More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3276 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009467  Acry_3276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 410 aa  850    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  67.91 
 
 		 407 aa  591  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9001  replication protein A  66.06 
 
 		 399 aa  555  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.47 
 
 		 401 aa  525  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5873  plasmid partitioning protein RepA  63.24 
 
 		 405 aa  522  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128849  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4789  cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.82 
 
 		 387 aa  523  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.076168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5377  plasmid partitioning protein RepA  64.49 
 
 		 405 aa  518  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408708  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  62.5 
 
 		 405 aa  517  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4191  cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.12 
 
 		 420 aa  512  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.680764 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4023  ATPase, ParA type  63.99 
 
 		 392 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.845906  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  62.15 
 
 		 405 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  61.5 
 
 		 408 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6501  plasmid partitioning protein RepA  59.74 
 
 		 404 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  62.11 
 
 		 405 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  62.69 
 
 		 397 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  59.22 
 
 		 409 aa  502  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  62.69 
 
 		 397 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.92 
 
 		 398 aa  500  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.53 
 
 		 404 aa  498  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  59.27 
 
 		 408 aa  498  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4671  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.45 
 
 		 397 aa  494  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.69 
 
 		 405 aa  494  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.76 
 
 		 397 aa  492  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5000  replication protein A  60 
 
 		 420 aa  490  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4190  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.64 
 
 		 400 aa  491  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3561  plasmid partitioning protein RepA  60.31 
 
 		 405 aa  488  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.08 
 
 		 408 aa  484  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4186  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  61.07 
 
 		 394 aa  481  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.04151  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.9 
 
 		 404 aa  484  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4023  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.88 
 
 		 395 aa  481  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03067  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6017  plasmid partitioning protein RepA  57.61 
 
 		 398 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0237613  normal  0.19813 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7172  plasmid partitioning protein RepA  56.61 
 
 		 398 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300814 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7789  plasmid partitioning protein RepA  56.99 
 
 		 405 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.45198  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  54.01 
 
 		 403 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0001  putative replication protein A  54.88 
 
 		 408 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  54.55 
 
 		 397 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1104  replication protein RepA  54.29 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000233941  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.8 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4689  plasmid partitioning protein RepA  55.18 
 
 		 402 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10454  normal  0.803552 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6054  plasmid partitioning protein RepA  54.03 
 
 		 398 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5912  plasmid partitioning protein RepA  56.1 
 
 		 408 aa  422  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334298  normal  0.0281794 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4456  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.92 
 
 		 398 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  52.85 
 
 		 371 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  52.47 
 
 		 408 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4571  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.81 
 
 		 404 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5480  plasmid partitioning protein RepA  49.87 
 
 		 405 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8198  replication protein A  48.81 
 
 		 403 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4711  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.53 
 
 		 404 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6162  plasmid partitioning protein RepA  49.74 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.49965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.84 
 
 		 400 aa  346  5e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.58 
 
 		 391 aa  338  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5337  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.23 
 
 		 401 aa  216  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3591  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.85 
 
 		 400 aa  207  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5035  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.46 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.25 
 
 		 383 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3887  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.51 
 
 		 405 aa  189  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0078  partitioning protein, ParA  31.39 
 
 		 397 aa  176  9e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  hitchhiker  0.00231687 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6108  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.62 
 
 		 411 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3918  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31 
 
 		 401 aa  169  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0002  hypothetical protein  29.66 
 
 		 402 aa  168  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00393773  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4213  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.75 
 
 		 466 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3692  hypothetical protein  27.45 
 
 		 468 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.576535  normal  0.38395 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7204  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.87 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.442713 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1423  ParA family ATPase  28.04 
 
 		 468 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273364  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.85 
 
 		 468 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.770946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0067  plasmid partition protein A  28.53 
 
 		 406 aa  160  4e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0035  putative protein sopA  28.53 
 
 		 406 aa  160  4e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3406  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.54 
 
 		 487 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.798032 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4265  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.43 
 
 		 462 aa  152  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.383224 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4082  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.36 
 
 		 484 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.525863  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3840  ATPase, ParA type  28.36 
 
 		 484 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535208  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4242  hypothetical protein  28.75 
 
 		 484 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.514474 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.19 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6315  plasmid partitioning ATPase ParA  33.33 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2913  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.7 
 
 		 434 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.018827  normal  0.268848 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.25 
 
 		 402 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3773  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.34 
 
 		 469 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4250  plasmid-partitioning protein SopA  30.29 
 
 		 388 aa  139  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.100676 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4177  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.92 
 
 		 387 aa  139  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0009  plasmid-partitioning protein SopA  28.49 
 
 		 388 aa  139  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0766545 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1369  putative ParA-like partition protein  28.61 
 
 		 347 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0007  plasmid-partitioning protein SopA  30.27 
 
 		 391 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.76 
 
 		 397 aa  137  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0183804  normal  0.0975853 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3855  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.43 
 
 		 463 aa  136  8e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.743489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4322  hypothetical protein  28.54 
 
 		 435 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.131093 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0073  plasmid-partitioning protein SopA  30.08 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728582 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0022  plasmid-partitioning protein SopA  30.08 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.19504  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0045  plasmid-partitioning protein SopA  30.08 
 
 		 385 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2483  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  28.54 
 
 		 435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.111676  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3948  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.56 
 
 		 434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0159296  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08267  plasmid partition protein ParA  24.1 
 
 		 399 aa  111  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  30.86 
 
 		 261 aa  110  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.19 
 
 		 317 aa  109  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.85 
 
 		 287 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.43 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.43 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  30.43 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  30.43 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.43 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.43 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>