More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4822 on replicon NC_009670
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
408 aa  849    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  70.63 
 
 
408 aa  587  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  68.58 
 
 
404 aa  579  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  68.7 
 
 
405 aa  569  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.41 
 
 
401 aa  526  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  64.1 
 
 
397 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  63.59 
 
 
397 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.71 
 
 
398 aa  498  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4671  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.77 
 
 
397 aa  486  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.08 
 
 
410 aa  484  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.31 
 
 
407 aa  487  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.87 
 
 
397 aa  484  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  59.11 
 
 
408 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  60.36 
 
 
405 aa  471  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9001  replication protein A  55.69 
 
 
399 aa  470  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  55.88 
 
 
409 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5000  replication protein A  61.07 
 
 
420 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  59.79 
 
 
405 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4023  cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.68 
 
 
395 aa  462  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03067  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4186  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  58.46 
 
 
394 aa  461  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.04151  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4191  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.7 
 
 
420 aa  463  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.680764 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4023  ATPase, ParA type  57.8 
 
 
392 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.845906  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  59.79 
 
 
405 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5377  plasmid partitioning protein RepA  56.4 
 
 
405 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408708  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6501  plasmid partitioning protein RepA  54.9 
 
 
404 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5873  plasmid partitioning protein RepA  56.74 
 
 
405 aa  456  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128849  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4789  cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.11 
 
 
387 aa  457  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.076168  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3561  plasmid partitioning protein RepA  55.64 
 
 
405 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4190  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.88 
 
 
400 aa  444  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.99 
 
 
404 aa  444  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0001  putative replication protein A  54.5 
 
 
408 aa  435  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.5 
 
 
397 aa  434  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6017  plasmid partitioning protein RepA  55.28 
 
 
398 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0237613  normal  0.19813 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7789  plasmid partitioning protein RepA  54.36 
 
 
405 aa  433  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.45198  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1104  replication protein RepA  54.31 
 
 
397 aa  429  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000233941  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7172  plasmid partitioning protein RepA  53.9 
 
 
398 aa  425  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300814 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  53.81 
 
 
397 aa  424  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  52.38 
 
 
403 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6054  plasmid partitioning protein RepA  52.61 
 
 
398 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4689  plasmid partitioning protein RepA  52.81 
 
 
402 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10454  normal  0.803552 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4456  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.42 
 
 
398 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4571  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.12 
 
 
404 aa  394  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  49.61 
 
 
371 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5480  plasmid partitioning protein RepA  51.68 
 
 
405 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8198  replication protein A  48.72 
 
 
403 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  50.26 
 
 
408 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5912  plasmid partitioning protein RepA  50.52 
 
 
408 aa  375  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334298  normal  0.0281794 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4711  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.37 
 
 
404 aa  364  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6162  plasmid partitioning protein RepA  46.75 
 
 
404 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.49965  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.96 
 
 
391 aa  319  5e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.93 
 
 
400 aa  316  5e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3887  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.35 
 
 
405 aa  197  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.33 
 
 
383 aa  186  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3591  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.89 
 
 
400 aa  186  9e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5337  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.15 
 
 
401 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684044  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5035  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.24 
 
 
399 aa  167  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3918  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.46 
 
 
401 aa  160  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6108  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.48 
 
 
411 aa  155  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4213  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.23 
 
 
466 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7204  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.13 
 
 
383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.442713 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3406  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.1 
 
 
487 aa  152  8e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.798032 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4322  hypothetical protein  29.95 
 
 
435 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.131093 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2483  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  29.95 
 
 
435 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.111676  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3855  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.31 
 
 
463 aa  149  7e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.743489  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3773  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.89 
 
 
469 aa  149  8e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200831  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6315  plasmid partitioning ATPase ParA  30.85 
 
 
396 aa  147  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3692  hypothetical protein  27.96 
 
 
468 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.576535  normal  0.38395 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0078  partitioning protein, ParA  29.43 
 
 
397 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  hitchhiker  0.00231687 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1423  ParA family ATPase  27.82 
 
 
468 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273364  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4242  hypothetical protein  28.4 
 
 
484 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.514474 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0002  hypothetical protein  28.73 
 
 
402 aa  144  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00393773  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2913  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.89 
 
 
434 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.018827  normal  0.268848 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.82 
 
 
468 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.770946  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4265  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.22 
 
 
462 aa  142  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.383224 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3840  ATPase, ParA type  28.12 
 
 
484 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535208  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4082  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.36 
 
 
484 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.525863  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0067  plasmid partition protein A  28.3 
 
 
406 aa  140  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0035  putative protein sopA  28.18 
 
 
406 aa  139  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.98 
 
 
397 aa  139  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0183804  normal  0.0975853 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.18 
 
 
403 aa  135  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4177  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.99 
 
 
387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.49 
 
 
402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199192  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1369  putative ParA-like partition protein  29.14 
 
 
347 aa  126  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0045  plasmid-partitioning protein SopA  28.61 
 
 
385 aa  117  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257222  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0073  plasmid-partitioning protein SopA  28.61 
 
 
391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000728582 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0022  plasmid-partitioning protein SopA  28.61 
 
 
388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.19504  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.66 
 
 
253 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4250  plasmid-partitioning protein SopA  28.88 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.100676 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3948  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.8 
 
 
434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0159296  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0007  plasmid-partitioning protein SopA  28.61 
 
 
391 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0009  plasmid-partitioning protein SopA  27.69 
 
 
388 aa  113  7.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0766545 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.36 
 
 
253 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  30.97 
 
 
293 aa  107  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  33.08 
 
 
332 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.51 
 
 
303 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.27 
 
 
265 aa  101  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.44 
 
 
317 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  34.6 
 
 
290 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.88 
 
 
299 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.8 
 
 
257 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>