More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6054 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6054  plasmid partitioning protein RepA  100 
 
 		 398 aa  824    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  72.54 
 
 		 397 aa  607  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1104  replication protein RepA  72.29 
 
 		 397 aa  604  9.999999999999999e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000233941  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4456  cobyrinic acid ac-diamide synthase  71.61 
 
 		 398 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  68.46 
 
 		 403 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4689  plasmid partitioning protein RepA  69.74 
 
 		 402 aa  549  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10454  normal  0.803552 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4190  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  64.01 
 
 		 400 aa  528  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  61.89 
 
 		 371 aa  505  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6501  plasmid partitioning protein RepA  59.95 
 
 		 404 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  60.71 
 
 		 409 aa  492  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.66 
 
 		 407 aa  462  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4023  ATPase, ParA type  57.22 
 
 		 392 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.845906  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4789  cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.74 
 
 		 387 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.076168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.03 
 
 		 410 aa  442  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4186  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  55.3 
 
 		 394 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.04151  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9001  replication protein A  55.82 
 
 		 399 aa  444  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5873  plasmid partitioning protein RepA  55.16 
 
 		 405 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128849  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5377  plasmid partitioning protein RepA  56.1 
 
 		 405 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408708  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  54.57 
 
 		 408 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4191  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.77 
 
 		 420 aa  432  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.680764 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4023  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.78 
 
 		 395 aa  432  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03067  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5000  replication protein A  53.15 
 
 		 420 aa  429  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.12 
 
 		 401 aa  428  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.61 
 
 		 408 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.85 
 
 		 405 aa  426  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  55.03 
 
 		 397 aa  428  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7789  plasmid partitioning protein RepA  52.79 
 
 		 405 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.45198  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.97 
 
 		 398 aa  422  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.44 
 
 		 397 aa  422  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  54.5 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  53.7 
 
 		 408 aa  421  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3561  plasmid partitioning protein RepA  54.64 
 
 		 405 aa  418  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.78 
 
 		 404 aa  418  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.7 
 
 		 397 aa  421  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4671  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.44 
 
 		 397 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.66 
 
 		 404 aa  420  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  50.38 
 
 		 405 aa  415  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  51.54 
 
 		 405 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6017  plasmid partitioning protein RepA  51.03 
 
 		 398 aa  411  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0237613  normal  0.19813 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  51.28 
 
 		 405 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7172  plasmid partitioning protein RepA  50.77 
 
 		 398 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300814 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0001  putative replication protein A  50.13 
 
 		 408 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5480  plasmid partitioning protein RepA  51.28 
 
 		 405 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4571  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48 
 
 		 404 aa  383  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5912  plasmid partitioning protein RepA  48.51 
 
 		 408 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334298  normal  0.0281794 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  49.22 
 
 		 408 aa  368  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8198  replication protein A  47.8 
 
 		 403 aa  362  7.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4711  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.91 
 
 		 404 aa  359  4e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6162  plasmid partitioning protein RepA  48.45 
 
 		 404 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.49965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.57 
 
 		 391 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.93 
 
 		 400 aa  311  9e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3591  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.72 
 
 		 400 aa  206  6e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.87 
 
 		 383 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5337  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.9 
 
 		 401 aa  184  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5035  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.17 
 
 		 399 aa  180  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3887  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.22 
 
 		 405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1423  ParA family ATPase  30.64 
 
 		 468 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273364  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.61 
 
 		 468 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.770946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4265  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.38 
 
 		 462 aa  171  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.383224 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3406  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.82 
 
 		 487 aa  171  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.798032 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3692  hypothetical protein  30.28 
 
 		 468 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.576535  normal  0.38395 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6108  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.95 
 
 		 411 aa  170  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0078  partitioning protein, ParA  31.48 
 
 		 397 aa  169  6e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  hitchhiker  0.00231687 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3773  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.27 
 
 		 469 aa  169  7e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4213  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.95 
 
 		 466 aa  169  7e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3840  ATPase, ParA type  30.82 
 
 		 484 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535208  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4082  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.59 
 
 		 484 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.525863  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7204  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.23 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.442713 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0067  plasmid partition protein A  30.57 
 
 		 406 aa  164  3e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3855  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.68 
 
 		 463 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.743489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0035  putative protein sopA  30.47 
 
 		 406 aa  162  9e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2483  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  30.02 
 
 		 435 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.111676  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4242  hypothetical protein  30.59 
 
 		 484 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.514474 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3918  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.44 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4322  hypothetical protein  30.02 
 
 		 435 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.131093 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0002  hypothetical protein  30.83 
 
 		 402 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00393773  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.08 
 
 		 403 aa  143  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2913  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.08 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.018827  normal  0.268848 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.61 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0183804  normal  0.0975853 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1369  putative ParA-like partition protein  30.09 
 
 		 347 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0009  plasmid-partitioning protein SopA  27.75 
 
 		 388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0766545 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6315  plasmid partitioning ATPase ParA  29.19 
 
 		 396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.94 
 
 		 402 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4250  plasmid-partitioning protein SopA  28.57 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.100676 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.17 
 
 		 261 aa  123  7e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0896384  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0007  plasmid-partitioning protein SopA  27.32 
 
 		 391 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0045  plasmid-partitioning protein SopA  27.04 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0073  plasmid-partitioning protein SopA  27.04 
 
 		 391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728582 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0022  plasmid-partitioning protein SopA  27.04 
 
 		 388 aa  121  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.19504  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.91 
 
 		 255 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.27 
 
 		 261 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.63 
 
 		 297 aa  117  5e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.47 
 
 		 253 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  32.55 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4177  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.13 
 
 		 387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.6 
 
 		 309 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  32.11 
 
 		 332 aa  113  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  33.19 
 
 		 327 aa  112  8.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  31.54 
 
 		 253 aa  112  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.73 
 
 		 317 aa  113  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>