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  48.02 
 
 
253 aa  240  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  48.02 
 
 
253 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  48.02 
 
 
253 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  48.02 
 
 
253 aa  240  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  48.02 
 
 
253 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.82 
 
 
253 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.1 
 
 
257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  48.66 
 
 
330 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.82 
 
 
253 aa  239  5e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.59 
 
 
295 aa  237  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.62 
 
 
253 aa  238  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.2 
 
 
254 aa  236  3e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.79 
 
 
253 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.4 
 
 
255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  47.71 
 
 
270 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.64 
 
 
254 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  45.42 
 
 
253 aa  233  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  44.31 
 
 
257 aa  233  3e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.4 
 
 
253 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  47.45 
 
 
253 aa  232  8.000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  43.65 
 
 
262 aa  231  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.4 
 
 
267 aa  230  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0607  ParA family ATPase  44.8 
 
 
251 aa  230  2e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  44.4 
 
 
348 aa  230  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.46 
 
 
257 aa  230  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.4 
 
 
273 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0241  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.64 
 
 
300 aa  230  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.811562  normal  0.0256625 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  44.98 
 
 
258 aa  229  3e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  45.88 
 
 
258 aa  228  1e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.59 
 
 
256 aa  228  1e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.8 
 
 
257 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.44 
 
 
262 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7333  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.77 
 
 
470 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946911  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  45.82 
 
 
261 aa  226  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3068  chromosome partitioning protein, sporulation initiation inhibitor protein Soj  45.38 
 
 
265 aa  226  4e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.02 
 
 
254 aa  226  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.808609 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  44.98 
 
 
268 aa  226  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.43 
 
 
263 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.63 
 
 
263 aa  225  8e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.2 
 
 
256 aa  225  9e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.25 
 
 
255 aa  224  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0076  chromosome segregation ATPase  43.43 
 
 
256 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0029  chromosome segregation ATPase  44 
 
 
256 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.158889 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3196  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.82 
 
 
261 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.18 
 
 
262 aa  224  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>