More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6108 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6108  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 		 411 aa  840    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7204  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.1 
 
 		 383 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.442713 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0078  partitioning protein, ParA  51.43 
 
 		 397 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  hitchhiker  0.00231687 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.15 
 
 		 397 aa  358  8e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0183804  normal  0.0975853 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.97 
 
 		 402 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6315  plasmid partitioning ATPase ParA  41.93 
 
 		 396 aa  294  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.18 
 
 		 403 aa  274  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7549  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.53 
 
 		 403 aa  258  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0306552 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1369  putative ParA-like partition protein  40.97 
 
 		 347 aa  252  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5337  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.11 
 
 		 401 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33 
 
 		 407 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  31.73 
 
 		 405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  31.73 
 
 		 405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5035  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.08 
 
 		 399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3591  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.36 
 
 		 400 aa  182  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  34.7 
 
 		 397 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.08 
 
 		 397 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  31.92 
 
 		 405 aa  181  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5000  replication protein A  32.35 
 
 		 420 aa  181  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4191  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.28 
 
 		 420 aa  179  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.680764 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1104  replication protein RepA  34.43 
 
 		 397 aa  179  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000233941  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5377  plasmid partitioning protein RepA  31.38 
 
 		 405 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408708  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4789  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.02 
 
 		 387 aa  173  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.076168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.62 
 
 		 410 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5912  plasmid partitioning protein RepA  31.97 
 
 		 408 aa  172  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334298  normal  0.0281794 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.53 
 
 		 383 aa  172  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0002  hypothetical protein  28.83 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00393773  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3561  plasmid partitioning protein RepA  31.81 
 
 		 405 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.32 
 
 		 404 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  31.89 
 
 		 409 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9001  replication protein A  30.79 
 
 		 399 aa  170  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.49 
 
 		 400 aa  170  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.39 
 
 		 404 aa  169  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  31.27 
 
 		 408 aa  169  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7789  plasmid partitioning protein RepA  29.21 
 
 		 405 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.45198  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5873  plasmid partitioning protein RepA  30.69 
 
 		 405 aa  167  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128849  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0035  putative protein sopA  27.25 
 
 		 406 aa  167  4e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  29.38 
 
 		 408 aa  166  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4023  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.73 
 
 		 395 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03067  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4023  ATPase, ParA type  30.49 
 
 		 392 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.845906  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0067  plasmid partition protein A  27.25 
 
 		 406 aa  166  6.9999999999999995e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  31.73 
 
 		 408 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7172  plasmid partitioning protein RepA  29.43 
 
 		 398 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300814 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6017  plasmid partitioning protein RepA  28.86 
 
 		 398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0237613  normal  0.19813 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6501  plasmid partitioning protein RepA  30.43 
 
 		 404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4186  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  31.2 
 
 		 394 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.04151  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5480  plasmid partitioning protein RepA  31.13 
 
 		 405 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4242  hypothetical protein  32.55 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.514474 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4190  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.21 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4671  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.25 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  29.03 
 
 		 371 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3840  ATPase, ParA type  33.09 
 
 		 484 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535208  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4082  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.92 
 
 		 484 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.525863  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4711  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.3 
 
 		 404 aa  159  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.27 
 
 		 398 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3918  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.55 
 
 		 401 aa  158  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0001  putative replication protein A  29.9 
 
 		 408 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6054  plasmid partitioning protein RepA  31.95 
 
 		 398 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  31.04 
 
 		 403 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.68 
 
 		 401 aa  157  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3855  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.11 
 
 		 463 aa  155  8e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.743489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4571  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.93 
 
 		 404 aa  156  8e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6162  plasmid partitioning protein RepA  33.78 
 
 		 404 aa  156  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.49965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.48 
 
 		 408 aa  155  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  30.03 
 
 		 397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4456  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.24 
 
 		 398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4213  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.53 
 
 		 466 aa  153  7e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.83 
 
 		 391 aa  152  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4265  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.95 
 
 		 462 aa  152  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.383224 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4689  plasmid partitioning protein RepA  31.51 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10454  normal  0.803552 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  30.21 
 
 		 397 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3773  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.39 
 
 		 469 aa  151  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8198  replication protein A  29.37 
 
 		 403 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.8 
 
 		 397 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3692  hypothetical protein  30.3 
 
 		 468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.576535  normal  0.38395 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3406  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.11 
 
 		 487 aa  147  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.798032 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.02 
 
 		 468 aa  146  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.770946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1423  ParA family ATPase  29.84 
 
 		 468 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273364  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0045  plasmid-partitioning protein SopA  30.33 
 
 		 385 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0022  plasmid-partitioning protein SopA  30.33 
 
 		 388 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.19504  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0073  plasmid-partitioning protein SopA  30.33 
 
 		 391 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728582 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0007  plasmid-partitioning protein SopA  30.33 
 
 		 391 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4250  plasmid-partitioning protein SopA  29.61 
 
 		 388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.100676 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0009  plasmid-partitioning protein SopA  32.2 
 
 		 388 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0766545 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3948  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.01 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0159296  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4177  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.92 
 
 		 387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4322  hypothetical protein  28.31 
 
 		 435 aa  127  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.131093 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2483  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  28.04 
 
 		 435 aa  126  9e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.111676  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2913  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.06 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.018827  normal  0.268848 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3887  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.47 
 
 		 255 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  36.08 
 
 		 279 aa  97.1  6e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.49 
 
 		 299 aa  96.7  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08267  plasmid partition protein ParA  24.05 
 
 		 399 aa  95.5  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.49 
 
 		 303 aa  95.5  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3570  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.68 
 
 		 265 aa  94.4  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.00412685  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.42 
 
 		 265 aa  94.4  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.88 
 
 		 265 aa  93.6  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000993  chromosome (plasmid) partitioning protein ParA  28.12 
 
 		 405 aa  93.6  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>