More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5337 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5337  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 		 401 aa  817    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5035  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  62.97 
 
 		 399 aa  506  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.55 
 
 		 383 aa  342  8e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3591  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.11 
 
 		 400 aa  331  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3918  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.29 
 
 		 401 aa  314  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3561  plasmid partitioning protein RepA  37.96 
 
 		 405 aa  237  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  36.31 
 
 		 408 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.67 
 
 		 404 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.23 
 
 		 410 aa  216  5e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  35.6 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4789  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.68 
 
 		 387 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.076168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.14 
 
 		 407 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6017  plasmid partitioning protein RepA  36.93 
 
 		 398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0237613  normal  0.19813 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9001  replication protein A  33.7 
 
 		 399 aa  212  9e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  35.34 
 
 		 405 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5873  plasmid partitioning protein RepA  35.68 
 
 		 405 aa  210  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128849  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5377  plasmid partitioning protein RepA  35.85 
 
 		 405 aa  209  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408708  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  34.4 
 
 		 405 aa  208  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0007  plasmid-partitioning protein SopA  33.42 
 
 		 391 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7172  plasmid partitioning protein RepA  35.75 
 
 		 398 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300814 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.96 
 
 		 398 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0001  putative replication protein A  33.91 
 
 		 408 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0022  plasmid-partitioning protein SopA  33.69 
 
 		 388 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.19504  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0073  plasmid-partitioning protein SopA  33.08 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728582 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.51 
 
 		 401 aa  203  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0045  plasmid-partitioning protein SopA  34.44 
 
 		 385 aa  203  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5480  plasmid partitioning protein RepA  33.87 
 
 		 405 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4671  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.06 
 
 		 397 aa  202  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4250  plasmid-partitioning protein SopA  35.26 
 
 		 388 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.100676 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4191  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.86 
 
 		 420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.680764 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5912  plasmid partitioning protein RepA  36.27 
 
 		 408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334298  normal  0.0281794 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  33.6 
 
 		 397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4023  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 395 aa  197  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03067  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0078  partitioning protein, ParA  31.3 
 
 		 397 aa  196  6e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  hitchhiker  0.00231687 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0009  plasmid-partitioning protein SopA  35.14 
 
 		 388 aa  196  7e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0766545 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  32.79 
 
 		 397 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7789  plasmid partitioning protein RepA  32.59 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.45198  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4186  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  33.06 
 
 		 394 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.04151  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  33.51 
 
 		 409 aa  194  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5000  replication protein A  32.98 
 
 		 420 aa  194  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.79 
 
 		 397 aa  193  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6501  plasmid partitioning protein RepA  33.42 
 
 		 404 aa  193  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4571  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.87 
 
 		 404 aa  192  6e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4711  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.42 
 
 		 404 aa  192  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.7 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  34.93 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6108  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.11 
 
 		 411 aa  189  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4023  ATPase, ParA type  33.06 
 
 		 392 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.845906  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8198  replication protein A  31.45 
 
 		 403 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7204  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.89 
 
 		 383 aa  186  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.442713 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  30.79 
 
 		 408 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6162  plasmid partitioning protein RepA  33.25 
 
 		 404 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.49965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3948  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.83 
 
 		 434 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0159296  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.22 
 
 		 404 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 		 400 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.42 
 
 		 397 aa  177  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4190  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.45 
 
 		 400 aa  176  8e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  30.73 
 
 		 397 aa  173  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.81 
 
 		 391 aa  173  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6054  plasmid partitioning protein RepA  31.9 
 
 		 398 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  31.18 
 
 		 371 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.15 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1104  replication protein RepA  30.46 
 
 		 397 aa  170  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000233941  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4177  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.66 
 
 		 387 aa  166  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  29.79 
 
 		 403 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4689  plasmid partitioning protein RepA  31.41 
 
 		 402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10454  normal  0.803552 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.35 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6315  plasmid partitioning ATPase ParA  30.61 
 
 		 396 aa  160  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4456  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.46 
 
 		 398 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.59 
 
 		 397 aa  156  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0183804  normal  0.0975853 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0035  putative protein sopA  28.75 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0067  plasmid partition protein A  28.5 
 
 		 406 aa  152  7e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0002  hypothetical protein  27.89 
 
 		 402 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00393773  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4213  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.46 
 
 		 466 aa  144  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3406  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.68 
 
 		 487 aa  139  7e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.798032 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.95 
 
 		 403 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1423  ParA family ATPase  33.43 
 
 		 468 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273364  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3692  hypothetical protein  33.61 
 
 		 468 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.576535  normal  0.38395 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.61 
 
 		 468 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.770946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3773  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.83 
 
 		 469 aa  136  8e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1369  putative ParA-like partition protein  28.31 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3887  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.42 
 
 		 405 aa  134  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7549  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.28 
 
 		 403 aa  133  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0306552 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4265  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.68 
 
 		 462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.383224 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3855  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.97 
 
 		 463 aa  127  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.743489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3840  ATPase, ParA type  31.64 
 
 		 484 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535208  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4082  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.64 
 
 		 484 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.525863  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4242  hypothetical protein  31.07 
 
 		 484 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.514474 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4322  hypothetical protein  27.21 
 
 		 435 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.131093 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2483  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  27.21 
 
 		 435 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.111676  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2913  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.92 
 
 		 434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.018827  normal  0.268848 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1526  parA family protein  35.33 
 
 		 262 aa  95.9  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429591  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3898  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.45 
 
 		 316 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475891  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  35.87 
 
 		 259 aa  95.5  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07049  hypothetical protein  24.87 
 
 		 405 aa  95.5  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.92 
 
 		 287 aa  94.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0130  ParA family protein  24.12 
 
 		 407 aa  94  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.81 
 
 		 299 aa  93.6  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1105  putative plasmid partition protein  23.72 
 
 		 407 aa  93.6  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.316048  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5239  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.04 
 
 		 259 aa  93.6  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000091984  hitchhiker  0.0000000000884158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>