More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000993 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_07049  hypothetical protein  97.53 
 
 		 405 aa  825    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1105  putative plasmid partition protein  83.46 
 
 		 407 aa  716    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.316048  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0130  ParA family protein  91.36 
 
 		 407 aa  781    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000993  chromosome (plasmid) partitioning protein ParA  100 
 
 		 405 aa  846    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0126  putative plasmid partition protein ParA  28.53 
 
 		 401 aa  157  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.75003e-18 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4226  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.13 
 
 		 405 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0052  plasmid segregation protein  28.8 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0095  plasmid partition protein ParA  27.08 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4546  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.08 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.931063  normal  0.514808 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08267  plasmid partition protein ParA  28.44 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4451  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.08 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.375885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4366  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.79 
 
 		 399 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00100758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_40  putative plasmid partition protein A  29.73 
 
 		 398 aa  124  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0786785  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5000  replication protein A  27.69 
 
 		 420 aa  113  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  26.13 
 
 		 409 aa  112  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9001  replication protein A  24.74 
 
 		 399 aa  109  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6501  plasmid partitioning protein RepA  24.82 
 
 		 404 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3561  plasmid partitioning protein RepA  23.58 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.37 
 
 		 404 aa  104  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4191  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.25 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.680764 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.61 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5035  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.52 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  26.01 
 
 		 405 aa  99.8  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4789  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.33 
 
 		 387 aa  99.8  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.076168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.9 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5480  plasmid partitioning protein RepA  24.14 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6315  plasmid partitioning ATPase ParA  25.2 
 
 		 396 aa  98.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.06 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5912  plasmid partitioning protein RepA  28.34 
 
 		 408 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334298  normal  0.0281794 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.08 
 
 		 407 aa  97.1  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.06 
 
 		 408 aa  96.7  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4186  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  25.58 
 
 		 394 aa  96.3  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.04151  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25 
 
 		 401 aa  95.9  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  23.89 
 
 		 408 aa  96.3  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  24.55 
 
 		 397 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  24.55 
 
 		 397 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.11 
 
 		 398 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.67 
 
 		 397 aa  94.4  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4023  ATPase, ParA type  24.15 
 
 		 392 aa  94.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.845906  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5377  plasmid partitioning protein RepA  23.94 
 
 		 405 aa  94  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408708  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6108  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.12 
 
 		 411 aa  93.6  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  23.84 
 
 		 405 aa  93.6  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.36 
 
 		 383 aa  93.2  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5337  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.62 
 
 		 401 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.75 
 
 		 410 aa  92.4  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4671  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.54 
 
 		 397 aa  92.8  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0001  putative replication protein A  23.2 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4571  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.08 
 
 		 404 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  23.3 
 
 		 405 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  24.15 
 
 		 408 aa  92  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  27.04 
 
 		 397 aa  91.3  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6017  plasmid partitioning protein RepA  24.69 
 
 		 398 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0237613  normal  0.19813 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  24.68 
 
 		 371 aa  90.9  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1104  replication protein RepA  27.04 
 
 		 397 aa  91.3  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000233941  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3591  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.06 
 
 		 400 aa  90.9  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.46 
 
 		 405 aa  89.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  26.21 
 
 		 408 aa  89  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7172  plasmid partitioning protein RepA  25.26 
 
 		 398 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300814 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.98 
 
 		 397 aa  88.6  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0183804  normal  0.0975853 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5873  plasmid partitioning protein RepA  24.14 
 
 		 405 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128849  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6054  plasmid partitioning protein RepA  25.07 
 
 		 398 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4023  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.9 
 
 		 395 aa  87  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03067  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4711  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.63 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3887  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.56 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.76 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3773  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.7 
 
 		 469 aa  84.3  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1276  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.13 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4190  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.68 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  26.24 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  30.77 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.34 
 
 		 253 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8198  replication protein A  24.68 
 
 		 403 aa  82.8  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  23.79 
 
 		 403 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  27.38 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.17 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.75 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.28 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  27.5 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7789  plasmid partitioning protein RepA  23.36 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.45198  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.02 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  27.53 
 
 		 265 aa  79.3  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.09 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  28.16 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4265  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.87 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.383224 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4978  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.99 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  27.41 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  27.2 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.23 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0112  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.5 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2798  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.41 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.519748  normal  0.161878 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2960  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.5 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.5 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.1 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6162  plasmid partitioning protein RepA  26.62 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.49965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3277  chromosome segregation ATPase  27.08 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161475  normal  0.418275 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.06 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3318  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.33 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.02 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.85 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.88 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.949249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>