More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4689 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4689  plasmid partitioning protein RepA  100 
 
 		 402 aa  837    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10454  normal  0.803552 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  71.39 
 
 		 403 aa  608  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  72.7 
 
 		 397 aa  598  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1104  replication protein RepA  72.45 
 
 		 397 aa  595  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000233941  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4456  cobyrinic acid ac-diamide synthase  72.01 
 
 		 398 aa  566  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6054  plasmid partitioning protein RepA  69.74 
 
 		 398 aa  549  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4190  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  65.45 
 
 		 400 aa  538  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  65.77 
 
 		 371 aa  528  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  61.03 
 
 		 409 aa  500  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6501  plasmid partitioning protein RepA  59.8 
 
 		 404 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.93 
 
 		 407 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9001  replication protein A  59.21 
 
 		 399 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4023  ATPase, ParA type  58.58 
 
 		 392 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.845906  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  56.78 
 
 		 408 aa  448  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5377  plasmid partitioning protein RepA  54.77 
 
 		 405 aa  450  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408708  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5873  plasmid partitioning protein RepA  55.81 
 
 		 405 aa  451  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128849  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.18 
 
 		 410 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4191  cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.03 
 
 		 420 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.680764 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5000  replication protein A  55.53 
 
 		 420 aa  439  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4789  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.15 
 
 		 387 aa  438  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.076168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4186  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  54.52 
 
 		 394 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.04151  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.63 
 
 		 401 aa  434  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.45 
 
 		 404 aa  427  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3561  plasmid partitioning protein RepA  52.71 
 
 		 405 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7172  plasmid partitioning protein RepA  54.35 
 
 		 398 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300814 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.81 
 
 		 408 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7789  plasmid partitioning protein RepA  52.44 
 
 		 405 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.45198  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6017  plasmid partitioning protein RepA  54.35 
 
 		 398 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0237613  normal  0.19813 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.62 
 
 		 405 aa  423  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  54.07 
 
 		 408 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4023  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.97 
 
 		 395 aa  422  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03067  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.28 
 
 		 404 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  50.51 
 
 		 405 aa  415  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  53.02 
 
 		 397 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  53.02 
 
 		 397 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  50.51 
 
 		 405 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.88 
 
 		 397 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4671  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.83 
 
 		 397 aa  413  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.59 
 
 		 398 aa  411  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  50 
 
 		 405 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0001  putative replication protein A  51.55 
 
 		 408 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.44 
 
 		 397 aa  403  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5480  plasmid partitioning protein RepA  49.35 
 
 		 405 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4571  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.37 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5912  plasmid partitioning protein RepA  50.26 
 
 		 408 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334298  normal  0.0281794 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8198  replication protein A  47.41 
 
 		 403 aa  364  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  48.57 
 
 		 408 aa  364  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4711  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.58 
 
 		 404 aa  361  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6162  plasmid partitioning protein RepA  46.32 
 
 		 404 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.49965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.26 
 
 		 400 aa  328  9e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.95 
 
 		 391 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3591  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.3 
 
 		 400 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3887  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.88 
 
 		 405 aa  182  7e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3406  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.54 
 
 		 487 aa  179  7e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.798032 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4213  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.55 
 
 		 466 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5337  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.41 
 
 		 401 aa  176  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.62 
 
 		 383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3692  hypothetical protein  31.55 
 
 		 468 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.576535  normal  0.38395 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5035  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.75 
 
 		 399 aa  169  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.07 
 
 		 468 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.770946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1423  ParA family ATPase  31.07 
 
 		 468 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273364  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3773  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.34 
 
 		 469 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6108  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.51 
 
 		 411 aa  164  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4082  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.27 
 
 		 484 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.525863  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3840  ATPase, ParA type  31.27 
 
 		 484 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535208  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0067  plasmid partition protein A  29.49 
 
 		 406 aa  158  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4242  hypothetical protein  31.44 
 
 		 484 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.514474 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4265  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.77 
 
 		 462 aa  157  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.383224 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0035  putative protein sopA  29.38 
 
 		 406 aa  156  6e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0002  hypothetical protein  29.92 
 
 		 402 aa  155  8e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00393773  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3855  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.88 
 
 		 463 aa  152  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.743489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4322  hypothetical protein  30.73 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.131093 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2483  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  30.73 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.111676  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0078  partitioning protein, ParA  30.68 
 
 		 397 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  hitchhiker  0.00231687 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7204  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.57 
 
 		 383 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.442713 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3918  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.35 
 
 		 401 aa  143  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.31 
 
 		 397 aa  138  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0183804  normal  0.0975853 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2913  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.06 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.018827  normal  0.268848 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0022  plasmid-partitioning protein SopA  28.43 
 
 		 388 aa  133  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.19504  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0045  plasmid-partitioning protein SopA  28.43 
 
 		 385 aa  133  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0073  plasmid-partitioning protein SopA  28.43 
 
 		 391 aa  133  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728582 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0007  plasmid-partitioning protein SopA  28.68 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4250  plasmid-partitioning protein SopA  29.87 
 
 		 388 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.100676 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4177  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.67 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6315  plasmid partitioning ATPase ParA  29.73 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.17 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0009  plasmid-partitioning protein SopA  26.7 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0766545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.03 
 
 		 262 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.17 
 
 		 267 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.58 
 
 		 403 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  44.25 
 
 		 259 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  32.77 
 
 		 253 aa  117  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.04 
 
 		 295 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3373  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.98 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  37.79 
 
 		 256 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.19 
 
 		 257 aa  112  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.86 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 		 253 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.72 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.73 
 
 		 257 aa  110  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>