More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0052 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0052  plasmid segregation protein  100 
 
 		 399 aa  826    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0126  putative plasmid partition protein ParA  57.87 
 
 		 401 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.75003e-18 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4226  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.16 
 
 		 405 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07049  hypothetical protein  28.89 
 
 		 405 aa  158  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000993  chromosome (plasmid) partitioning protein ParA  28.8 
 
 		 405 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0130  ParA family protein  27.76 
 
 		 407 aa  142  8e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1105  putative plasmid partition protein  26.67 
 
 		 407 aa  130  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.316048  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0078  partitioning protein, ParA  25.23 
 
 		 397 aa  87.4  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  hitchhiker  0.00231687 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0022  plasmid-partitioning protein SopA  24.85 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.19504  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6315  plasmid partitioning ATPase ParA  24.16 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0035  putative protein sopA  28.16 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0045  plasmid-partitioning protein SopA  24.85 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0067  plasmid partition protein A  28.16 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0073  plasmid-partitioning protein SopA  24.85 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728582 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0007  plasmid-partitioning protein SopA  25.15 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4546  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.92 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.931063  normal  0.514808 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4451  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.92 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.375885  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0095  plasmid partition protein ParA  27.92 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4366  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.92 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00100758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08267  plasmid partition protein ParA  28.25 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0002  hypothetical protein  25.09 
 
 		 402 aa  72.8  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00393773  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1526  parA family protein  28.27 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429591  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.67 
 
 		 273 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1369  putative ParA-like partition protein  29.06 
 
 		 347 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8198  replication protein A  25.35 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4250  plasmid-partitioning protein SopA  24.7 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.100676 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.13 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.9 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0009  plasmid-partitioning protein SopA  24.56 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0766545 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.48 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0183804  normal  0.0975853 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  28.74 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.5 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  29.69 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4711  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.02 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.8 
 
 		 284 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7204  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.18 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.442713 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.66 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4057  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.68 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.773684 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.96 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7333  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.4 
 
 		 470 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946911  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.71 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.61 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.6 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5480  plasmid partitioning protein RepA  24.79 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6162  plasmid partitioning protein RepA  25.31 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.49965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0359  sporulation initiation inhibitor protein soj  26.32 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00437391  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0196  chromosome partitioning protein  30.37 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.01 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.53 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1532  SpoOJ regulator protein  28.65 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.41 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_40  putative plasmid partition protein A  27.01 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0786785  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.39 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.77 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5105  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.63 
 
 		 437 aa  66.6  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000298727 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.95 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2127  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  30.37 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6108  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.84 
 
 		 411 aa  66.2  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.89 
 
 		 253 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.12 
 
 		 254 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.47 
 
 		 253 aa  66.2  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A20  ATPase involved in chromosome partitioning  26.25 
 
 		 270 aa  65.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.814657  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  28.85 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  26.34 
 
 		 249 aa  66.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.91 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  32.54 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.04 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.34 
 
 		 264 aa  65.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1803  ParaA family ATPase  27.37 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.833868  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.47 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3948  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.18 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0159296  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0188  chromosome partitioning protein ParA  29.78 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2950  hypothetical protein  25.85 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0237  chromosome partitioning ATPase  28.98 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.95 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.34 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  27.37 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3749  hypothetical protein  28.92 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  30.41 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4587  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.37 
 
 		 433 aa  63.9  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127465  hitchhiker  0.000606651 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.81 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  26.46 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  28.42 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  22.69 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0777  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.92 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2804  hypothetical protein  25.85 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H08  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  29.17 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.129369  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  26.46 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9384  chromosome partitioning protein; transcriptional regulator  28.49 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.72 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.34 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.84 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.79 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.34 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.34 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4349  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.57 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.34 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  27.76 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>