More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5480 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8198  replication protein A  78.43 
 
 		 403 aa  637    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5480  plasmid partitioning protein RepA  100 
 
 		 405 aa  832    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0001  putative replication protein A  65.23 
 
 		 408 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6017  plasmid partitioning protein RepA  60.05 
 
 		 398 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0237613  normal  0.19813 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7172  plasmid partitioning protein RepA  59.54 
 
 		 398 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300814 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7789  plasmid partitioning protein RepA  59.6 
 
 		 405 aa  501  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.45198  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4571  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.48 
 
 		 404 aa  475  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  56.7 
 
 		 408 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4191  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.19 
 
 		 420 aa  444  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.680764 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4789  cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.58 
 
 		 387 aa  444  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.076168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  51.88 
 
 		 405 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6162  plasmid partitioning protein RepA  55.73 
 
 		 404 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.49965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  52.58 
 
 		 405 aa  441  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4711  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.69 
 
 		 404 aa  441  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  52.58 
 
 		 405 aa  438  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5377  plasmid partitioning protein RepA  53 
 
 		 405 aa  431  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408708  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5000  replication protein A  52.44 
 
 		 420 aa  431  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  53.33 
 
 		 409 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5873  plasmid partitioning protein RepA  53.54 
 
 		 405 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128849  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  52.74 
 
 		 397 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.22 
 
 		 404 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3561  plasmid partitioning protein RepA  52.2 
 
 		 405 aa  420  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  53.52 
 
 		 397 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.6 
 
 		 407 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4671  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.42 
 
 		 397 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9001  replication protein A  50.26 
 
 		 399 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.42 
 
 		 398 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4186  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  50.13 
 
 		 394 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.04151  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6501  plasmid partitioning protein RepA  51.03 
 
 		 404 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.74 
 
 		 397 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4023  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.51 
 
 		 395 aa  396  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03067  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.87 
 
 		 410 aa  395  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4023  ATPase, ParA type  50.39 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.845906  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.25 
 
 		 401 aa  392  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.68 
 
 		 408 aa  388  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  49.48 
 
 		 397 aa  383  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  49.62 
 
 		 408 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.63 
 
 		 404 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4190  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.63 
 
 		 400 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1104  replication protein RepA  48.97 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000233941  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.34 
 
 		 405 aa  376  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  48.84 
 
 		 403 aa  376  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6054  plasmid partitioning protein RepA  51.28 
 
 		 398 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4689  plasmid partitioning protein RepA  49.35 
 
 		 402 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10454  normal  0.803552 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.45 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  45.99 
 
 		 371 aa  354  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  49.23 
 
 		 408 aa  354  2e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4456  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.59 
 
 		 398 aa  353  4e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5912  plasmid partitioning protein RepA  47.33 
 
 		 408 aa  343  4e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334298  normal  0.0281794 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.24 
 
 		 391 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.04 
 
 		 400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5337  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.87 
 
 		 401 aa  202  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3591  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.33 
 
 		 400 aa  202  9e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5035  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.56 
 
 		 399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.08 
 
 		 383 aa  187  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3887  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.06 
 
 		 405 aa  186  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0067  plasmid partition protein A  29.24 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0002  hypothetical protein  31.7 
 
 		 402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00393773  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0035  putative protein sopA  29.13 
 
 		 406 aa  182  6e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0078  partitioning protein, ParA  30.35 
 
 		 397 aa  172  9e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  hitchhiker  0.00231687 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3918  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.62 
 
 		 401 aa  166  9e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6108  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.13 
 
 		 411 aa  162  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7204  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.44 
 
 		 383 aa  160  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.442713 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6315  plasmid partitioning ATPase ParA  28.93 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4177  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.11 
 
 		 387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4322  hypothetical protein  29.01 
 
 		 435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.131093 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2483  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  29.01 
 
 		 435 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.111676  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3406  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 		 487 aa  145  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.798032 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3840  ATPase, ParA type  29.71 
 
 		 484 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535208  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.18 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4082  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.71 
 
 		 484 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.525863  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3773  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.05 
 
 		 469 aa  143  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4242  hypothetical protein  29.71 
 
 		 484 aa  143  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.514474 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4213  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.76 
 
 		 466 aa  142  9e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.85 
 
 		 468 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.770946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1423  ParA family ATPase  27.97 
 
 		 468 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273364  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3692  hypothetical protein  29.1 
 
 		 468 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.576535  normal  0.38395 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4265  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.3 
 
 		 462 aa  140  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.383224 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0045  plasmid-partitioning protein SopA  30.93 
 
 		 385 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4250  plasmid-partitioning protein SopA  30.85 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.100676 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0007  plasmid-partitioning protein SopA  30.75 
 
 		 391 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.77 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.3 
 
 		 397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0183804  normal  0.0975853 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0022  plasmid-partitioning protein SopA  30.93 
 
 		 388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.19504  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0073  plasmid-partitioning protein SopA  30.93 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728582 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3855  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.44 
 
 		 463 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.743489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2913  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.54 
 
 		 434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.018827  normal  0.268848 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0009  plasmid-partitioning protein SopA  28.78 
 
 		 388 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0766545 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1369  putative ParA-like partition protein  32.72 
 
 		 347 aa  127  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3948  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.13 
 
 		 434 aa  119  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0159296  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7549  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.01 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0306552 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.3 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.93 
 
 		 253 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  29.69 
 
 		 259 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  36.57 
 
 		 256 aa  101  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4226  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.97 
 
 		 405 aa  101  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1105  putative plasmid partition protein  27.12 
 
 		 407 aa  100  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.316048  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.3 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07049  hypothetical protein  25.06 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.15 
 
 		 261 aa  100  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0896384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>