More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4532 on replicon NC_009669
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009621  Smed_5173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  79.85 
 
 
391 aa  658    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
400 aa  831    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4789  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.54 
 
 
387 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.076168  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4186  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  49.04 
 
 
394 aa  349  5e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.04151  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5377  plasmid partitioning protein RepA  46.56 
 
 
405 aa  348  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408708  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.84 
 
 
410 aa  346  4e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4023  ATPase, ParA type  45.34 
 
 
392 aa  346  5e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.845906  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5873  plasmid partitioning protein RepA  46.97 
 
 
405 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128849  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4191  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.97 
 
 
420 aa  343  4e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.680764 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9001  replication protein A  44.83 
 
 
399 aa  340  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4023  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.85 
 
 
395 aa  339  5e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03067  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4671  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.03 
 
 
397 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.17 
 
 
407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  44.16 
 
 
405 aa  334  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  44.5 
 
 
397 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  44.88 
 
 
405 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.85 
 
 
404 aa  331  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  43.99 
 
 
397 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  44.62 
 
 
405 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.24 
 
 
398 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0001  putative replication protein A  43.34 
 
 
408 aa  327  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.19 
 
 
405 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5000  replication protein A  44.76 
 
 
420 aa  325  8.000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  44.97 
 
 
408 aa  324  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.93 
 
 
397 aa  324  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  43.6 
 
 
409 aa  323  4e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.72 
 
 
401 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7789  plasmid partitioning protein RepA  44.47 
 
 
405 aa  320  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.45198  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  41.86 
 
 
408 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  46.65 
 
 
371 aa  317  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4190  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.13 
 
 
400 aa  317  3e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.77 
 
 
397 aa  317  3e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.93 
 
 
408 aa  316  5e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6501  plasmid partitioning protein RepA  42.67 
 
 
404 aa  315  8e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6017  plasmid partitioning protein RepA  43.01 
 
 
398 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0237613  normal  0.19813 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.6 
 
 
404 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7172  plasmid partitioning protein RepA  42.49 
 
 
398 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300814 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4689  plasmid partitioning protein RepA  45.26 
 
 
402 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10454  normal  0.803552 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  43.88 
 
 
403 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5480  plasmid partitioning protein RepA  43.04 
 
 
405 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  44.14 
 
 
397 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1104  replication protein RepA  43.87 
 
 
397 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000233941  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3561  plasmid partitioning protein RepA  40.74 
 
 
405 aa  300  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6054  plasmid partitioning protein RepA  42.93 
 
 
398 aa  295  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4711  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.72 
 
 
404 aa  295  8e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4456  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.29 
 
 
398 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4571  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.95 
 
 
404 aa  287  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6162  plasmid partitioning protein RepA  42.34 
 
 
404 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.49965  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8198  replication protein A  39.74 
 
 
403 aa  280  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5912  plasmid partitioning protein RepA  38.18 
 
 
408 aa  257  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334298  normal  0.0281794 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  36.72 
 
 
408 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3591  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.78 
 
 
400 aa  196  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.27 
 
 
383 aa  187  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3887  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.9 
 
 
405 aa  180  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5337  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 
401 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684044  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6108  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.49 
 
 
411 aa  170  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5035  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.5 
 
 
399 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1423  ParA family ATPase  30.17 
 
 
468 aa  166  9e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273364  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3692  hypothetical protein  30.36 
 
 
468 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.576535  normal  0.38395 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.17 
 
 
468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.770946  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0002  hypothetical protein  30 
 
 
402 aa  164  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00393773  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4265  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.05 
 
 
462 aa  164  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.383224 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3918  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.68 
 
 
401 aa  162  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4213  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.68 
 
 
466 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4082  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.52 
 
 
484 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.525863  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3840  ATPase, ParA type  32.35 
 
 
484 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535208  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4242  hypothetical protein  30.54 
 
 
484 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.514474 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3406  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.41 
 
 
487 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.798032 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3855  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.56 
 
 
463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.743489  normal 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0067  plasmid partition protein A  28.24 
 
 
406 aa  153  5e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0035  putative protein sopA  28.61 
 
 
406 aa  151  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0078  partitioning protein, ParA  28.54 
 
 
397 aa  146  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  hitchhiker  0.00231687 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7204  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.18 
 
 
383 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.442713 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3773  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.61 
 
 
469 aa  145  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200831  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0007  plasmid-partitioning protein SopA  29.89 
 
 
391 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4250  plasmid-partitioning protein SopA  29.63 
 
 
388 aa  142  9e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.100676 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0045  plasmid-partitioning protein SopA  30.32 
 
 
385 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257222  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0073  plasmid-partitioning protein SopA  30.32 
 
 
391 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000728582 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0022  plasmid-partitioning protein SopA  30.32 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.19504  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4322  hypothetical protein  28.24 
 
 
435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.131093 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2483  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  28.01 
 
 
435 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.111676  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.25 
 
 
402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199192  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0009  plasmid-partitioning protein SopA  28.65 
 
 
388 aa  126  7e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0766545 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4177  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.98 
 
 
387 aa  124  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3948  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.33 
 
 
434 aa  123  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0159296  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.3 
 
 
397 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0183804  normal  0.0975853 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.75 
 
 
403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1369  putative ParA-like partition protein  28.9 
 
 
347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6315  plasmid partitioning ATPase ParA  27.69 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2913  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.41 
 
 
434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.018827  normal  0.268848 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.34 
 
 
287 aa  106  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.38 
 
 
299 aa  106  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.47 
 
 
293 aa  105  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.18 
 
 
267 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  32.51 
 
 
293 aa  104  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.86 
 
 
303 aa  103  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0241  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.6 
 
 
300 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.811562  normal  0.0256625 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  30.89 
 
 
327 aa  103  6e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  29.76 
 
 
253 aa  103  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  31.18 
 
 
319 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>