More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6317 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  100 
 
 		 405 aa  839    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  78.47 
 
 		 405 aa  666    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  96.05 
 
 		 405 aa  816    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  69.38 
 
 		 408 aa  598  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  62.21 
 
 		 404 aa  522  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5000  replication protein A  62.47 
 
 		 420 aa  518  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  62.37 
 
 		 407 aa  518  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4191  cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.06 
 
 		 420 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.680764 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  62.15 
 
 		 410 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5873  plasmid partitioning protein RepA  59.45 
 
 		 405 aa  491  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128849  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4789  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.84 
 
 		 387 aa  488  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.076168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5377  plasmid partitioning protein RepA  59.6 
 
 		 405 aa  487  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408708  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9001  replication protein A  58.57 
 
 		 399 aa  488  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3561  plasmid partitioning protein RepA  58.82 
 
 		 405 aa  477  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.26 
 
 		 405 aa  477  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6017  plasmid partitioning protein RepA  57.14 
 
 		 398 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0237613  normal  0.19813 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  59.38 
 
 		 397 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  59.11 
 
 		 397 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.33 
 
 		 398 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4671  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.07 
 
 		 397 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7172  plasmid partitioning protein RepA  56.27 
 
 		 398 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300814 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.37 
 
 		 401 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.55 
 
 		 397 aa  466  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  57.52 
 
 		 408 aa  468  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.41 
 
 		 404 aa  464  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7789  plasmid partitioning protein RepA  55.27 
 
 		 405 aa  464  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.45198  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.79 
 
 		 408 aa  460  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0001  putative replication protein A  54.29 
 
 		 408 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  54.21 
 
 		 409 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4023  cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.41 
 
 		 395 aa  449  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03067  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4023  ATPase, ParA type  56.41 
 
 		 392 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.845906  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4186  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  56.04 
 
 		 394 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.04151  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5480  plasmid partitioning protein RepA  52.58 
 
 		 405 aa  438  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8198  replication protein A  51.04 
 
 		 403 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6501  plasmid partitioning protein RepA  54.1 
 
 		 404 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.85 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  51.76 
 
 		 397 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4190  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.75 
 
 		 400 aa  417  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1104  replication protein RepA  51.51 
 
 		 397 aa  411  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000233941  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5912  plasmid partitioning protein RepA  51.65 
 
 		 408 aa  408  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334298  normal  0.0281794 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  49.25 
 
 		 403 aa  405  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  51.15 
 
 		 408 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4689  plasmid partitioning protein RepA  50.51 
 
 		 402 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10454  normal  0.803552 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6054  plasmid partitioning protein RepA  51.54 
 
 		 398 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4456  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.88 
 
 		 398 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4571  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.81 
 
 		 404 aa  385  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  47.01 
 
 		 371 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4711  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.24 
 
 		 404 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6162  plasmid partitioning protein RepA  48.05 
 
 		 404 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.49965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.62 
 
 		 400 aa  330  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.05 
 
 		 391 aa  315  8e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3591  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.03 
 
 		 400 aa  230  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5337  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.34 
 
 		 401 aa  212  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.65 
 
 		 383 aa  210  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5035  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.16 
 
 		 399 aa  202  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3918  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.08 
 
 		 401 aa  193  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3887  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.11 
 
 		 405 aa  193  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6108  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.73 
 
 		 411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1423  ParA family ATPase  31.2 
 
 		 468 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273364  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.2 
 
 		 468 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.770946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3692  hypothetical protein  31.31 
 
 		 468 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.576535  normal  0.38395 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4213  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.63 
 
 		 466 aa  178  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0078  partitioning protein, ParA  29.38 
 
 		 397 aa  178  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  hitchhiker  0.00231687 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0067  plasmid partition protein A  29.92 
 
 		 406 aa  176  5e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7204  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.73 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.442713 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0035  putative protein sopA  29.82 
 
 		 406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3406  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31 
 
 		 487 aa  172  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.798032 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0002  hypothetical protein  28.3 
 
 		 402 aa  169  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00393773  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6315  plasmid partitioning ATPase ParA  32.72 
 
 		 396 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4250  plasmid-partitioning protein SopA  31.98 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.100676 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4265  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.64 
 
 		 462 aa  160  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.383224 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3855  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.65 
 
 		 463 aa  157  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.743489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0009  plasmid-partitioning protein SopA  30.89 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0766545 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3773  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.69 
 
 		 469 aa  153  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0007  plasmid-partitioning protein SopA  31.17 
 
 		 391 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4242  hypothetical protein  28.81 
 
 		 484 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.514474 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4082  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.81 
 
 		 484 aa  152  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.525863  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2913  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.75 
 
 		 434 aa  152  8.999999999999999e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.018827  normal  0.268848 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3840  ATPase, ParA type  28.81 
 
 		 484 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535208  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0073  plasmid-partitioning protein SopA  31.17 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728582 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0045  plasmid-partitioning protein SopA  31.17 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0022  plasmid-partitioning protein SopA  31.17 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.19504  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.53 
 
 		 402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4322  hypothetical protein  30.73 
 
 		 435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.131093 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2483  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  30.73 
 
 		 435 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.111676  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.07 
 
 		 403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4177  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.94 
 
 		 387 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.28 
 
 		 397 aa  137  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0183804  normal  0.0975853 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1369  putative ParA-like partition protein  31.21 
 
 		 347 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3948  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.98 
 
 		 434 aa  123  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0159296  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 253 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.22 
 
 		 287 aa  119  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.18 
 
 		 303 aa  117  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.1 
 
 		 294 aa  115  8.999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.45 
 
 		 312 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.27 
 
 		 257 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.64 
 
 		 253 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.82 
 
 		 299 aa  113  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.03 
 
 		 269 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  31.44 
 
 		 332 aa  113  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.401213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>