More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3692 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3692  hypothetical protein  100 
 
 		 468 aa  959    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.576535  normal  0.38395 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1423  ParA family ATPase  96.58 
 
 		 468 aa  933    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273364  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3855  cobyrinic acid ac-diamide synthase  69.09 
 
 		 463 aa  655    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.743489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4265  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  69.66 
 
 		 462 aa  651    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.383224 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3773  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  70.07 
 
 		 469 aa  671    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3406  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  80.57 
 
 		 487 aa  782    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.798032 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4242  hypothetical protein  71.62 
 
 		 484 aa  665    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.514474 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3840  ATPase, ParA type  71.84 
 
 		 484 aa  667    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535208  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4082  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  71.52 
 
 		 484 aa  668    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.525863  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  96.37 
 
 		 468 aa  933    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.770946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4213  cobyrinic acid ac-diamide synthase  81.11 
 
 		 466 aa  753    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2483  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  37.84 
 
 		 435 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.111676  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4322  hypothetical protein  37.84 
 
 		 435 aa  255  9e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.131093 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2913  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.34 
 
 		 434 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.018827  normal  0.268848 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  33.25 
 
 		 371 aa  189  8e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  31.31 
 
 		 405 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  31.45 
 
 		 405 aa  177  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  31.85 
 
 		 408 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.41 
 
 		 404 aa  173  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  30.66 
 
 		 408 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  28.99 
 
 		 405 aa  172  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4023  ATPase, ParA type  31.05 
 
 		 392 aa  170  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.845906  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  31.14 
 
 		 408 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4789  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.45 
 
 		 387 aa  168  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.076168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 		 404 aa  167  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.9 
 
 		 407 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9001  replication protein A  30.6 
 
 		 399 aa  166  8e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5000  replication protein A  28.6 
 
 		 420 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3561  plasmid partitioning protein RepA  29.27 
 
 		 405 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.36 
 
 		 400 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1104  replication protein RepA  28.3 
 
 		 397 aa  164  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000233941  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5873  plasmid partitioning protein RepA  29.93 
 
 		 405 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128849  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  28.3 
 
 		 397 aa  163  6e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  30.07 
 
 		 409 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.45 
 
 		 410 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.44 
 
 		 401 aa  160  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5377  plasmid partitioning protein RepA  29.55 
 
 		 405 aa  160  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408708  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.59 
 
 		 398 aa  160  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.71 
 
 		 397 aa  159  8e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4671  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.19 
 
 		 397 aa  159  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.76 
 
 		 391 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6054  plasmid partitioning protein RepA  30.28 
 
 		 398 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5912  plasmid partitioning protein RepA  29.55 
 
 		 408 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334298  normal  0.0281794 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4689  plasmid partitioning protein RepA  31.55 
 
 		 402 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10454  normal  0.803552 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  28.22 
 
 		 403 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6501  plasmid partitioning protein RepA  28.95 
 
 		 404 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4186  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  30.71 
 
 		 394 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.04151  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4711  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.12 
 
 		 404 aa  152  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4190  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.94 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.77 
 
 		 397 aa  151  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0183804  normal  0.0975853 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4191  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.64 
 
 		 420 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.680764 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.13 
 
 		 405 aa  150  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  29.2 
 
 		 397 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4571  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.5 
 
 		 404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.81 
 
 		 397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6108  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.3 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  28.99 
 
 		 397 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0078  partitioning protein, ParA  29.66 
 
 		 397 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  hitchhiker  0.00231687 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4456  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.71 
 
 		 398 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7204  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.28 
 
 		 383 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.442713 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.96 
 
 		 408 aa  145  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0001  putative replication protein A  29 
 
 		 408 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3591  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.37 
 
 		 400 aa  143  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4023  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.39 
 
 		 395 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03067  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5480  plasmid partitioning protein RepA  29.1 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6162  plasmid partitioning protein RepA  31.82 
 
 		 404 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.49965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8198  replication protein A  28.43 
 
 		 403 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5337  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.61 
 
 		 401 aa  137  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7172  plasmid partitioning protein RepA  29.05 
 
 		 398 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300814 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6017  plasmid partitioning protein RepA  29.75 
 
 		 398 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0237613  normal  0.19813 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.82 
 
 		 383 aa  133  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7789  plasmid partitioning protein RepA  27.31 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.45198  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5035  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.62 
 
 		 399 aa  131  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6315  plasmid partitioning ATPase ParA  28.31 
 
 		 396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0002  hypothetical protein  26.21 
 
 		 402 aa  127  5e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00393773  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0035  putative protein sopA  25.18 
 
 		 406 aa  118  3e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0067  plasmid partition protein A  25.18 
 
 		 406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.38 
 
 		 402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3918  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.95 
 
 		 401 aa  113  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3887  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.88 
 
 		 405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.34 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.79 
 
 		 306 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.67 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1369  putative ParA-like partition protein  29.08 
 
 		 347 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3948  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.57 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0159296  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4177  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.18 
 
 		 387 aa  103  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.3 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.3 
 
 		 303 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.94 
 
 		 312 aa  101  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  31.8 
 
 		 256 aa  101  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4250  plasmid-partitioning protein SopA  27.96 
 
 		 388 aa  100  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.100676 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 		 290 aa  99.8  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 		 290 aa  99.8  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.18 
 
 		 295 aa  99.4  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.46 
 
 		 265 aa  99.4  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 		 279 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.56 
 
 		 265 aa  98.6  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  28.99 
 
 		 265 aa  98.6  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.67 
 
 		 253 aa  98.6  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0009  plasmid-partitioning protein SopA  29.18 
 
 		 388 aa  98.6  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0766545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>