More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4281 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 407 aa  843    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9001  replication protein A  71.47 
 
 		 399 aa  601  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  67.91 
 
 		 410 aa  591  1e-168  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5873  plasmid partitioning protein RepA  68.8 
 
 		 405 aa  565  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128849  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  67.42 
 
 		 408 aa  555  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5377  plasmid partitioning protein RepA  67.09 
 
 		 405 aa  555  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408708  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4023  ATPase, ParA type  68.56 
 
 		 392 aa  551  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.845906  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4191  cobyrinic acid ac-diamide synthase  68.26 
 
 		 420 aa  551  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.680764 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  68.12 
 
 		 401 aa  549  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4789  cobyrinic acid ac-diamide synthase  67.1 
 
 		 387 aa  541  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.076168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5000  replication protein A  64.46 
 
 		 420 aa  535  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6501  plasmid partitioning protein RepA  63.59 
 
 		 404 aa  532  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  63.33 
 
 		 409 aa  530  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3561  plasmid partitioning protein RepA  65.97 
 
 		 405 aa  531  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  62.37 
 
 		 405 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  62.12 
 
 		 405 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.64 
 
 		 398 aa  513  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  64.16 
 
 		 397 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  62.09 
 
 		 405 aa  510  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  63.12 
 
 		 397 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6017  plasmid partitioning protein RepA  62.86 
 
 		 398 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0237613  normal  0.19813 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.46 
 
 		 404 aa  507  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4671  cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.6 
 
 		 397 aa  504  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7172  plasmid partitioning protein RepA  62.18 
 
 		 398 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300814 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4190  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.9 
 
 		 400 aa  503  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.14 
 
 		 405 aa  503  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.69 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7789  plasmid partitioning protein RepA  63.73 
 
 		 405 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.45198  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4186  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  61.34 
 
 		 394 aa  500  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.04151  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4023  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.71 
 
 		 395 aa  494  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03067  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  58.96 
 
 		 408 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.18 
 
 		 404 aa  487  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.31 
 
 		 408 aa  487  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  55.09 
 
 		 403 aa  464  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.68 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  57.14 
 
 		 397 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0001  putative replication protein A  58.05 
 
 		 408 aa  460  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1104  replication protein RepA  56.89 
 
 		 397 aa  459  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000233941  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4689  plasmid partitioning protein RepA  58.93 
 
 		 402 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10454  normal  0.803552 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6054  plasmid partitioning protein RepA  57.66 
 
 		 398 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4456  cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.91 
 
 		 398 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  57.41 
 
 		 371 aa  433  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5912  plasmid partitioning protein RepA  55 
 
 		 408 aa  422  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334298  normal  0.0281794 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5480  plasmid partitioning protein RepA  51.6 
 
 		 405 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4571  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.56 
 
 		 404 aa  413  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  54.12 
 
 		 408 aa  410  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8198  replication protein A  51.3 
 
 		 403 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4711  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.52 
 
 		 404 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6162  plasmid partitioning protein RepA  51.94 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.49965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.17 
 
 		 400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.99 
 
 		 391 aa  330  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.42 
 
 		 383 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3591  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.68 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5337  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.14 
 
 		 401 aa  214  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5035  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.13 
 
 		 399 aa  202  9e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3918  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.79 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3887  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.32 
 
 		 405 aa  197  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6108  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33 
 
 		 411 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0067  plasmid partition protein A  32.26 
 
 		 406 aa  183  5.0000000000000004e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0035  putative protein sopA  32.08 
 
 		 406 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0002  hypothetical protein  32.26 
 
 		 402 aa  180  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00393773  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4213  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.79 
 
 		 466 aa  179  8e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7204  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.8 
 
 		 383 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.442713 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0078  partitioning protein, ParA  30.07 
 
 		 397 aa  177  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  hitchhiker  0.00231687 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4265  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.51 
 
 		 462 aa  170  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.383224 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2913  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.7 
 
 		 434 aa  168  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.018827  normal  0.268848 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0045  plasmid-partitioning protein SopA  34.05 
 
 		 385 aa  167  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0073  plasmid-partitioning protein SopA  34.05 
 
 		 391 aa  167  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728582 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0007  plasmid-partitioning protein SopA  33.78 
 
 		 391 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0022  plasmid-partitioning protein SopA  34.05 
 
 		 388 aa  167  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.19504  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3692  hypothetical protein  29.9 
 
 		 468 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.576535  normal  0.38395 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1423  ParA family ATPase  29.93 
 
 		 468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273364  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.76 
 
 		 468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.770946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4250  plasmid-partitioning protein SopA  32.83 
 
 		 388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.100676 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3406  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.88 
 
 		 487 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.798032 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4177  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.33 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0009  plasmid-partitioning protein SopA  32.16 
 
 		 388 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0766545 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3855  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.05 
 
 		 463 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.743489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3773  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.59 
 
 		 469 aa  163  6e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4322  hypothetical protein  30.91 
 
 		 435 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.131093 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2483  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  30.91 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.111676  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4082  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.24 
 
 		 484 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.525863  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4242  hypothetical protein  29.7 
 
 		 484 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.514474 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3840  ATPase, ParA type  29.24 
 
 		 484 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535208  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.27 
 
 		 402 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6315  plasmid partitioning ATPase ParA  28.76 
 
 		 396 aa  146  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0183804  normal  0.0975853 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.24 
 
 		 403 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1369  putative ParA-like partition protein  26.8 
 
 		 347 aa  132  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3948  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.79 
 
 		 434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0159296  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.44 
 
 		 303 aa  122  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4366  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.46 
 
 		 399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00100758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4451  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.46 
 
 		 399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.375885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4546  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.46 
 
 		 399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.931063  normal  0.514808 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0095  plasmid partition protein ParA  25.46 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.65 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08267  plasmid partition protein ParA  26.67 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.54 
 
 		 265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.55 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0438  putative CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  28.85 
 
 		 250 aa  113  5e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.132493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>