More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4517 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 401 aa  826    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  67.49 
 
 		 405 aa  569  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  68.37 
 
 		 398 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  68.27 
 
 		 397 aa  559  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  67.51 
 
 		 397 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4671  cobyrinic acid ac-diamide synthase  68.22 
 
 		 397 aa  554  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  68.12 
 
 		 407 aa  549  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  68.48 
 
 		 397 aa  546  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  62.44 
 
 		 408 aa  534  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9001  replication protein A  65.47 
 
 		 399 aa  532  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.14 
 
 		 404 aa  530  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.41 
 
 		 408 aa  526  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.47 
 
 		 410 aa  525  1e-148  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5000  replication protein A  61.8 
 
 		 420 aa  498  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4191  cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.05 
 
 		 420 aa  498  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.680764 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5873  plasmid partitioning protein RepA  62.11 
 
 		 405 aa  496  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128849  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6501  plasmid partitioning protein RepA  58.5 
 
 		 404 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  62.24 
 
 		 404 aa  493  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  61.03 
 
 		 408 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  58.88 
 
 		 409 aa  490  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3561  plasmid partitioning protein RepA  61.66 
 
 		 405 aa  486  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  61.04 
 
 		 405 aa  488  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5377  plasmid partitioning protein RepA  62.24 
 
 		 405 aa  484  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408708  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4789  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.05 
 
 		 387 aa  481  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.076168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4023  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.64 
 
 		 395 aa  473  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03067  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  56.62 
 
 		 405 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4186  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  59.13 
 
 		 394 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.04151  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4023  ATPase, ParA type  60.88 
 
 		 392 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.845906  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  56.37 
 
 		 405 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  59.1 
 
 		 397 aa  449  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6017  plasmid partitioning protein RepA  57.25 
 
 		 398 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0237613  normal  0.19813 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1104  replication protein RepA  58.29 
 
 		 397 aa  449  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000233941  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4190  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.36 
 
 		 400 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7172  plasmid partitioning protein RepA  56.88 
 
 		 398 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300814 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7789  plasmid partitioning protein RepA  55.96 
 
 		 405 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.45198  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0001  putative replication protein A  55.56 
 
 		 408 aa  433  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.55 
 
 		 397 aa  430  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4456  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.4 
 
 		 398 aa  425  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  54.88 
 
 		 403 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4689  plasmid partitioning protein RepA  57.63 
 
 		 402 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10454  normal  0.803552 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6054  plasmid partitioning protein RepA  55.12 
 
 		 398 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  53.33 
 
 		 371 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5912  plasmid partitioning protein RepA  52.56 
 
 		 408 aa  391  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334298  normal  0.0281794 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5480  plasmid partitioning protein RepA  50.25 
 
 		 405 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  53.85 
 
 		 408 aa  391  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4571  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.91 
 
 		 404 aa  386  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8198  replication protein A  49.34 
 
 		 403 aa  375  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6162  plasmid partitioning protein RepA  49.26 
 
 		 404 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.49965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4711  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.59 
 
 		 404 aa  365  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.62 
 
 		 391 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.72 
 
 		 400 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3591  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.06 
 
 		 400 aa  205  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5337  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.51 
 
 		 401 aa  203  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5035  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.93 
 
 		 399 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.68 
 
 		 383 aa  189  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3887  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.15 
 
 		 405 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3918  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.39 
 
 		 401 aa  173  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4213  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.33 
 
 		 466 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3855  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.11 
 
 		 463 aa  170  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.743489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3406  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.94 
 
 		 487 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.798032 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3773  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.5 
 
 		 469 aa  166  5e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1423  ParA family ATPase  28.67 
 
 		 468 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273364  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.67 
 
 		 468 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.770946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0078  partitioning protein, ParA  30.29 
 
 		 397 aa  160  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  hitchhiker  0.00231687 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3692  hypothetical protein  28.44 
 
 		 468 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.576535  normal  0.38395 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4242  hypothetical protein  29.28 
 
 		 484 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.514474 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4082  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.71 
 
 		 484 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.525863  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6108  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.68 
 
 		 411 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3840  ATPase, ParA type  28.78 
 
 		 484 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535208  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4177  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.15 
 
 		 387 aa  157  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7204  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.09 
 
 		 383 aa  156  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.442713 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2913  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.24 
 
 		 434 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.018827  normal  0.268848 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4265  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.45 
 
 		 462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.383224 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0067  plasmid partition protein A  29.63 
 
 		 406 aa  153  4e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0002  hypothetical protein  29.18 
 
 		 402 aa  152  7e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00393773  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0035  putative protein sopA  29.89 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4322  hypothetical protein  28.54 
 
 		 435 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.131093 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2483  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  28.54 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.111676  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.28 
 
 		 397 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0183804  normal  0.0975853 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6315  plasmid partitioning ATPase ParA  28.22 
 
 		 396 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4250  plasmid-partitioning protein SopA  30.2 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.100676 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0073  plasmid-partitioning protein SopA  29.29 
 
 		 391 aa  137  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728582 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0022  plasmid-partitioning protein SopA  29.29 
 
 		 388 aa  137  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.19504  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0045  plasmid-partitioning protein SopA  29.29 
 
 		 385 aa  137  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0007  plasmid-partitioning protein SopA  28.76 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0009  plasmid-partitioning protein SopA  27.13 
 
 		 388 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0766545 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3948  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.6 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0159296  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.09 
 
 		 402 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.2 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08267  plasmid partition protein ParA  26.77 
 
 		 399 aa  113  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.67 
 
 		 403 aa  111  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.5 
 
 		 253 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4546  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.27 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.931063  normal  0.514808 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4451  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.27 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.375885  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0095  plasmid partition protein ParA  25.41 
 
 		 399 aa  107  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4366  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.27 
 
 		 399 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00100758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1369  putative ParA-like partition protein  33.5 
 
 		 347 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0095  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.68 
 
 		 293 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  34.66 
 
 		 257 aa  103  8e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36 
 
 		 262 aa  102  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>