More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_4250 on replicon NC_009425
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011350  ECH74115_B0045  plasmid-partitioning protein SopA  93.51 
 
 		 385 aa  759    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0022  plasmid-partitioning protein SopA  93.3 
 
 		 388 aa  763    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.19504  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0007  plasmid-partitioning protein SopA  94.07 
 
 		 391 aa  771    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4250  plasmid-partitioning protein SopA  100 
 
 		 388 aa  803    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.100676 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0073  plasmid-partitioning protein SopA  93.3 
 
 		 391 aa  762    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728582 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0009  plasmid-partitioning protein SopA  68.91 
 
 		 388 aa  585  1e-166  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0766545 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5337  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.26 
 
 		 401 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3948  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.24 
 
 		 434 aa  199  7.999999999999999e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0159296  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.16 
 
 		 383 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0002  hypothetical protein  33.16 
 
 		 402 aa  179  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00393773  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0067  plasmid partition protein A  31.56 
 
 		 406 aa  179  4.999999999999999e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0035  putative protein sopA  31.56 
 
 		 406 aa  179  5.999999999999999e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3591  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.76 
 
 		 400 aa  179  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5035  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.48 
 
 		 399 aa  169  8e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.83 
 
 		 407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  33.06 
 
 		 408 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3918  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.36 
 
 		 401 aa  161  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  31.98 
 
 		 405 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  33.23 
 
 		 405 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9001  replication protein A  32.98 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  30.3 
 
 		 409 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.52 
 
 		 404 aa  150  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5377  plasmid partitioning protein RepA  31.23 
 
 		 405 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408708  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5873  plasmid partitioning protein RepA  32.05 
 
 		 405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128849  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6501  plasmid partitioning protein RepA  30.1 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4191  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.59 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.680764 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  31.85 
 
 		 405 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.63 
 
 		 400 aa  142  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7789  plasmid partitioning protein RepA  31.82 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.45198  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0078  partitioning protein, ParA  31.19 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  hitchhiker  0.00231687 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8198  replication protein A  31.35 
 
 		 403 aa  139  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.29 
 
 		 410 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  31.35 
 
 		 397 aa  139  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.2 
 
 		 401 aa  138  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3561  plasmid partitioning protein RepA  31.81 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5480  plasmid partitioning protein RepA  30.85 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4190  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.61 
 
 		 400 aa  137  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7172  plasmid partitioning protein RepA  31.46 
 
 		 398 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300814 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1104  replication protein RepA  31.09 
 
 		 397 aa  136  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000233941  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4177  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.91 
 
 		 387 aa  136  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7204  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.54 
 
 		 383 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.442713 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6017  plasmid partitioning protein RepA  32.16 
 
 		 398 aa  136  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0237613  normal  0.19813 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4789  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.73 
 
 		 387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.076168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  31.35 
 
 		 408 aa  134  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5912  plasmid partitioning protein RepA  30.93 
 
 		 408 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334298  normal  0.0281794 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5000  replication protein A  29.74 
 
 		 420 aa  133  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4023  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.35 
 
 		 395 aa  133  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03067  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6108  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.61 
 
 		 411 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4671  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.75 
 
 		 397 aa  130  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.36 
 
 		 398 aa  129  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4023  ATPase, ParA type  30.53 
 
 		 392 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.845906  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.39 
 
 		 391 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6315  plasmid partitioning ATPase ParA  30.29 
 
 		 396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4186  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  29.19 
 
 		 394 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.04151  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0001  putative replication protein A  29.63 
 
 		 408 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.03 
 
 		 397 aa  126  8.000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  31.09 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  28.53 
 
 		 397 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4689  plasmid partitioning protein RepA  29.87 
 
 		 402 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10454  normal  0.803552 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4711  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.49 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  31.47 
 
 		 408 aa  122  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  28.8 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.96 
 
 		 397 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  30.56 
 
 		 371 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.14 
 
 		 405 aa  119  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4571  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.07 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4456  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.93 
 
 		 398 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.76 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6054  plasmid partitioning protein RepA  28.57 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6162  plasmid partitioning protein RepA  30.21 
 
 		 404 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.49965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.88 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.04 
 
 		 397 aa  113  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0183804  normal  0.0975853 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.6 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.37 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1369  putative ParA-like partition protein  26.69 
 
 		 347 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3692  hypothetical protein  27.96 
 
 		 468 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.576535  normal  0.38395 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1423  ParA family ATPase  27.58 
 
 		 468 aa  99.4  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273364  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3773  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.3 
 
 		 469 aa  98.6  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.58 
 
 		 468 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.770946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7549  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.32 
 
 		 403 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0306552 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4213  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.13 
 
 		 466 aa  98.6  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.19 
 
 		 256 aa  95.5  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  31.2 
 
 		 276 aa  95.5  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0126  putative plasmid partition protein ParA  25.94 
 
 		 401 aa  93.2  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.75003e-18 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.65 
 
 		 287 aa  92.8  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3887  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.69 
 
 		 405 aa  92.4  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2913  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.26 
 
 		 434 aa  90.9  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.018827  normal  0.268848 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3406  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.67 
 
 		 487 aa  90.5  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.798032 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.44 
 
 		 255 aa  90.5  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1410  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 261 aa  90.1  6e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3855  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.95 
 
 		 463 aa  90.1  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.743489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0438  putative CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  26.37 
 
 		 250 aa  89.7  7e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.132493  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  31.44 
 
 		 254 aa  89.7  9e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3840  ATPase, ParA type  26.35 
 
 		 484 aa  89.4  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535208  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.37 
 
 		 261 aa  89  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4242  hypothetical protein  26.49 
 
 		 484 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.514474 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3749  hypothetical protein  30.47 
 
 		 256 aa  89.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4265  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.24 
 
 		 462 aa  89  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.383224 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4082  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.48 
 
 		 484 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.525863  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  32.9 
 
 		 270 aa  88.6  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>