More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0130 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0130  ParA family protein  100 
 
 		 407 aa  853    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000993  chromosome (plasmid) partitioning protein ParA  91.36 
 
 		 405 aa  781    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07049  hypothetical protein  90.86 
 
 		 405 aa  776    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1105  putative plasmid partition protein  84.2 
 
 		 407 aa  726    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.316048  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0126  putative plasmid partition protein ParA  29.51 
 
 		 401 aa  155  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.75003e-18 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4226  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.09 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0095  plasmid partition protein ParA  26.57 
 
 		 399 aa  122  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4546  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.57 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.931063  normal  0.514808 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4451  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.57 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.375885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4366  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.27 
 
 		 399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00100758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08267  plasmid partition protein ParA  24.34 
 
 		 399 aa  119  9e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0052  plasmid segregation protein  27.48 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_40  putative plasmid partition protein A  28.18 
 
 		 398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0786785  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  26.46 
 
 		 409 aa  110  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9001  replication protein A  23.6 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5000  replication protein A  27.18 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6501  plasmid partitioning protein RepA  25.3 
 
 		 404 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4191  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.69 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.680764 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.3 
 
 		 404 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  25 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.86 
 
 		 400 aa  99.8  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6315  plasmid partitioning ATPase ParA  25.13 
 
 		 396 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5912  plasmid partitioning protein RepA  26.11 
 
 		 408 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334298  normal  0.0281794 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.65 
 
 		 404 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.59 
 
 		 383 aa  97.1  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  23.13 
 
 		 408 aa  97.1  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4571  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.37 
 
 		 404 aa  97.1  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.91 
 
 		 397 aa  96.7  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3561  plasmid partitioning protein RepA  23.75 
 
 		 405 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.54 
 
 		 407 aa  96.3  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4671  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.88 
 
 		 397 aa  95.1  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  24.62 
 
 		 397 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5480  plasmid partitioning protein RepA  26.13 
 
 		 405 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.15 
 
 		 401 aa  95.1  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.73 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6054  plasmid partitioning protein RepA  25 
 
 		 398 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4789  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.36 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.076168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5337  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.12 
 
 		 401 aa  94  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3591  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.3 
 
 		 400 aa  93.6  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  24.87 
 
 		 397 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  23.98 
 
 		 405 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  23.15 
 
 		 405 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5035  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.67 
 
 		 399 aa  92.8  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4023  ATPase, ParA type  25 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.845906  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.12 
 
 		 408 aa  90.9  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4186  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  26.05 
 
 		 394 aa  90.5  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.04151  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  27 
 
 		 408 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.06 
 
 		 405 aa  89.7  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.15 
 
 		 398 aa  89.7  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7172  plasmid partitioning protein RepA  24.43 
 
 		 398 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300814 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4711  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.41 
 
 		 404 aa  89.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  23.63 
 
 		 408 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  26.33 
 
 		 397 aa  88.6  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1104  replication protein RepA  26.33 
 
 		 397 aa  88.6  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000233941  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.32 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4023  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 		 395 aa  89  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03067  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  25.41 
 
 		 371 aa  87.4  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5377  plasmid partitioning protein RepA  23.63 
 
 		 405 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408708  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6017  plasmid partitioning protein RepA  23.87 
 
 		 398 aa  86.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0237613  normal  0.19813 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6108  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.32 
 
 		 411 aa  86.3  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.43 
 
 		 397 aa  86.3  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0183804  normal  0.0975853 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8198  replication protein A  24.92 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0001  putative replication protein A  22.88 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5873  plasmid partitioning protein RepA  23.82 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128849  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  31.28 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.53 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3887  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.59 
 
 		 405 aa  82.8  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3918  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.34 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  26.15 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1276  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.07 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4190  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.62 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3773  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.37 
 
 		 469 aa  80.9  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.51 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  27.13 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1410  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.73 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  24.75 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6162  plasmid partitioning protein RepA  27.45 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.49965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.51 
 
 		 253 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  27.24 
 
 		 265 aa  79.3  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4978  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.34 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.86 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0112  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.92 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.37 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2960  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.92 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.27 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.92 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7789  plasmid partitioning protein RepA  24.57 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.45198  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3277  chromosome segregation ATPase  27.5 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161475  normal  0.418275 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0096  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.08 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.560799  normal  0.715658 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  27.76 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3855  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.08 
 
 		 463 aa  77  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.743489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4213  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.16 
 
 		 466 aa  76.6  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.33 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4265  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.11 
 
 		 462 aa  76.6  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.383224 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  25.83 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.51 
 
 		 273 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  28.1 
 
 		 264 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  25.94 
 
 		 257 aa  76.3  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.34 
 
 		 262 aa  75.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>