More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4711 on replicon NC_009671
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009671  Oant_4711  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 		 404 aa  826    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6162  plasmid partitioning protein RepA  82.38 
 
 		 404 aa  668    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.49965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5480  plasmid partitioning protein RepA  53.69 
 
 		 405 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4571  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.23 
 
 		 404 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7172  plasmid partitioning protein RepA  52.39 
 
 		 398 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300814 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6017  plasmid partitioning protein RepA  51.51 
 
 		 398 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0237613  normal  0.19813 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8198  replication protein A  52.23 
 
 		 403 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0001  putative replication protein A  49.5 
 
 		 408 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7789  plasmid partitioning protein RepA  50.52 
 
 		 405 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.45198  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9001  replication protein A  50.64 
 
 		 399 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4789  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.65 
 
 		 387 aa  394  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.076168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5873  plasmid partitioning protein RepA  49.87 
 
 		 405 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128849  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.52 
 
 		 407 aa  387  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5377  plasmid partitioning protein RepA  48.97 
 
 		 405 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408708  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  48.25 
 
 		 409 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  48.32 
 
 		 408 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  47.24 
 
 		 405 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4191  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.1 
 
 		 420 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.680764 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.53 
 
 		 410 aa  374  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  46.34 
 
 		 405 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  46.98 
 
 		 405 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.39 
 
 		 404 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4186  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  48.32 
 
 		 394 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.04151  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5000  replication protein A  48.46 
 
 		 420 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.59 
 
 		 401 aa  365  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.37 
 
 		 408 aa  364  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6501  plasmid partitioning protein RepA  46.08 
 
 		 404 aa  362  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3561  plasmid partitioning protein RepA  46.92 
 
 		 405 aa  361  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4023  ATPase, ParA type  48.83 
 
 		 392 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.845906  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4190  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.77 
 
 		 400 aa  360  3e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  46.02 
 
 		 408 aa  359  5e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.23 
 
 		 405 aa  359  6e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.48 
 
 		 404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  47.11 
 
 		 403 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4023  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.35 
 
 		 395 aa  355  7.999999999999999e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03067  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  46.46 
 
 		 397 aa  354  1e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1104  replication protein RepA  46.19 
 
 		 397 aa  351  1e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000233941  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4689  plasmid partitioning protein RepA  46.58 
 
 		 402 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10454  normal  0.803552 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.07 
 
 		 398 aa  347  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6054  plasmid partitioning protein RepA  46.91 
 
 		 398 aa  346  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  45.55 
 
 		 397 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  45.29 
 
 		 397 aa  342  7e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4456  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.46 
 
 		 398 aa  342  9e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4671  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.5 
 
 		 397 aa  341  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.76 
 
 		 397 aa  335  5.999999999999999e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  42.51 
 
 		 371 aa  331  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.07 
 
 		 397 aa  322  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5912  plasmid partitioning protein RepA  45.19 
 
 		 408 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334298  normal  0.0281794 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  44.42 
 
 		 408 aa  301  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.72 
 
 		 400 aa  295  8e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.72 
 
 		 391 aa  288  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3591  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.35 
 
 		 400 aa  202  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5035  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.03 
 
 		 399 aa  199  7e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.22 
 
 		 383 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5337  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.42 
 
 		 401 aa  192  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3887  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.49 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7204  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.9 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.442713 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3918  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.13 
 
 		 401 aa  172  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0078  partitioning protein, ParA  31.94 
 
 		 397 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  hitchhiker  0.00231687 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6108  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.3 
 
 		 411 aa  159  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0067  plasmid partition protein A  29.17 
 
 		 406 aa  158  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0035  putative protein sopA  29.06 
 
 		 406 aa  156  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3406  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 487 aa  155  9e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.798032 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0002  hypothetical protein  28.39 
 
 		 402 aa  154  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00393773  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.6 
 
 		 468 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.770946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6315  plasmid partitioning ATPase ParA  32.98 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3692  hypothetical protein  32.12 
 
 		 468 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.576535  normal  0.38395 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4177  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.85 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1423  ParA family ATPase  32.36 
 
 		 468 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273364  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.53 
 
 		 397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0183804  normal  0.0975853 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4213  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.46 
 
 		 466 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.53 
 
 		 403 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3773  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.77 
 
 		 469 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4265  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.12 
 
 		 462 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.383224 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1369  putative ParA-like partition protein  29.52 
 
 		 347 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.25 
 
 		 402 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3840  ATPase, ParA type  30.88 
 
 		 484 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535208  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4082  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.88 
 
 		 484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.525863  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4322  hypothetical protein  28.91 
 
 		 435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.131093 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2483  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  28.64 
 
 		 435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.111676  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4242  hypothetical protein  30.88 
 
 		 484 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.514474 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3948  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27 
 
 		 434 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0159296  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3855  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.1 
 
 		 463 aa  126  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.743489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2913  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.69 
 
 		 434 aa  125  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.018827  normal  0.268848 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4250  plasmid-partitioning protein SopA  31.49 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.100676 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0007  plasmid-partitioning protein SopA  30.52 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0022  plasmid-partitioning protein SopA  29.59 
 
 		 388 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.19504  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0045  plasmid-partitioning protein SopA  29.59 
 
 		 385 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0073  plasmid-partitioning protein SopA  29.59 
 
 		 391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728582 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0009  plasmid-partitioning protein SopA  28 
 
 		 388 aa  113  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0766545 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7549  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.58 
 
 		 403 aa  107  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0306552 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.75 
 
 		 255 aa  100  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4546  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.89 
 
 		 399 aa  99.8  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.931063  normal  0.514808 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4451  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.89 
 
 		 399 aa  99.8  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.375885  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0095  plasmid partition protein ParA  27.06 
 
 		 399 aa  98.2  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4366  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.89 
 
 		 399 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00100758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.95 
 
 		 480 aa  97.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0272745 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.66 
 
 		 303 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.71 
 
 		 265 aa  97.1  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.66 
 
 		 299 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>