More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4693 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008760  Pnap_4693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 397 aa  818    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0183804  normal  0.0975853 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7204  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.61 
 
 		 383 aa  368  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.442713 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6108  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.15 
 
 		 411 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0078  partitioning protein, ParA  46.77 
 
 		 397 aa  340  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  hitchhiker  0.00231687 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6315  plasmid partitioning ATPase ParA  37.28 
 
 		 396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.03 
 
 		 402 aa  243  5e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.76 
 
 		 403 aa  242  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1369  putative ParA-like partition protein  37.99 
 
 		 347 aa  219  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7549  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.61 
 
 		 403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0306552 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5035  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.25 
 
 		 399 aa  180  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5337  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.59 
 
 		 401 aa  163  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3406  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.51 
 
 		 487 aa  162  8.000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.798032 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4213  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.39 
 
 		 466 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.18 
 
 		 397 aa  160  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3773  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.51 
 
 		 469 aa  159  6e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3692  hypothetical protein  31.52 
 
 		 468 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.576535  normal  0.38395 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4023  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.65 
 
 		 395 aa  158  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03067  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.83 
 
 		 468 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.770946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3591  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.95 
 
 		 400 aa  157  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1423  ParA family ATPase  31.83 
 
 		 468 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273364  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4711  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.38 
 
 		 404 aa  156  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4082  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.49 
 
 		 484 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.525863  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.02 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4242  hypothetical protein  34.95 
 
 		 484 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.514474 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3840  ATPase, ParA type  34.68 
 
 		 484 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535208  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  32.81 
 
 		 408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3855  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.24 
 
 		 463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.743489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  30.37 
 
 		 405 aa  153  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4265  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.42 
 
 		 462 aa  152  7e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.383224 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5912  plasmid partitioning protein RepA  31.03 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334298  normal  0.0281794 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.97 
 
 		 398 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 		 407 aa  150  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  29.29 
 
 		 408 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  30.11 
 
 		 397 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1104  replication protein RepA  29.97 
 
 		 397 aa  150  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000233941  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  29.97 
 
 		 397 aa  150  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9001  replication protein A  29.3 
 
 		 399 aa  149  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 404 aa  149  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  29.55 
 
 		 371 aa  149  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  28.12 
 
 		 408 aa  149  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.28 
 
 		 401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  29.57 
 
 		 397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3561  plasmid partitioning protein RepA  28.57 
 
 		 405 aa  146  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6501  plasmid partitioning protein RepA  29.68 
 
 		 404 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4571  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.17 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.67 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.98 
 
 		 408 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5480  plasmid partitioning protein RepA  30.65 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6162  plasmid partitioning protein RepA  31.86 
 
 		 404 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.49965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5000  replication protein A  30.67 
 
 		 420 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  29.95 
 
 		 405 aa  143  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4190  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.11 
 
 		 400 aa  142  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4789  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.14 
 
 		 387 aa  142  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.076168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  29.2 
 
 		 405 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  30.19 
 
 		 409 aa  142  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  29.43 
 
 		 403 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.76 
 
 		 410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.68 
 
 		 383 aa  139  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5873  plasmid partitioning protein RepA  30.26 
 
 		 405 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128849  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4186  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  29.38 
 
 		 394 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.04151  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4023  ATPase, ParA type  28.84 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.845906  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.92 
 
 		 397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0001  putative replication protein A  28.28 
 
 		 408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6054  plasmid partitioning protein RepA  28.61 
 
 		 398 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4671  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.81 
 
 		 397 aa  137  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6017  plasmid partitioning protein RepA  30.48 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0237613  normal  0.19813 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4191  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.69 
 
 		 420 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.680764 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5377  plasmid partitioning protein RepA  30.26 
 
 		 405 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408708  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7789  plasmid partitioning protein RepA  28.65 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.45198  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0002  hypothetical protein  30.1 
 
 		 402 aa  133  6e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00393773  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8198  replication protein A  29.95 
 
 		 403 aa  133  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4689  plasmid partitioning protein RepA  30.31 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10454  normal  0.803552 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0035  putative protein sopA  29.17 
 
 		 406 aa  130  5.0000000000000004e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7172  plasmid partitioning protein RepA  30.11 
 
 		 398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300814 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4322  hypothetical protein  28.19 
 
 		 435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.131093 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0067  plasmid partition protein A  28.82 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2483  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  27.93 
 
 		 435 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.111676  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.3 
 
 		 400 aa  126  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4456  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.6 
 
 		 398 aa  126  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.77 
 
 		 391 aa  123  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0045  plasmid-partitioning protein SopA  26.8 
 
 		 385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2913  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.93 
 
 		 434 aa  120  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.018827  normal  0.268848 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0073  plasmid-partitioning protein SopA  26.8 
 
 		 391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728582 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3918  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.13 
 
 		 401 aa  120  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0022  plasmid-partitioning protein SopA  26.8 
 
 		 388 aa  120  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.19504  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0007  plasmid-partitioning protein SopA  26.8 
 
 		 391 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4177  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.85 
 
 		 387 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0009  plasmid-partitioning protein SopA  27.66 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0766545 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3948  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.3 
 
 		 434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0159296  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4250  plasmid-partitioning protein SopA  25.97 
 
 		 388 aa  116  8.999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.100676 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.18 
 
 		 253 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.8 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  31.11 
 
 		 257 aa  102  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.23 
 
 		 254 aa  101  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  40.26 
 
 		 276 aa  99.4  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.28 
 
 		 257 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.72 
 
 		 257 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3887  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.6 
 
 		 405 aa  98.6  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.65 
 
 		 322 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  39.13 
 
 		 268 aa  98.6  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>