More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2290 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1319  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  99.66 
 
 		 291 aa  565  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  0.0621083 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2290  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 291 aa  566  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00279341  hitchhiker  0.000107037 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1453  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  93.13 
 
 		 291 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1230  putative chromosome partitioning protein ParA  93.47 
 
 		 291 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  91.41 
 
 		 291 aa  497  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.527182  normal  0.755592 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4142  cobyrinic acid ac-diamide synthase  92.1 
 
 		 291 aa  494  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178725  hitchhiker  0.000102965 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0636  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  83.1 
 
 		 288 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.403916  normal  0.0791917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2333  chromosome partitioning protein  81.38 
 
 		 296 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0999  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  81.72 
 
 		 288 aa  439  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2813  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  78.85 
 
 		 283 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.841667  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0566  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  73.36 
 
 		 294 aa  395  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1666  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  71.01 
 
 		 287 aa  378  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119343  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2994  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.9 
 
 		 280 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3286  cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.08 
 
 		 296 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.04 
 
 		 292 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1534  chromosome partitioning related protein  52.77 
 
 		 286 aa  279  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.475407  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58910  chromosome partitioning related protein  55.56 
 
 		 288 aa  278  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000312998  normal  0.0159267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4437  hypothetical protein  55.72 
 
 		 286 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0643  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.82 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3748  hypothetical protein  43.46 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0605  hypothetical protein  42.05 
 
 		 295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1346  chromosome partitioning-related protein  38.27 
 
 		 288 aa  193  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3375  chromosome partitioning protein  41.11 
 
 		 294 aa  192  6e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1719  chromosome partitioning-related protein  37.5 
 
 		 283 aa  189  2.9999999999999997e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0301  hypothetical protein  39.52 
 
 		 308 aa  186  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000410953 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0480  hypothetical protein  43.73 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4116  hypothetical protein  38.49 
 
 		 308 aa  179  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7414  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.93 
 
 		 462 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.38 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391114 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1494  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.88 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134391  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2274  ParA family protein  37.21 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  36.59 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3204  ParA family protein  33.72 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.82 
 
 		 367 aa  79.3  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.82 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.72 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.88 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.329595  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2913  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.88 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3045  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.88 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.88 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.88 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.72 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1372  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.72 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.167062 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.72 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.018865 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.43 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.73 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5789  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.98 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.45 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0255  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.3 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  29.34 
 
 		 255 aa  75.5  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  32.52 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.46 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5912  plasmid partitioning protein RepA  28.77 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334298  normal  0.0281794 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.42 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3043  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.76 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.025517 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  31.9 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.94 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1384  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.53 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3918  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.13 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.8408  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4224  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.31 
 
 		 260 aa  72  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.323869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13239  hypothetical protein  29.72 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.614127  normal  0.5818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.39 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.58 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1005  ParaA family ATPase  33.55 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.069768 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  28.51 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.71 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0073  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.55 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  28.83 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.15 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  29.47 
 
 		 408 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.66 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.25 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1345  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.46 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  32.85 
 
 		 371 aa  69.3  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.95 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.57 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4544  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.56 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.754048 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2422  ParaA family ATPase  34.19 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.12 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.57 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0396  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.65 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1925  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.69 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.57 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  28.15 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1526  parA family protein  31.11 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429591  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1916  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.27 
 
 		 307 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374804  hitchhiker  0.00135404 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6104  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.26 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.06 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.143789 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.54 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  38.06 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.06 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  30.95 
 
 		 258 aa  67  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3068  chromosome partitioning protein, sporulation initiation inhibitor protein Soj  34.39 
 
 		 265 aa  67  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1029  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.94 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.28814 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.7 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC19  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  32.37 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.433322  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.48 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.85 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  33.71 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>