More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II1105 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II1105  putative plasmid partition protein  100 
 
 		 407 aa  853    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.316048  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0130  ParA family protein  84.2 
 
 		 407 aa  726    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07049  hypothetical protein  83.7 
 
 		 405 aa  714    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000993  chromosome (plasmid) partitioning protein ParA  83.46 
 
 		 405 aa  716    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0126  putative plasmid partition protein ParA  26.37 
 
 		 401 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.75003e-18 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_40  putative plasmid partition protein A  30.14 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0786785  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4226  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.41 
 
 		 405 aa  126  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4546  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.54 
 
 		 399 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.931063  normal  0.514808 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4451  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.54 
 
 		 399 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.375885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08267  plasmid partition protein ParA  24.14 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4366  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.21 
 
 		 399 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00100758  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0095  plasmid partition protein ParA  27.54 
 
 		 399 aa  123  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5000  replication protein A  27.18 
 
 		 420 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9001  replication protein A  24.35 
 
 		 399 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4191  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.7 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.680764 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5035  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.85 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  26.11 
 
 		 405 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0052  plasmid segregation protein  26.67 
 
 		 399 aa  104  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.91 
 
 		 404 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.03 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5480  plasmid partitioning protein RepA  27.12 
 
 		 405 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6315  plasmid partitioning ATPase ParA  25.33 
 
 		 396 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  26.25 
 
 		 408 aa  99.8  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.34 
 
 		 401 aa  99  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6501  plasmid partitioning protein RepA  25.12 
 
 		 404 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3561  plasmid partitioning protein RepA  24.93 
 
 		 405 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  26.8 
 
 		 409 aa  96.7  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4789  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.13 
 
 		 387 aa  96.3  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.076168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4186  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  25.26 
 
 		 394 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.04151  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.67 
 
 		 408 aa  95.5  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  21.07 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.36 
 
 		 397 aa  95.5  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6017  plasmid partitioning protein RepA  25.06 
 
 		 398 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0237613  normal  0.19813 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.64 
 
 		 398 aa  94.4  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5337  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.72 
 
 		 401 aa  93.6  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.93 
 
 		 405 aa  93.2  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  24.92 
 
 		 405 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.24 
 
 		 407 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  25.25 
 
 		 405 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.74 
 
 		 404 aa  92  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4711  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.51 
 
 		 404 aa  91.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.63 
 
 		 383 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4671  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.97 
 
 		 397 aa  91.3  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4571  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.03 
 
 		 404 aa  90.9  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7172  plasmid partitioning protein RepA  25.06 
 
 		 398 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300814 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1104  replication protein RepA  26.25 
 
 		 397 aa  90.9  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000233941  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  26.25 
 
 		 397 aa  90.9  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  26.62 
 
 		 397 aa  90.1  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  25.97 
 
 		 397 aa  90.1  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4023  ATPase, ParA type  24.5 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.845906  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.9 
 
 		 397 aa  88.6  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0183804  normal  0.0975853 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5912  plasmid partitioning protein RepA  26.89 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334298  normal  0.0281794 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.05 
 
 		 297 aa  87.8  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5377  plasmid partitioning protein RepA  25.42 
 
 		 405 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408708  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.15 
 
 		 410 aa  86.3  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  24.62 
 
 		 408 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3887  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.42 
 
 		 405 aa  86.3  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6054  plasmid partitioning protein RepA  23.82 
 
 		 398 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  27.33 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 		 253 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.14 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  26.15 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5873  plasmid partitioning protein RepA  25.42 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128849  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6108  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.84 
 
 		 411 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  25.42 
 
 		 371 aa  82.8  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0001  putative replication protein A  22.7 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 		 253 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.56 
 
 		 264 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3591  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.9 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.59 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7789  plasmid partitioning protein RepA  24.91 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.45198  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.24 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3692  hypothetical protein  25.68 
 
 		 468 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.576535  normal  0.38395 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.09 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.87 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4694  chromosome segregation ATPase  29.64 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0801275  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.95 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.59 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.96 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.59 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0196  chromosome partitioning protein  27.6 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.59 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4023  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.15 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03067  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  30.96 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2127  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  27.6 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  30.71 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0990  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.15 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37153  normal  0.791697 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.05 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4265  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.99 
 
 		 462 aa  79.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.383224 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.31 
 
 		 468 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.770946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  27.53 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.91 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  26.36 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.92 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1423  ParA family ATPase  25.08 
 
 		 468 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273364  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  26.52 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8198  replication protein A  24.19 
 
 		 403 aa  78.2  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  26.12 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.15 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  27.24 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>