More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_A1104 on replicon NC_009504
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4456  cobyrinic acid ac-diamide synthase  95.73 
 
 
398 aa  766    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  99.5 
 
 
397 aa  818    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1104  replication protein RepA  100 
 
 
397 aa  823    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000233941  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6054  plasmid partitioning protein RepA  72.29 
 
 
398 aa  585  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  70.95 
 
 
403 aa  578  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4689  plasmid partitioning protein RepA  72.45 
 
 
402 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10454  normal  0.803552 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4190  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  62.79 
 
 
400 aa  513  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  62.8 
 
 
371 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6501  plasmid partitioning protein RepA  59.9 
 
 
404 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  57.43 
 
 
409 aa  485  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9001  replication protein A  58.96 
 
 
399 aa  473  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5377  plasmid partitioning protein RepA  57.32 
 
 
405 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408708  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.89 
 
 
407 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5873  plasmid partitioning protein RepA  57.07 
 
 
405 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128849  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.29 
 
 
401 aa  449  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4789  cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.22 
 
 
387 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.076168  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4191  cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.39 
 
 
420 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.680764 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4023  ATPase, ParA type  57.22 
 
 
392 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.845906  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.29 
 
 
410 aa  436  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4186  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  57.03 
 
 
394 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.04151  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  55.47 
 
 
408 aa  438  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5000  replication protein A  55.78 
 
 
420 aa  438  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.61 
 
 
405 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.99 
 
 
397 aa  431  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4023  cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.23 
 
 
395 aa  432  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03067  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.73 
 
 
398 aa  431  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4671  cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.61 
 
 
397 aa  434  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.28 
 
 
404 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.31 
 
 
408 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7789  plasmid partitioning protein RepA  53.13 
 
 
405 aa  430  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.45198  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  57.1 
 
 
408 aa  431  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  53.77 
 
 
397 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  54.03 
 
 
397 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7172  plasmid partitioning protein RepA  53.03 
 
 
398 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300814 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3561  plasmid partitioning protein RepA  52.35 
 
 
405 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  53.32 
 
 
405 aa  417  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6017  plasmid partitioning protein RepA  52.51 
 
 
398 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0237613  normal  0.19813 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.62 
 
 
404 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  51.51 
 
 
405 aa  411  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.91 
 
 
397 aa  410  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  51.26 
 
 
405 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0001  putative replication protein A  50.66 
 
 
408 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5480  plasmid partitioning protein RepA  48.97 
 
 
405 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  50.39 
 
 
408 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4571  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.16 
 
 
404 aa  367  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5912  plasmid partitioning protein RepA  49.1 
 
 
408 aa  361  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334298  normal  0.0281794 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8198  replication protein A  46.11 
 
 
403 aa  355  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4711  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.19 
 
 
404 aa  351  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6162  plasmid partitioning protein RepA  46.19 
 
 
404 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.49965  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.53 
 
 
391 aa  312  7.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.87 
 
 
400 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3591  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.73 
 
 
400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3887  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.24 
 
 
405 aa  182  9.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6108  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.43 
 
 
411 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3406  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.95 
 
 
487 aa  176  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.798032 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5035  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.01 
 
 
399 aa  172  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5337  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.46 
 
 
401 aa  170  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684044  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4213  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.95 
 
 
466 aa  169  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.33 
 
 
383 aa  169  9e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3692  hypothetical protein  28.3 
 
 
468 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.576535  normal  0.38395 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3840  ATPase, ParA type  29.08 
 
 
484 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535208  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4082  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.02 
 
 
484 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.525863  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4242  hypothetical protein  29.31 
 
 
484 aa  163  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.514474 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1423  ParA family ATPase  27.58 
 
 
468 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273364  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.58 
 
 
468 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.770946  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3773  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.82 
 
 
469 aa  161  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200831  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4265  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.11 
 
 
462 aa  159  9e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.383224 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0067  plasmid partition protein A  29.61 
 
 
406 aa  156  7e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3855  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.4 
 
 
463 aa  156  8e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.743489  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7204  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.16 
 
 
383 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.442713 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0078  partitioning protein, ParA  29.1 
 
 
397 aa  155  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  hitchhiker  0.00231687 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0035  putative protein sopA  29.5 
 
 
406 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4322  hypothetical protein  28.88 
 
 
435 aa  152  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.131093 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2483  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  28.88 
 
 
435 aa  152  8e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.111676  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0002  hypothetical protein  30.13 
 
 
402 aa  150  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00393773  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3918  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.79 
 
 
401 aa  147  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2913  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.16 
 
 
434 aa  146  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.018827  normal  0.268848 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.97 
 
 
397 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0183804  normal  0.0975853 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4250  plasmid-partitioning protein SopA  31.09 
 
 
388 aa  136  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.100676 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.29 
 
 
402 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199192  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.79 
 
 
403 aa  136  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0007  plasmid-partitioning protein SopA  29.35 
 
 
391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0045  plasmid-partitioning protein SopA  29.35 
 
 
385 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257222  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0073  plasmid-partitioning protein SopA  29.35 
 
 
391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000728582 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0022  plasmid-partitioning protein SopA  29.35 
 
 
388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.19504  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0009  plasmid-partitioning protein SopA  27.34 
 
 
388 aa  126  7e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0766545 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6315  plasmid partitioning ATPase ParA  30.11 
 
 
396 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1369  putative ParA-like partition protein  29.43 
 
 
347 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3948  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.86 
 
 
434 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0159296  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0095  plasmid partition protein ParA  26.65 
 
 
399 aa  113  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4451  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.23 
 
 
399 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.375885  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4546  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.23 
 
 
399 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.931063  normal  0.514808 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.28 
 
 
253 aa  112  9e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4177  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.41 
 
 
387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4366  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.11 
 
 
399 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00100758  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.76 
 
 
295 aa  111  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.18 
 
 
262 aa  109  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.66 
 
 
261 aa  109  9.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0896384  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1526  parA family protein  41.92 
 
 
262 aa  109  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429591  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.53 
 
 
253 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>